chr1	839741	840250	839788	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	18010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	840753	841210	840812	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	17050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	845485	845678	845582	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17	NA	NA	NA	NA	SAMD11	12582	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.15920538416102
chr1	1008722	1008886	1008828	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	1035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	1070745	1071151	1070944	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	21004	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	1136075	1136463	1136398	Y	HES4,ISG15	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28948	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3C	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3C,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.548215569127418
chr1	2111429	2112079	2111937	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	30080	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.50849113027447
chr1	2135885	2136186	2135927	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	5973	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19791447933581
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.436937260668762
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.537215279504544
chr1	6321567	6321961	6321896	Y	THAP3,THAP3,GPR153	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	2532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	6451759	6451831	6451795	Y	NA	ACOT7,ESPN	NA	NA	NA	NA	ACOT7	620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	334349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	8054249	8054565	8054423	Y	NA	PARK7,ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	29803	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	145536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	170269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	187673	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	387785	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	8721734	8722143	8721896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	153559	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr1	8849339	8849636	8849462	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	26066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr1	10359215	10359483	10359349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF1B	90352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	11791882	11792060	11791938	Y	NA	MAD2L2,AGTRAP	AGTRAP	IMR90	Hi-C	24141950	AGTRAP	2081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	11942925	11943217	11943160	Y	NPPB,MFN2	RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1	CLCN6,MTHFR,NPPB,NPPA,MFN2,PLOD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU5E-1	22992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	RNU5E-1	2301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr1	11990003	11990329	11990105	Y	PLOD1	RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1,MFN2	NA	NA	NA	NA	PLOD1	1933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	12112067	12112502	12112283	Y	MIIP,TNFRSF8	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	8932	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	12227833	12229578	12228095	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	2773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr1	12233600	12234159	12233938	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	8540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	12485613	12485784	12485698	Y	PRAMEF1,AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	189953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	12493313	12493712	12493478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	182025	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19702332478816
chr1	12493910	12494304	12493999	Y	AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	181433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	12508783	12509005	12508873	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	166732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	12533412	12533678	12533545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	142059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	12589452	12589763	12589585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	85974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.42463214453161
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	12614115	12614248	12614183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	61489	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491882118614517
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr1	12717632	12717976	12717808	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	41895	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	13.1696520744706
chr1	14765058	14765382	14765172	Y	NA	NA	KAZN	IMR90	Hi-C	24141950	KAZN	157818	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	78362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510659935452152
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	SPEN	13599	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446994534998318
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr1	16277350	16278224	16277618	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	22403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	38733	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792768035867532
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	39146	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	16489021	16489207	16489116	Y	NA	RP11-276H7.2	CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-276H7.2	9315	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.430050888001654
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-276H7.2	20055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-276H7.2	22826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.327938699324901
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309160882487267
chr1	16770590	16770683	16770636	Y	NA	NECAP2	NA	NA	NA	NA	NECAP2	5423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.16742848864961
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP13A2	104719	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63799073635982
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.764378521974167
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr1	20514084	20514586	20514511	Y	UBXN10	UBXN10,UBXN10-AS1	NA	NA	NA	NA	UBXN10-AS1	3105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482715998832613
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr1	21406931	21406946	21406939	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	8685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	17.229698757588
chr1	21611199	21611583	21611510	Y	EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	58414	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	21724067	21724372	21724186	Y	NA	NBPF3	ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48	IMR90	Hi-C	24141950	NBPF3	40249	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	21965161	21965473	21965377	Y	RAP1GAP	RAP1GAP	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	28328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	22066009	22066225	22066117	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	41874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	22106565	22106957	22106761	Y	NA	USP48	NA	NA	NA	NA	USP48	1142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	22231370	22231630	22231560	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	22233375	22233592	22233478	Y	NA	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.59685052905548
chr1	22235836	22236001	22235899	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	RP11-26H16.1	3245	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr1	22345590	22345859	22345703	Y	ZBTB40,CDC42	LINC00339,CDC42	NA	NA	NA	NA	LINC00339	3822	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	22375194	22375332	22375261	Y	CDC42	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	1788	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF436	55038	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13948455203007
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr1	24581337	24581604	24581474	Y	NA	NA	MYOM3,GRHL3,C1orf201,RCAN3,NIPAL3,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	NIPAL3	158680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	24732584	24732754	24732709	Y	NA	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	7530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	25021969	25022194	25022082	Y	NA	CLIC4	NA	NA	NA	NA	CLIC4	47654	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	25051605	25051987	25051744	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	17861	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	25281668	25281921	25281754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC4	211820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356773790492092
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr1	26319994	26320468	26320326	Y	NA	PAFAH2	NA	NA	NA	NA	PAFAH2	2180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73737760064795
chr1	26528501	26528611	26528568	Y	FAM54B,PDIK1L,HMGN2,CD52	ZNF593,CEP85	NA	NA	NA	NA	CEP85	30080	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	26615016	26615421	26615346	Y	SH3BGRL3,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	11349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	26634832	26635080	26634851	Y	NA	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	CD52	7368	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr1	26642014	26642169	26642069	Y	FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,UBXN11,UBXN11,CD52	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	CD52	279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	26745463	26745863	26745681	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	10194	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.86246055974802
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.82715276788035
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70191844376552
chr1	27021406	27021810	27021509	Y	NA	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73965734776275
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.78664140817179
chr1	27353661	27353962	27353706	Y	TMEM222,MAP3K6,TRNP1	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46B	16334	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04009768774194
chr1	27400779	27401092	27400908	Y	ARID1A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46B	63452	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	27462835	27462988	27462889	Y	ARID1A,PIGV,ZDHHC18,WDTC1,WASF2,FGR,FGR,FGR,SLC9A1	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	28484	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.383329134544483
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	27985869	27985982	27985925	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	28152962	28153213	28153036	Y	NA	PPP1R8,SCARNA1	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	2076	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	28238886	28239222	28239086	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	RPA2	35	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	28431716	28431884	28431798	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	18509	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546826976560274
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	28813874	28814267	28814011	Y	EYA3	RCC1,SNHG3,SNORA73B	NA	NA	NA	NA	RCC1	16188	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr1	29224369	29224479	29224424	Y	EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	12766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	31231730	31232072	31231886	Y	NA	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	3063	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	31238817	31239233	31238883	Y	LAPTM5	LAPTM5	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	LAPTM5	10150	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.910041562445645
chr1	31241795	31242280	31242065	Y	LAPTM5	LAPTM5	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	LAPTM5	13128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83197456906182
chr1	31250426	31250582	31250509	Y	NA	LAPTM5,RP1-65J11.1	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAPTM5	21759	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	31251287	31251533	31251452	Y	NA	LAPTM5,RP1-65J11.1	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAPTM5	22620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.24909149333054
chr1	31251697	31252042	31251870	Y	NA	LAPTM5,RP1-65J11.1	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAPTM5	23030	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	31256585	31256865	31256664	Y	NA	LAPTM5,RP1-65J11.1	MECR,LOC100129196,MATN1,SDC3,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAPTM5	27918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.37241261097448
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555547519068352
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	106986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	SNRNP40	29711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	BAI2	47508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr1	32732571	32732683	32732626	Y	LCK	EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,LCK,HDAC1	NA	NA	NA	NA	LCK	17731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	33284832	33285123	33284978	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	YARS	3078	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	33458800	33459074	33458865	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	30514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	35294449	35294485	35294467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP3	98701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	35309235	35309522	35309475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP3	83664	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	36173458	36173573	36173482	Y	TEKT2,EIF2C1	C1orf216	NA	NA	NA	NA	C1orf216	9500	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr1	36351655	36352020	36351717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	118087	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr1	36397577	36397741	36397665	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	154735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	36428229	36428381	36428320	Y	STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	124095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	121088	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr1	36617554	36617914	36617691	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	1266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.654934383356482
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.946208603553766
chr1	38134422	38134555	38134489	Y	NA	C1orf109,CDCA8	NA	NA	NA	NA	C1orf109	21359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	38465723	38465839	38465779	Y	MTF1,FHL3	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	3439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	38466019	38466413	38466271	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	2865	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	39633654	39634014	39633702	Y	BMP8A	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	88666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	39662647	39663006	39662738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	117659	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.756155417485585
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1,RP1-118J21.5	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	40628781	40629153	40628997	Y	NA	RLF	NA	NA	NA	NA	RLF	3736	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	40841336	40841595	40841379	Y	RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	ZNF643	IMR90	Hi-C	24141950	SMAP2	32814	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	40847285	40847634	40847387	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	38763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	40848967	40849502	40849291	Y	MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	40445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.38681420390447
chr1	40851431	40851768	40851472	Y	CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	42909	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	136331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.62837903930409
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.473104301776883
chr1	43402214	43402581	43402425	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	43426742	43427095	43427089	Y	CLDN19,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4022	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	43524188	43524462	43524346	Y	NA	NA	SLC2A1,FLJ32224,LOC100129924,C1orf50,LEPRE1,ERMAP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A1-AS1	101468	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	44150815	44151139	44150977	Y	ST3GAL3,SLC6A9,IPO13	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	18356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	44380893	44381202	44381004	Y	SLC6A9,B4GALT2,ARTN	RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	RP11-7O11.3	29021	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.494161865729317
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	45057924	45058133	45058042	Y	C1orf228,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM53	80094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	45323747	45323764	45323756	Y	NA	RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	PTCH2	17012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	46955737	46955918	46955906	Y	DMBX1	NA	FAAH,DMBX1,MKNK1	IMR90	Hi-C	24141950	MKNK1	124597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	46986321	46986408	46986365	Y	DMBX1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	94107	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	47690580	47690745	47690639	Y	PDZK1IP1,TAL1	TAL1	NA	NA	NA	NA	TAL1	5147	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	47910443	47910471	47910460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK1	112974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	50799292	50799453	50799422	Y	NA	NA	AGBL4	IMR90	Hi-C	24141950	FAF1	624482	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF11	124050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	51886085	51886464	51886275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	95517	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr1	51986075	51986410	51986173	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	EPS15	3075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	51997947	51998232	51998197	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS15	14947	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	52029722	52030067	52029870	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL9	10784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr1	52238666	52238881	52238774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	103596	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	52341008	52341095	52341052	Y	CC2D1B,OSBPL9	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	1382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	52796099	52796229	52796164	Y	NA	CC2D1B	NA	NA	NA	NA	CC2D1B	33636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr1	53369161	53369511	53369336	Y	SCP2,ECHDC2	SCP2	NA	NA	NA	NA	SCP2	21390	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	54695028	54695502	54695289	Y	NA	MRPL37,CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	31319	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	54739679	54739787	54739710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	75970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr1	54875187	54875373	54875227	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	1779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.938431076339009
chr1	55327144	55327486	55327453	Y	NA	RP11-67L3.5,DHCR24	NA	NA	NA	NA	RP11-67L3.5	23062	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	55506956	55507037	55506997	Y	NA	PCSK9	NA	NA	NA	NA	PCSK9	3735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	55677745	55677788	55677767	Y	NA	USP24	NA	NA	NA	NA	USP24	998	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	61478973	61479215	61479105	Y	NFIA	NA	NFIA	IMR90	Hi-C	24141950	NFIA	150042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	61516303	61516687	61516329	Y	NA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	187372	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382437979996831
chr1	61517483	61517553	61517518	Y	NA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	188552	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-833A20.1	173305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-833A20.1	137543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-833A20.1	66877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	61768031	61768305	61768169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-833A20.1	50849	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-833A20.1	201637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	65510370	65510451	65510413	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	20969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	65517662	65517702	65517682	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	13718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	65758796	65759173	65758995	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	46894	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	65775838	65775991	65775933	Y	PDE4B,DNAJC6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	63936	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456160654780222
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557827266183151
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.420439190945926
chr1	65924548	65924883	65924716	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	40278	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr1	65946125	65946479	65946302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	61855	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr1	65946781	65947169	65947001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	62511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	9.53636273850916
chr1	66173812	66174180	66173996	Y	NA	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	LEPROT	289542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	67494221	67494361	67494358	Y	SLC35D1,MIER1	SLC35D1	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	23421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	67692333	67692744	67692443	Y	WDR78,IL23R	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	174551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	67883059	67883215	67883204	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	10883	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	68000341	68000585	68000456	Y	SLC35D1	NA	GNG12,DIRAS3,LOC100289178,GADD45A,WLS	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERBP1	106243	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	68166463	68166766	68166597	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	17719	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.473104301776883
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	LRRC7	NA	NA	NA	NA	LRRC7	14453	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.57144864650261
chr1	70507902	70508588	70508230	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	160715	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr1	70806613	70806974	70806794	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	11443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	75445957	75446239	75446083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZ	248865	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	75683161	75683232	75683197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZ	486069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	76197113	76197244	76197179	Y	NA	ACADM	NA	NA	NA	NA	ACADM	9077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	76250721	76250813	76250769	Y	ACADM,RABGGTB	RABGGTB,SNORD45A,MSH4	NA	NA	NA	NA	SNORD45A	761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	94366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	78469106	78469287	78469191	Y	DNAJB4	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	26247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293108390038257
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	772913	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	81968642	81968976	81968811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	216402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	85143846	85143980	85143979	Y	SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP	RP11-484D4.3,SSX2IP	NA	NA	NA	NA	SSX2IP	10506	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	85248638	85248992	85248815	Y	NA	NA	GNG5,MCOLN2,TTLL7,LPAR3,PRKACB	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	94152	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	87359712	87359873	87359793	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	18234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354494043377293
chr1	88289775	88289792	88289784	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	497624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	88292387	88292883	88292561	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	500236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.801488578375611
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	90022562	90022945	90022840	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	34167	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	90101821	90102213	90101853	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	5190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	90167657	90167773	90167712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	71026	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr1	90374317	90375036	90374524	Y	LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	82844	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	91183313	91183764	91183661	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	131443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	186435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	171452	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.945763026279941
chr1	92781340	92781526	92781459	Y	TGFBR3,RPAP2	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	GLMN	18796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	93270252	93270588	93270467	Y	NA	EVI5,RPL5	EVI5	IMR90	Hi-C	24141950	EVI5	14291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	94371317	94371601	94371445	Y	NA	DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	GCLM	1365	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr1	95604801	95605035	95604918	Y	TMEM56,TMEM56-RWDD3	TMEM56	NA	NA	NA	NA	TMEM56	23907	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr1	100113534	100114036	100113879	Y	AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	4035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	100169951	100170218	100170031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	59969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	100828525	100828922	100828611	Y	SASS6	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	19941	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	13.3399278382392
chr1	100918231	100918546	100918401	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	109647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	101469727	101469819	101469773	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	19615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	101774729	101775525	101775307	Y	S1PR1	NA	NA	NA	NA	NA	DPH5	285085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	103126263	103126396	103126338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-556K13.1	874204	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.06646976147237
chr1	108870455	108870699	108870577	Y	NA	NA	SLC25A24	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC25A24	128984	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	109127044	109127234	109127073	Y	STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	26333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	109156863	109156955	109156909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM102B	56152	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	109802696	109802890	109802772	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1,MYBPHL	NA	NA	NA	NA	CELSR2	12055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	109841804	109842152	109841978	Y	SORT1	PSRC1,MYBPHL	NA	NA	NA	NA	MYBPHL	5511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	110320163	110320291	110320225	Y	NA	GSTM3	CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	37779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	110335775	110336041	110335953	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,FAM40A,AHCYL1,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	53391	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	110364881	110365302	110365225	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	82497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	110366477	110366702	110366587	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	84093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	110438276	110438910	110438607	Y	NA	CSF1	CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,GNAI3,GSTM4,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	CSF1	11954	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.46831440590262
chr1	110879130	110879445	110879277	Y	CSF1	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	2	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	4371	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	111996023	111996307	111996190	Y	NA	OVGP1,ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	6025	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	112163412	112163797	112163622	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80572	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	112196411	112196803	112196596	Y	C1orf183,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	DDX20	99064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	113683682	113683919	113683753	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	25697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	113734243	113734639	113734494	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24627	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	113949729	113949849	113949733	Y	NA	MAGI3,RP11-512F24.1	NA	NA	NA	NA	MAGI3	18358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	114258659	114258989	114258824	Y	NA	PHTF1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	41122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	114997819	114998047	114997990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	53734	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.527603582448813
chr1	116191587	116191760	116191750	Y	NA	VANGL1	NA	NA	NA	NA	VANGL1	9013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	116192575	116192950	116192828	Y	NA	VANGL1	NA	NA	NA	NA	VANGL1	10001	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	117047053	117047428	117047164	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	64233	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr1	117081238	117081452	117081381	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	30209	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	117082797	117083071	117083005	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	28590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	117111804	117112156	117112090	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	143	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	117112460	117112738	117112567	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	117367696	117367920	117367797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P22	51451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	117368438	117368774	117368618	Y	NA	NA	PTGFRN	K562	ChIA-PET	22265404	FTH1P22	52193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.766212691815139
chr1	118197868	118198044	118197956	Y	NA	NA	FAM46C	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46C	51312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	118206889	118207267	118207172	Y	MAN1A2	NA	FAM46C	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46C	60333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.683323897249846
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	117473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	144987154	144987391	144987382	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	86795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	80942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.41153537811589
chr1	145004446	145004804	145004625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	69382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	145009158	145009716	145009503	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	64470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	145058996	145059322	145059204	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	14864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,HFE2,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HFE2	13897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr1	145437595	145437817	145437681	Y	CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A	HFE2,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	1126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	HFE2,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491882118614517
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.02980528234476
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	195813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.591714560176473
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	1997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354939620651119
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	TNFAIP8L2,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	TNFAIP8L2,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	RP11-126K1.2	3391	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	151344220	151344519	151344431	Y	NA	PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4	NA	NA	NA	NA	SELENBP1	1011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	97808	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	S100A6,S100A5,S100A4	NA	NA	NA	NA	S100A5	1187	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,INTS3	NA	NA	NA	NA	INTS3	27531	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.455715077506396
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	154986150	154986272	154986211	Y	NA	SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	13023	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.62175497358885
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	155944562	155945214	155944815	Y	C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	NA	NA	NA	NA	ARHGEF2	29647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	156464458	156464805	156464586	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	3815	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr1	156478154	156478558	156478328	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	9534	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482715998832613
chr1	156631732	156631960	156631846	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	2516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	156632199	156632473	156632320	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	2983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	156662788	156663099	156662881	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	BCAN,NES	IMR90	Hi-C	24141950	CRABP2	10509	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	156663993	156664153	156664073	Y	TMEM79,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	NA	NA	NA	NA	CRABP2	9455	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	156677217	156677612	156677436	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	3609	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	156864713	156865066	156864817	Y	PEAR1	INSRR,PEAR1	NA	NA	NA	NA	PEAR1	3223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	157030350	157030742	157030546	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	17188	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	157243184	157243536	157243323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	136918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr1	157244599	157245063	157244641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	138333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr1	157245880	157246130	157246005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	139614	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	157248443	157248858	157248567	Y	FCRL3	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	142177	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	157249264	157249609	157249447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	142998	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	157966753	157967127	157966789	Y	NA	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	5690	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	158117571	158117948	158117758	Y	OR10X1,OR10R2	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL	156508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	NA	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	KIRREL	158437	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL	185636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336161803813485
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	160510042	160510238	160510216	Y	DCAF8,SLAMF1,CD48,SLAMF6	SLAMF6,CD84	NA	NA	NA	NA	SLAMF6	18990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr1	160546217	160546501	160546436	Y	ATP1A4,SLAMF7,CD48,CD244,CD84	CD84	NA	NA	NA	NA	CD84	805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD84	92522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	CD84	148775	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.674157777467942
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,USF1,ARHGAP30	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	161177017	161177202	161177106	Y	HSPA6,ADAMTS4,APOA2	USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,FCER1G,APOA2,TOMM40L	NA	NA	NA	NA	FCER1G	5822	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.948042773394738
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.90480608929756
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	FCGR2A,HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	8572	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	161502624	161502920	161502837	Y	ADAMTS4,PCP4L1,C1orf192,OLFML2B	FCGR2A,HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	10588	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA6	90176	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr1	161591982	161592107	161592045	Y	FCGR2A,FCGR3A,FCGR3B	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLA	82655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	162458137	162458480	162458371	Y	NOS1AP,NOS1AP	UHMK1	NOS1AP,ATF6,C1orf226,SH2D1B,DDR2	IMR90	Hi-C	24141950	UHMK1	6561	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	162511455	162511984	162511719	Y	UAP1,UHMK1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	17339	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.539049449345515
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773544641756071
chr1	167192959	167193266	167193111	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	4893	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	167520671	167521013	167520898	Y	CREG1	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	167586596	167587245	167587123	Y	POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1	RCSD1	RCSD1	IMR90	Hi-C	24141950	RCSD1	10085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.28682566790481
chr1	167602083	167602470	167602201	Y	POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1	RCSD1	NA	NA	NA	NA	RCSD1	4753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	167650955	167651264	167651178	Y	POU2F1,RCSD1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	37165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	169911234	169911623	169911565	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	49826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	172606833	172606931	172606882	Y	FASLG,C1orf9	NA	C1orf9,FASLG	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	195603	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	172631926	172632270	172632095	Y	C1orf9,C1orf9,FASLG	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	220696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	172903010	172903534	172903241	Y	TNFSF18,TNFSF4	NA	TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	114569	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	173398914	173399297	173399234	Y	NA	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	45108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254661601815337
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	176174471	176174980	176174673	Y	RFWD2	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2,RP11-195C7.1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	178901109	178901308	178901215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20B	91631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	179296885	179297079	179297006	Y	AXDND1,TOR3A,ABL2,SOAT1	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	35960	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	180554738	180554883	180554800	Y	MR1	XPR1	XPR1,ACBD6	IMR90	Hi-C	24141950	XPR1	44257	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr1	180580561	180580926	180580744	Y	IER5	XPR1	XPR1,ACBD6	K562	ChIA-PET	22265404	XPR1	18214	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	181097947	181098672	181098524	Y	MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	42309	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.8118600204027
chr1	182116340	182116866	182116523	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	242475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	182118170	182119053	182118696	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	240288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	182162175	182162397	182162293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLUL	196944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	182228341	182228499	182228429	Y	NA	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	182228543	182228906	182228715	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	182248717	182248735	182248728	Y	NA	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	110606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	182269466	182269764	182269615	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	89577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	182682922	182683008	182682965	Y	DHX9	NA	RGS8,RNASEL	IMR90	Hi-C	24141950	NPL	73420	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	184005350	184005919	184005662	Y	RGL1,GLT25D2	TSEN15	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	12892	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	185297372	185297765	185297602	Y	FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	12911	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	186935248	186935528	186935344	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	592358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	187267139	187267250	187267195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	924249	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	187268687	187268975	187268831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	925797	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS1	326281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	192835441	192835683	192835578	Y	RGS1,RGS13	RN7SKP126	NA	NA	NA	NA	RN7SKP126	7432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	192924608	192924823	192924716	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP126	81493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr1	193226500	193227132	193226836	Y	RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	137353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	194828218	194828283	194828245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	1739071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.146816501971
chr1	196687933	196688159	196688046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	68925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	196778400	196778793	196778592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	159392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf53	95117	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.35939488118868
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399827204267319
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	198526099	198526320	198526230	Y	PTPRC	RP11-553K8.2	NA	NA	NA	NA	RP11-553K8.2	39678	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	198603022	198603333	198603191	Y	PTPRC	RP11-553K8.2,PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	2468	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	198625518	198626374	198625745	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	19717	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	45129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	200611653	200611882	200611754	Y	DDX59	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	KIF14	23791	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	200865264	200865418	200865332	Y	C1orf106,C1orf106	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21B	125410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-134G8.7	24547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	201717986	201718364	201718179	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	77905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	201904072	201904465	201904341	Y	CSRP1,CSRP1,CSRP1,LGR6,LMOD1	SHISA4,LMOD1,TIMM17A,RNPEP	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	LMOD1	9250	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	202131734	202131905	202131820	Y	PTPN7,PTPN7	ARL8A,PTPN7	NA	NA	NA	NA	PTPN7	3018	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	202132024	202132258	202132104	Y	PTPN7,PTPN7	ARL8A,PTPN7	NA	NA	NA	NA	PTPN7	3308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr1	202217450	202217807	202217629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN7	88734	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	RP11-134P9.3	5149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	203294160	203294623	203294393	Y	RABIF,KLHL12,BTG2	RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	21541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	203561987	203562359	203562082	Y	BTG2,ZC3H11A	ATP2B4	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	31330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	203643182	203643803	203643474	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	49493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	203661733	203662076	203661795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	68044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	204675739	204675945	204675909	Y	NA	NA	LRRN2,NFASC	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MDM4	192228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08270552424334
chr1	204684045	204684323	204684297	Y	NA	NA	NFASC,LRRN2	IMR90	Hi-C	24141950	MDM4	200534	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	206736469	206736632	206736474	Y	NA	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	RP11-534L20.4	36221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363660163159197
chr1	206748926	206749451	206749084	Y	IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	34453	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	206879935	206880172	206880039	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	23646	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	206890641	206891001	206890773	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	34352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	206939730	206940044	206939954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	83441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	207203424	207203586	207203506	Y	C1orf116	C1orf116,PFKFB2,YOD1	NA	NA	NA	NA	C1orf116	515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	207823430	207823599	207823565	Y	CR1L	CR1L	NA	NA	NA	NA	CR1L	6972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr1	207921430	207921703	207921565	Y	CR1L	CD46	CR1L	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	1699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.473104301776883
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	208028503	208028730	208028615	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	11765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291274220197285
chr1	208387951	208388224	208388088	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	27441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	211780151	211780642	211780410	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1	K562	ChIA-PET	22265404	SLC30A1	30067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.782710761537976
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC30A1	36683	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	NEK2,RP11-122M14.1	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	212182782	212182853	212182818	Y	NA	INTS7,DTL,RPL21P28	NA	NA	NA	NA	INTS7	24031	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	212256975	212257253	212257095	Y	DTL,INTS7	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	33604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	212291571	212291809	212291658	Y	PPP2R5A	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	68200	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	212311960	212312104	212312056	Y	PPP2R5A	NA	PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL21P28	88589	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.46857671285449
chr1	212864843	212865470	212865177	Y	BATF3	BATF3	NA	NA	NA	NA	BATF3	5857	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	214926316	214926334	214926325	Y	NA	NA	CENPF,KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	115743	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	215164018	215164287	215164098	Y	NA	NA	KCNK2,CENPF,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	121941	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	218847947	218848245	218848113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	330370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	219262446	219262621	219262479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	82565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	219321072	219321456	219321264	Y	NA	LYPLAL1	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	23730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	221209079	221209530	221209425	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	159380	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	221887766	221888016	221887890	Y	DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	25502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	223326849	223326980	223326946	Y	NA	TLR5	TLR5,SUSD4,CAPN8	IMR90	Hi-C	24141950	TLR5	12225	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.55031875416534
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	224690718	224691054	224690869	Y	WDR26	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	67983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	226187685	226188168	226187763	Y	TMEM63A,H3F3A,C1orf55	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3A	59384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	226189681	226190319	226189910	Y	H3F3A,C1orf55	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3A	57233	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	226190534	226190731	226190643	Y	H3F3A,C1orf55	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3A	56821	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.68287831997602
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	226366367	226366621	226366494	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	5810	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	226430284	226430401	226430343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	57853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.70210171408748
chr1	227315962	227315970	227315966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	188205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	228274281	228274680	228274319	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5920	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	228651177	228651630	228651444	Y	HIST3H2A,HIST3H2BB	HIST3H3,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	RNF187	IMR90	Hi-C	24141950	HIST3H2BB	7369	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	228688608	228688902	228688729	Y	HIST3H2A	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	15846	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr1	229692979	229693368	229693287	Y	NUP133,TAF5L,ABCB10	ABCB10	NA	NA	NA	NA	ABCB10	537	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	229825145	229825279	229825212	Y	NA	NA	TAF5L,URB2,GALNT2,PGBD5	IMR90	Hi-C	24141950	URB2	65164	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	230279464	230279771	230279510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	87928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	230282048	230282189	230282138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	90512	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	231531776	231531955	231531804	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	26835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	233763307	233763375	233763341	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	234250535	234250574	234250556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	211856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	234254353	234254647	234254499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	215674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	234548581	234548830	234548706	Y	NA	RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	41242	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	234680207	234680593	234680360	Y	NA	NA	LOC100506795,IRF2BP2	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	62678	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	234681324	234681701	234681573	Y	NA	NA	LOC100506795,IRF2BP2	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	61570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	NA	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	68796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	164880	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	234978594	234979177	234979101	Y	IRF2BP2	NA	LINC00184,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	235323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	235010375	235010572	235010492	Y	ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,TOMM20,RBM34	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	267104	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	235096560	235096855	235096619	Y	ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	193396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	178848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TOMM20	43394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr1	235644219	235644255	235644237	Y	NA	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	21526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr1	235927486	235927702	235927520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYST	117238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465326774562126
chr1	236579529	236579860	236579770	Y	MTR,LGALS8,EDARADD	NA	NA	NA	NA	NA	ENO1P1	64605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P1	491614	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264273298871067
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	241297873	241298260	241298234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	137779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	241392345	241392701	241392526	Y	RGS7,KMO	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	232251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	242686520	242686699	242686610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXO1	677251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	243487001	243487352	243487082	Y	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	69681	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	243584021	243584680	243584353	Y	CEP170,SDCCAG8,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	166701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	401492	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	244466323	244466598	244466461	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADSS	146838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr1	245057262	245057513	245057307	Y	NA	HNRNPU-AS1,HNRNPU	EFCAB2,HNRNPU,C1orf101,COX20,SMYD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPU	31418	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr1	245082176	245082355	245082237	Y	EFCAB2	EFCAB2	SMYD3,EFCAB2,C1orf101,HNRNPU,PPPDE1,COX20	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EFCAB2	48652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.674157777467942
chr1	245255337	245255432	245255385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	124330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	245939665	245940062	245939864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	728552	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	245958364	245958743	245958685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	709871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	697228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr1	246007613	246007922	246007768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	660692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	246042512	246042669	246042578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	625945	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254661601815337
chr1	246129057	246129404	246129358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	539210	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	246249452	246249819	246249636	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	418795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	246317158	246317459	246317368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351155	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	246323685	246324051	246324002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	344563	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	246588477	246588670	246588563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	79944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr1	246730569	246731007	246730621	Y	AHCTF1,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	2823	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr1	246732690	246733040	246732711	Y	SMYD3,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	4944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.538158294797864
chr1	246743297	246743408	246743371	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	15551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr1	246749077	246749442	246749258	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	21331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr1	246763574	246763751	246763579	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	35828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr1	246772310	246772610	246772421	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	44564	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr1	248018586	248018745	248018671	Y	OR2W3,TRIM58	TRIM58	NA	NA	NA	NA	TRIM58	85	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792768035867532
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr10	903940	904213	904109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP4B	71351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	1112826	1113160	1112997	Y	WDR37	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	19348	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	3441336	3441600	3441518	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	228333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	3497590	3497951	3497729	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	284587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	3845999	3846426	3846282	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	20526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	3846443	3847038	3846804	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	20970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	3852273	3852886	3852712	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	26800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	121038	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	TUBAL3	110581	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	5504427	5504665	5504478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	51913	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr10	5520306	5520476	5520373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	67792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13859339748241
chr10	5521591	5521814	5521622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	69077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.5219225320269
chr10	5528772	5529321	5529050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	76258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3286465835506
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.7	73624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	6017924	6018316	6018090	Y	RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,IL15RA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	6051095	6051553	6051345	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	IL15RA	NA	NA	NA	NA	IL15RA	32945	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	6193132	6193393	6193272	Y	GDI2,IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	8251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	6193489	6193806	6193647	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	8608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	6600320	6600578	6600409	Y	RBM17,RBM17,PRKCQ	PRKCQ,PRKCQ-AS1	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	19685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	7227327	7227801	7227548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	600189	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	7228549	7229134	7228725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	598856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	465640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	375244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr10	11205067	11205773	11205317	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	159808	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	11937332	11937570	11937451	Y	UPF2,UPF2	PROSER2-AS1	NA	NA	NA	NA	PROSER2-AS1	2633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	11940492	11940889	11940732	Y	NA	PROSER2-AS1	NA	NA	NA	NA	PROSER2-AS1	5793	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.07092502200993
chr10	12958424	12958724	12958629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	180725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	13747807	13748143	13748006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	120880	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr10	14064122	14064423	14064398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	437195	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	15157630	15158203	15157954	Y	NA	ACBD7,RPP38	NA	NA	NA	NA	RPP38	20451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	15481671	15481810	15481693	Y	NA	NA	ITGA8,FAM188A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM171A1	70610	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr10	17071536	17072103	17071684	Y	VIM,TRDMT1	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	169950	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	17384125	17384326	17384225	Y	VIM	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	42609	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	17456684	17457055	17456726	Y	NA	ST8SIA6-AS1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	29749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.48410459139976
chr10	17467799	17468377	17468085	Y	STAM,ST8SIA6	ST8SIA6-AS1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6	25952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr10	17470783	17471060	17470983	Y	TRDMT1,STAM,ST8SIA6	ST8SIA6-AS1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6	23269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.782710761537976
chr10	17548531	17548697	17548633	Y	ST8SIA6	NA	CUBN	IMR90	Hi-C	24141950	ST8SIA6	54202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.64969891020839
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	21317807	21317920	21317859	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	143196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510214358178326
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	22519481	22519667	22519580	Y	BMI1,EBLN1	NA	COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	83236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr10	22904639	22904845	22904818	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	96639	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	22920592	22920972	22920839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	80512	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	22972039	22972536	22972328	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	28948	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	23344774	23344811	23344800	Y	NA	MSRB2	NA	NA	NA	NA	MSRB2	37624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.58419933991358
chr10	23569380	23569726	23569528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRB2	186945	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	24740338	24740618	24740546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	269979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	24858253	24858468	24858359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	152129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr10	24996902	24997348	24997071	Y	NA	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	13249	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	25190845	25191315	25190947	Y	NA	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	48218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.5766841196507
chr10	25247749	25247926	25247838	Y	ARHGAP21,GPR158	PRTFDC1	THNSL1,ENKUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRTFDC1	8216	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	25348919	25349256	25349121	Y	NA	THNSL1	ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THNSL1	45332	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	209028	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	26827838	26827901	26827870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	156687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	26954218	26954614	26954569	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	29974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	27027283	27027887	27027754	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42695	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	27814920	27815352	27814981	Y	MASTL,ACBD5,RAB18	RAB18	NA	NA	NA	NA	RAB18	23723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	29766430	29766710	29766570	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	70099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	29948331	29948643	29948337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	252000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	30791299	30791558	30791362	Y	ZNF438,MAP3K8	NA	MAP3K8,LOC729668	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	70433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	30841226	30841478	30841347	Y	NA	NA	MAP3K8,LOC729668	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP3K8	120360	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr10	30842081	30842302	30842110	Y	NA	NA	MAP3K8,LOC729668,KIAA1462,MTPAP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP3K8	121215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	32215994	32216410	32215998	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	252	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	32316515	32316560	32316538	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	26799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	32611846	32612286	32612204	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	53440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	32668626	32668988	32668673	Y	EPC1,C10orf68	EPC1	EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	EPC1	2900	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.29247954244248
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	ITGB1	NA	NA	NA	NA	ITGB1	41416	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	34569605	34569879	34569742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	381150	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	35059349	35059608	35059479	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	42645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	35640077	35640405	35640144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	106124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	35668149	35668482	35668241	Y	CREM,CREM	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	134196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr10	35755393	35755512	35755453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	221440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	35848460	35848836	35848737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	314507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	43249248	43249682	43249506	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26567	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	43471158	43471309	43471213	Y	NA	NA	RET	MCF7	ChIA-PET	22265404	CSGALNACT2	160625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	48279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.811100275431341
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	44185196	44185271	44185205	Y	NA	ZNF32,UQCRHP3	NA	NA	NA	NA	UQCRHP3	40511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	44185624	44185942	44185694	Y	NA	ZNF32,UQCRHP3	NA	NA	NA	NA	UQCRHP3	39840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	44806540	44806774	44806646	Y	NA	NA	TMEM72-AS1,LOC100506835,ZNF32-AS3,RASSF4,ZNF32,C10orf136,LOC283033,CXCL12	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA3P1	522675	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	45868742	45869084	45868822	Y	ANUBL1,OR13A1,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	1081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	45871674	45871974	45871739	Y	FAM21C,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	4013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF488	696953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr10	49678205	49678472	49678354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	165507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.43031319495353
chr10	50382507	50382686	50382541	Y	C10orf128	C10orf128	NA	NA	NA	NA	C10orf128	11944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	50385443	50385844	50385615	Y	C10orf128	C10orf128	NA	NA	NA	NA	C10orf128	8786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	50391668	50392044	50391903	Y	C10orf128	C10orf128	NA	NA	NA	NA	C10orf128	2586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.84637616199181
chr10	50392979	50393162	50393101	Y	NA	C10orf128	NA	NA	NA	NA	C10orf128	1468	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	50394805	50395182	50394897	Y	C10orf128	C10orf128	NA	NA	NA	NA	C10orf128	175	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	50508434	50508798	50508651	Y	C10orf71	C10orf71	NA	NA	NA	NA	C10orf71	3247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17381742329722
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	52079574	52079882	52079666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	56836	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	52081951	52082279	52082036	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	52082649	52082859	52082782	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59911	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	52083762	52084193	52084054	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	61024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	52085013	52085461	52085351	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	62275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.96873379670326
chr10	52092316	52092324	52092320	Y	FAM21A,SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	69578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr10	52154516	52154956	52154688	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	131778	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	52300578	52300747	52300601	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	82176	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	61664562	61664999	61664893	Y	CCDC6	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	63540272	63540417	63540346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	118642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	63571912	63572045	63571979	Y	TMEM26	NA	ARID5B,C10orf107,RHOBTB1	IMR90	Hi-C	24141950	ARID5B	87014	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.655379960630307
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293108390038257
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	65097775	65098183	65098051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	86874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	65226977	65227255	65227116	Y	NA	PRELID1P3,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	3255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr10	65467084	65467405	65467282	Y	JMJD1C	NA	JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	187961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.58349145568789
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr10	69621525	69621936	69621738	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1,MYPN,HERC4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIRT1	20491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.957208893176642
chr10	71283312	71283690	71283502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN15	74083	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	71386629	71386882	71386756	Y	NA	C10orf35	NA	NA	NA	NA	C10orf35	1125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	72416244	72416577	72416419	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS14	13982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	72424506	72424875	72424691	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	KIAA1274,PRF1,ADAMTS14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADAMTS14	5684	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	72433363	72433696	72433541	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	NA	NA	NA	NA	ADAMTS14	2804	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	72502385	72502568	72502493	Y	SGPL1	NA	NA	NA	NA	NA	SGPL1	71149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.02176544817813
chr10	73313455	73313899	73313820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	217356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	73398011	73398245	73398040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	133010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73737760064795
chr10	73398541	73398855	73398667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	132400	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372826282941101
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	73605642	73606023	73605974	Y	DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	NA	NA	NA	NA	PSAP	3103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636156566518847
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.992930357010939
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.675991947308915
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	74765472	74765512	74765492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P4HA1	89220	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	74877758	74878048	74877901	Y	NA	P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	NUDT13	9541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr10	75253773	75253975	75253905	Y	NA	RP11-137L10.6	NA	NA	NA	NA	PPP3CB	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	75716399	75716797	75716501	Y	FUT11,NDST2	PLAU,VCL	CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VCL	39075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	76682814	76683108	76682864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6B	99474	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	76916394	76916800	76916595	Y	MYST4,SAMD8	DUSP13	NA	NA	NA	NA	DUSP13	49415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA1P5	130694	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	79596032	79596523	79596221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	87855	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr10	79731077	79731252	79731165	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	46699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	80062995	80063366	80063293	Y	NA	NA	ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	271477	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.702547291361305
chr10	80897644	80897901	80897807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	70852	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr10	80944867	80945213	80944956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	118075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	81028676	81029041	81028720	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	76184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	81083033	81083464	81083190	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	21761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	82224459	82224735	82224582	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	12537	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	82253401	82253904	82253623	Y	NA	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	39794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	34918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr10	82296466	82296516	82296492	Y	NA	RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	2768	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	82509932	82510235	82510106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	216234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	85324845	85324972	85324948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	514213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	87752944	87753321	87753210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPAL	526251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAPAL	274790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546381399286447
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	88713984	88714363	88714198	Y	SNCG	SNCG,MMRN2	NA	NA	NA	NA	SNCG	2012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456160654780222
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	89864117	89864277	89864218	Y	NA	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	160858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	90844295	90844413	90844369	Y	NA	NA	FAS,LIPA,CH25H	IMR90	Hi-C	24141950	RNLS	502008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.572936743338839
chr10	93367671	93367850	93367762	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	22961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00254205406667
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	13521	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.21964802220674
chr10	94516915	94517155	94517045	Y	HHEX,EXOC6	NA	EXOC6,KIF11,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHEX	70970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.02087429363048
chr10	94520397	94520594	94520523	Y	NA	NA	EXOC6,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOC6	68341	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	94831659	94831948	94831694	Y	CYP26A1,CYP26A1	CYP26A1	NA	NA	NA	NA	CYP26A1	427	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1019289183548
chr10	95675431	95675709	95675545	Y	NA	SLC35G1	NA	NA	NA	NA	SLC35G1	23701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr10	97218383	97218641	97218563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	100530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	97687985	97688127	97688056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNJ	113024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	98638142	98638499	98638253	Y	NA	LCOR	NA	NA	NA	NA	LCOR	48125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	99167112	99167183	99167148	Y	NA	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1,RRP12	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RRP12	7985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	99174702	99174858	99174830	Y	ZFYVE27,PI4K2A,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	RRP12	K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr10	99408797	99409067	99408957	Y	NA	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	17453	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr10	100120877	100121283	100120897	Y	PYROXD2,LOXL4	NA	PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PYROXD2	51658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	101944283	101944461	101944347	Y	DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1	ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6	NA	NA	NA	NA	ERLIN1	1630	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	103051353	103051800	103051498	Y	NA	NA	BTRC,FLJ41350,FBXW4,LBX1,POLL,DPCD,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8,LOC100289509	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	60020	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	103575139	103575373	103575256	Y	NA	NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	1323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	103591495	103591519	103591507	Y	BTRC,KCNIP2,KCNIP2	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	14799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	104196250	104196338	104196269	Y	NA	NFKB2,FBXL15,PSD,CUEDC2,C10orf95,TMEM180	NA	NA	NA	NA	CUEDC2	5832	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.11064946086288
chr10	104238092	104238376	104238328	Y	NA	CUEDC2,C10orf95,TMEM180,ACTR1A,SUFU	NA	NA	NA	NA	TMEM180	18943	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	104364219	104364413	104364273	Y	NA	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	37840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11591683931817
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	104683249	104683568	104683410	Y	NA	CNNM2	NA	NA	NA	NA	CNNM2	7199	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	105230970	105231363	105231243	Y	NT5C2,CALHM2	NA	CALHM2,PDCD11,CALHM1,USMG5	IMR90	Hi-C	24141950	PDCD11	76565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	105378585	105378932	105378690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD11	224180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	105451160	105451473	105451219	Y	INA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	224490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	105452274	105452407	105452303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	223556	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	219421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr10	105725440	105725838	105725745	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	SLK	481	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr10	106085298	106085504	106085412	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	10658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	108512830	108513223	108513027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC147-AS1	2401497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	108691191	108691511	108691422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC147-AS1	2579858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	108702155	108702347	108702207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC147-AS1	2590822	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr10	108757582	108757742	108757678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC147-AS1	2646249	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	111741959	111742119	111742035	Y	MXI1,ADD3	ADD3	NA	NA	NA	NA	ADD3	12007	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347162093436361
chr10	111834173	111834352	111834276	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	80047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	111981639	111982026	111981734	Y	ADD3,MXI1,MXI1	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	16276	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	RBM20	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	RBM20	30103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	116582671	116583074	116582920	Y	NA	FAM160B1	NA	NA	NA	NA	FAM160B1	3168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	169474	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	119021882	119022152	119021944	Y	NA	RP11-501J20.5	NA	NA	NA	NA	RP11-501J20.5	22448	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	RP11-501J20.5	NA	NA	NA	NA	RP11-501J20.5	46900	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	119107774	119108099	119107936	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr10	119113606	119113787	119113696	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	19191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	120242508	120242736	120242622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM204A	142668	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	94093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	129045	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr10	121503034	121503182	121503110	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	94152	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	122963331	122963557	122963437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	72094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	123526019	123526096	123526058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	159731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	123626359	123626403	123626376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	59424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	NSMCE4A	90073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	122137	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	124636899	124637143	124637021	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	14	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	126329186	126329692	126329619	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	101146	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	126336359	126336702	126336537	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	94136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	126337254	126337585	126337480	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	93253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	126338756	126339243	126338968	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	91595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	126377488	126377718	126377625	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	53120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	126397729	126397974	126397834	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	32864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr10	127885539	127885886	127885833	Y	NA	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	302431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13903897475624
chr10	128351863	128352142	128352116	Y	NA	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	768755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	129851192	129851341	129851267	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	71308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr10	130324634	130324907	130324771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	401985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PWWP2B	26035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.14820509453814
chr10	134364689	134365427	134365071	Y	INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	15365	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr10	134368659	134369026	134368959	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	19335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510659935452152
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	135048867	135049308	135048949	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8	NA	NA	NA	NA	ADAM8	39064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347162093436361
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	13224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	4064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr10	135118820	135119258	135118896	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	721	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	268826	269269	268945	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	RP11-326C3.2	16036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	RP11-326C3.2	15402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	312288	312763	312359	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,ATHL1,IFITM2,IFITM1	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3	NA	NA	NA	NA	IFITM1	782	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr11	334344	334553	334421	Y	NA	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8807	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	16705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	353403	353830	353519	Y	CEND1,B4GALNT4	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	13966	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.995210104125736
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	IRF7	NA	NA	NA	NA	IRF7	15193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	813578	813760	813591	Y	NA	PDDC1,AP006621.5,CEND1,SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,CD151,AP006621.8,POLR2L,TSPAN4	NA	NA	NA	NA	PNPLA2	3142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	1228821	1229012	1228909	Y	NA	NA	MUC5B,TOLLIP,MOB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TOLLIP	99872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	1320394	1320580	1320544	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	8304	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr11	1536608	1536918	1536802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP8	54232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	1543133	1543339	1543203	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	47811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	10620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	1991146	1991394	1991373	Y	TH,IGF2,IGF2	MRPL23,MRPL23-AS1,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	17756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	2009660	2010154	2009976	Y	IGF2,IGF2,SYT8	MRPL23,MRPL23-AS1,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr11	2234751	2234909	2234870	Y	ASCL2	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2	65918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr11	2799950	2800256	2800114	Y	KCNQ1,CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	80726	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.964540843117575
chr11	3175519	3175620	3175572	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	10349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	3190411	3190716	3190538	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	4442	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	3855847	3856061	3855976	Y	NUP98,STIM1,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687	NA	NA	NA	NA	RHOG	4152	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	3856455	3856581	3856498	Y	NUP98,STIM1,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687	NA	NA	NA	NA	RHOG	3632	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	3859822	3860019	3859941	Y	NUP98,STIM1,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687	NA	NA	NA	NA	RHOG	194	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	3860220	3860837	3860518	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687	NA	NA	NA	NA	RHOG	7	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr11	3902068	3902471	3902356	Y	OR52B4,CHRNA10,NUP98,RHOG,STIM1	RHOG,STIM1,AC090587.4,MIR4687	NA	NA	NA	NA	MIR4687	26776	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	5297176	5297283	5297228	Y	HBB,HBD,HBG1,HBG2	HBB,HBD,HBBP1,HBG1	OR51V1,OR51B6,OR51B5	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HBG1	28054	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.901321019937566
chr11	5300063	5300226	5300160	Y	HBB,HBD,HBG1,HBG2	HBD,HBBP1,HBG1	OR51B6,OR51B5	IMR90	Hi-C	24141950	HBG1	30941	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr11	5309264	5309567	5309518	Y	HBD,HBG1,HBG2	HBBP1,HBG1	NA	NA	NA	NA	HBG1	40142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463492604721153
chr11	5311058	5311280	5311161	Y	NA	HBBP1,HBG1	NA	NA	NA	NA	HBG1	41936	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	5401217	5401226	5401222	Y	OR51T1,OR51G2,OR51G1,MMP26,OR51L1,OR52J3,OR52E2,OR52A1,OR51V1,OR51B2,OR52N2,OR52E6,OR56B1,OR52N4,OR52D1,OR52N5,OR52N1,OR51M1,OR51I1,OR51Q1	OR51B5,AC104389.32	NA	NA	NA	NA	AC104389.32	19372	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	5504793	5505065	5505006	Y	NA	HBE1	NA	NA	NA	NA	HBE1	19782	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.58349145568789
chr11	5539705	5539835	5539765	Y	UBQLN3,UBQLNL	HBE1	OR51B5	K562	ChIA-PET	22265404	HBE1	14858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	6676048	6676412	6676073	Y	OR52W1,APBB1,APBB1,TRIM3,OR2D2,OR2D3,ZNF214,DCHS1	TAF10,TPP1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	26220	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	6723829	6724231	6724032	Y	NA	MRPL17,GVINP1	NA	NA	NA	NA	MRPL17	21197	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	8848675	8849002	8848759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST5	81496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	8944739	8945112	8945060	Y	ASCL3	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	AKIP1	14053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	9017468	9017784	9017768	Y	NA	TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	NA	NA	NA	NA	NRIP3	5812	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.98331865995521
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	9623030	9623285	9623166	Y	ZNF143,WEE1,WEE1	WEE1	NA	NA	NA	NA	WEE1	29802	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.58349145568789
chr11	9941802	9941912	9941857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	258178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	10404161	10404389	10404339	Y	ADM	NA	SWAP70,SBF2,LOC283104,MRVI1-AS1,AMPD3,MRVI1,MTRNR2L8,RNF141,LYVE1,ADM	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	76301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	10510755	10511001	10510868	Y	ZBED5	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	17722	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr11	12136145	12136580	12136313	Y	MICAL2	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	22602	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	12177917	12178047	12177953	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	64374	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	12875265	12875499	12875382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	181296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	14354673	14355035	14354941	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	29017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	14436782	14437066	14436859	Y	NA	NA	RRAS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RRAS2	52730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	14563953	14564333	14564143	Y	NA	COPB1,PSMA1	NA	NA	NA	NA	PSMA1	24063	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	14916687	14916856	14916788	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	4889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	16402637	16403029	16402964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	229650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336161803813485
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.86559955610327
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.41711692426872
chr11	17878699	17879035	17878754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGEF	153674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	32442373	32442742	32442611	Y	NA	WT1-AS,WT1	NA	NA	NA	NA	WT1-AS	12322	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67669983153461
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	33889104	33889440	33889281	Y	ABTB2,LMO2,LMO2	LMO2	NA	NA	NA	NA	LMO2	22396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr11	33898611	33898980	33898798	Y	LMO2	LMO2	NA	NA	NA	NA	LMO2	12856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	33914546	33914772	33914727	Y	LMO2	LMO2	NA	NA	NA	NA	LMO2	2710	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70191844376552
chr11	33958868	33959233	33959043	Y	NA	LMO2	LMO2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMO2	47032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.90087544266374
chr11	33964663	33964690	33964681	Y	NA	NA	LMO2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMO2	52827	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	34621875	34622041	34621973	Y	ELF5,ELF5,EHF,EHF	NA	APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CAT	163403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	35058254	35058670	35058444	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	99747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	36530791	36531124	36530883	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALX4	89548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	46015298	46015560	46015479	Y	NA	NA	GYLTL1B,PEX16	K562	ChIA-PET	22265404	GYLTL1B	74126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr11	46058881	46059222	46059206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	81763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	46077131	46077462	46077208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21A	63523	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A,RP11-702F3.3	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CTD-2589M5.4,CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	34865	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.54140823309023
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CTD-2589M5.4,CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	28900	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.05735550243614
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	CTD-2589M5.4,CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2589M5.4	23631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	46410888	46411787	46411136	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	10582	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	47414965	47416043	47415133	Y	MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SPI1,SLC39A13,PSMC3	SPI1,SLC39A13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A13	10640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SPI1,SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr11	47939528	47939960	47939626	Y	OR4B1,OR4S1,NUP160	RP11-793I11.1	PTPRJ,NUP160	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-793I11.1	14369	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.455715077506396
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	48029262	48029517	48029420	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	29149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	48063635	48064268	48063917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	63522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	57200214	57200547	57200409	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3	PRG2,SLC43A3,RTN4RL2	SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5	IMR90	Hi-C	24141950	SLC43A3	7161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.902264035230888
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,CLP1,YPEL4,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	CLP1	7175	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	58544450	58544707	58544555	Y	MPEG1,OR5B21,LPXN,LPXN	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP91-CNTF	199805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	59315294	59315558	59315429	Y	MPEG1,OR4D6,STX3,PATL1	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP	66059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463492604721153
chr11	59323878	59323962	59323920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP	57655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	AP000640.10,MRPL16	NA	NA	NA	NA	AP000640.10	17164	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	59735602	59735886	59735724	Y	MRPL16	NA	NA	NA	NA	NA	MS4A3	86174	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-881M11.1	74043	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	60906916	60907198	60907057	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	19891	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	60931528	60932206	60931841	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	4439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792768035867532
chr11	61266317	61266637	61266368	Y	LRRC10B	NA	NA	NA	NA	NA	SDHAF2	70803	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	61602064	61602538	61602257	Y	INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1	FEN1,TMEM258,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS1	7274	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.50613234652976
chr11	61627935	61628213	61628074	Y	NA	FADS1,FADS3	NA	NA	NA	NA	FADS3	29310	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr11	61637289	61637643	61637466	Y	NA	FADS1,FADS3,RAB3IL1	NA	NA	NA	NA	FADS3	19880	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.637545159085996
chr11	61690120	61690238	61690179	Y	NA	FADS3,RAB3IL1,FTH1	RAB3IL1,FTH1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB3IL1	4379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446994534998318
chr11	61743772	61743932	61743886	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	10640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	61872496	61872975	61872791	Y	DAGLA,FTH1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,C11orf9,DAGLA,DKFZP434K028,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	16470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	62164133	62164439	62164244	Y	NA	RCC2P6	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	27515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	62169834	62169958	62169927	Y	NA	RCC2P6	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	33216	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	62226637	62226898	62226739	Y	FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	90019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	62267084	62267180	62267134	Y	WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK	54527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK	53596	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	62586827	62586893	62586843	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	10667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	LGALS12,RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	63846659	63847077	63846694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	84501	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	64238125	64238462	64238294	Y	NA	NA	NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,MAP4K2,SF1,EHD1	IMR90,H1ESC,HELA,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	RPS6KA4	113505	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	64427372	64427588	64427564	Y	BATF2	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP2	83340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	64653025	64653383	64653280	Y	TIGD3,RASGRP2,PYGM,SF1,SF1,SF1,MAP4K2,EHD1,ATG2A	CDC42BPG,EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	385	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465326774562126
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.70280959831318
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00209647679284
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.74105264857497
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19608030949484
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.674603354741767
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	14.9296249582527
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	65342581	65342818	65342732	Y	TIGD3,SIPA1,SIPA1,DKFZp761E198,KCNK7,MAP3K11,EHBP1L1	LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	EHBP1L1	1072	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474938471617856
chr11	65492459	65492791	65492625	Y	NA	KAT5,RNASEH2C	RNASEH2C	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNASEH2C	6041	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2C	50795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65656792	65657262	65656985	Y	NA	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	CCDC85B	917	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.53363070587547
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	65875756	65875846	65875802	Y	NA	PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	39922	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	66080826	66081241	66080906	Y	CD248	RAB1B,CNIH2,YIF1A,RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.13	2502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	66093813	66094193	66094103	Y	NA	YIF1A,RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RIN1	8118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	66494345	66494720	66494567	Y	NA	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	15202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	66717584	66717809	66717709	Y	CLCF1,ADRBK1	PC	NA	NA	NA	NA	PC	6038	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	67028976	67029390	67029158	Y	NA	ADRBK1,ANKRD13D	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	2491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13903897475624
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr11	68270416	68270689	68270553	Y	MRGPRD	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	44230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr11	68623126	68623609	68623402	Y	MTL5,CPT1A	CPT1A,MRPL21,IGHMBP2	CPT1A,PPP6R3,MTL5,TPCN2,MRPL21,IGHMBP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPT1A	13248	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	68922905	68923104	68922954	Y	NA	NA	ORAOV1,CCND1,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	108540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.97763760953329
chr11	68924761	68925032	68924956	Y	TPCN2	NA	ORAOV1,CCND1,MYEOV	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	110396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AP000439.2	74341	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	AP000439.2	59969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.664546080412212
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	AP000439.2	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546381399286447
chr11	69264597	69264784	69264706	Y	NA	AP000439.2	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	7086	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	70150439	70150493	70150466	Y	NA	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	35633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	72343411	72343720	72343689	Y	PDE2A	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	39915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.68287831997602
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	72487947	72488068	72488008	Y	NA	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	14576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	ARAP1,STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	ARAP1	3918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr11	73097153	73097443	73097265	Y	FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	11844	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.537215279504544
chr11	74171904	74172163	74171977	Y	SPCS2,RNF169,C2CD3	KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	KCNE3	4611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	74667774	74667939	74667906	Y	RNF169	XRRA1,SPCS2,NEU3	NA	NA	NA	NA	SPCS2	9482	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	74812864	74813191	74812953	Y	NA	NA	XRRA1,LOC100507050,OR2AT4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEU3	115685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	74814562	74814987	74814735	Y	ARRB1	NA	XRRA1,LOC100507050	IMR90	Hi-C	24141950	NEU3	117383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773544641756071
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	75186595	75186756	75186708	Y	NA	GDPD5	RPS3	IMR90	Hi-C	24141950	GDPD5	48192	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	75248214	75248465	75248264	Y	UVRAG	GDPD5,SERPINH1	GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDPD5	13266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.592657575469794
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	GDPD5,SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	75270235	75270345	75270334	Y	NA	GDPD5,SERPINH1	NA	NA	NA	NA	SERPINH1	756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	75537561	75537829	75537710	Y	ARRB1,DGAT2,UVRAG	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	13110	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	75581181	75581426	75581320	Y	MAP6	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	56730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	77762280	77762565	77762352	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	26346	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.05525902564329
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	78060066	78060579	78060413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	66815	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	80527927	80527937	80527932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1870634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	82610096	82610395	82610239	Y	PCF11,ANKRD42,RAB30	C11orf82	NA	NA	NA	NA	C11orf82	1079	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	82805889	82806270	82806080	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	24924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	84772532	84772888	84772839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	564741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	85047149	85047448	85047300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	290181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	85702937	85703343	85703240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICALM	75581	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	85845984	85846086	85845986	Y	EED,PICALM,PICALM	NA	PICALM	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PICALM	67060	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.591268982902648
chr11	85854744	85854971	85854894	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	75820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	85859429	85859678	85859556	Y	EED	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	80505	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr11	85862564	85862776	85862631	Y	NA	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PICALM	83640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr11	85887618	85887919	85887680	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,CCDC83,EED,C11orf73	IMR90	Hi-C	24141950	EED	65667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	85894125	85894474	85894278	Y	PICALM,PICALM	NA	PICALM,EED,C11orf73,CCDC83,SYTL2	IMR90	Hi-C	24141950	EED	59112	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	85913184	85913318	85913234	Y	PICALM,PICALM	EED	PICALM,CCDC83,EED	IMR90	Hi-C	24141950	EED	40268	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	86229748	86229843	86229795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	151835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ME3	72806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	86803275	86803509	86803398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	56389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	88089076	88089366	88089232	Y	NA	CTSC	CTSC	K562	ChIA-PET	22265404	CTSC	20121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	88154831	88155112	88154926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	85876	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581657285846918
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	90016507	90016673	90016590	Y	NA	RP11-121L10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	2779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	93868403	93868611	93868483	Y	FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	8309	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr11	95801750	95802104	95801927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	145271	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	95888692	95889856	95889448	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	184488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.53860387207169
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	102283995	102284326	102284226	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	NA	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	54789	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	105048525	105048618	105048576	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	CASP1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-55P	644742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	631858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	602157	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	105115100	105115515	105115329	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-55P	577845	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	107885190	107885220	107885205	Y	NA	CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	7731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	109939977	109940512	109940366	Y	FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	K562	ChIA-PET	22265404	ZC3H12C	21575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr11	109947189	109947580	109947295	Y	FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	14507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	109948670	109948938	109948846	Y	ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZC3H12C	13149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	111569573	111569885	111569750	Y	PPP2R1B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R1B	65266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	111824557	111824693	111824689	Y	NA	HSPB2,HSPB2-C11orf52,C11orf52,CRYAB	NA	NA	NA	NA	CRYAB	32111	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr11	114086670	114086890	114086745	Y	ZBTB16,ZBTB16	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	39619	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr11	115741521	115741886	115741709	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	899818	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	116061103	116061309	116061204	Y	NA	NA	CADM1,FAM55B	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	580395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	AP000936.1	113719	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr11	116802235	116802679	116802498	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	102088	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	116870646	116870996	116870865	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	33771	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	117016262	117016599	117016456	Y	NA	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	3279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr11	117822049	117822355	117822234	Y	UBE4A,MPZL3,MLL,IL10RA,CD3G,CD3E,CD3D,AMICA1	IL10RA	FXYD6-FXYD2,DSCAML1,TMPRSS13,LOC100526771	IMR90	Hi-C	24141950	IL10RA	32708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	117882756	117883280	117883084	Y	NA	IL10RA	NA	NA	NA	NA	IL10RA	27693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	118187372	118187677	118187544	Y	DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D	CD3E,CD3D,CD3G,UBE4A	NA	NA	NA	NA	CD3E	14112	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.43196409447254
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr11	118787524	118788054	118787588	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6263	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	119383102	119383348	119383232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP2-AS1	132614	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	NA	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	142361	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	123172454	123172607	123172529	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	HSPA8	240516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	141044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	123950495	123950749	123950645	Y	VWA5A	VWA5A	VWA5A,OR8G1,OR8D2	IMR90	Hi-C	24141950	VWA5A	33320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	124048157	124048385	124048276	Y	OR8B12,TBRG1	NA	OR8B3	IMR90	Hi-C	24141950	VWA5A	64088	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	124062644	124062948	124062749	Y	OR6X1,OR6M1,OR8D4,OR4D5,OR6T1,OR10G4,OR10G7,VWA5A,OR8D2,OR8B12,OR8A1,OR8D1,OR8B8,TBRG1,OR8G2,OR8G1	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	78575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	124351758	124352356	124352073	Y	NA	NA	OR10G9,PANX3,TBRG1	IMR90	Hi-C	24141950	TBRG1	138376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	124403880	124404281	124404167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG1	86451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	124458771	124459153	124459140	Y	OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1	NA	NA	NA	NA	TBRG1	31579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	124940571	124941111	124940841	Y	TBRG1,SLC37A2	TMEM218	NA	NA	NA	NA	TMEM218	38548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	125036511	125036895	125036831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM218	56852	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr11	126189109	126189259	126189183	Y	HYLS1	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	16896	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	129242787	129242887	129242837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	520598	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr11	130767627	130768066	130767878	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	B3GAT1	428274	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	289742	289883	289807	Y	SLC6A12	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	206556	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	52557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	825731	826001	825891	Y	B4GALNT3	WNK1	NINJ2,WNK1,B4GALNT3	IMR90	Hi-C	24141950	WNK1	33758	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.810654698157515
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	125697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	6195	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.68770012115749
chr12	2031257	2031345	2031320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	80356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	3108245	3108552	3108282	Y	NA	TEAD4	NA	NA	NA	NA	TEAD4	41749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	4262574	4262924	4262750	Y	EFCAB4B,PARP11,C12orf4	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	118014	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	4378284	4379414	4378568	Y	PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	PARP11	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	1524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr12	4406037	4406342	4406147	Y	PARP11,CCND2	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	22029	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	4501724	4501927	4501789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf5	73353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.518437462666909
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	61127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.728657058139871
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08453969408431
chr12	7781011	7781133	7781040	Y	SLC2A14	NA	NA	NA	NA	NA	CD163L1	150518	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.79753746410263
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2,C3AR1	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08587642590579
chr12	9803369	9803672	9803507	Y	KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	RP11-705C15.4	NA	NA	NA	NA	RP11-705C15.4	4764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	9910959	9911930	9911334	Y	KLRB1,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69	NA	NA	NA	NA	NA	CD69	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	9912135	9912729	9912724	Y	NA	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	9915681	9915930	9915778	Y	OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	4184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	9917181	9917686	9917498	Y	KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	5684	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	9946454	9946723	9946606	Y	OLR1,CLEC7A,CLEC2B,CD69	CD69	CD69,CLEC7A	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CD69	34957	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	10281058	10281708	10281406	Y	CD69,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,GABARAPL1,OLR1,CLEC7A	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	81349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	10514396	10514426	10514411	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	28	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	36148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	12889732	12889911	12889754	Y	LOH12CR1,DUSP16,GPR19,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	23740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	45889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	14410616	14411017	14410842	Y	PLBD1	RP11-134N1.2	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-134N1.2	43092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr12	14549073	14549306	14549114	Y	WBP11,ATF7IP	ATF7IP	NA	NA	NA	NA	ATF7IP	32463	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	14987002	14987060	14987033	Y	NA	WBP11,C12orf60	NA	NA	NA	NA	C12orf60	32496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	15110831	15110963	15110879	Y	NA	ARHGDIB	ERP27	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGDIB	1699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	23195038	23195059	23195050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	419029	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr12	23746822	23747228	23747075	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	970813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	23770675	23770997	23770816	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	994666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	23883924	23884166	23883932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	1107915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	426587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	25058340	25058627	25058484	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	41766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	25086735	25086929	25086817	Y	NA	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	13464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.15763352127192
chr12	25104673	25105123	25105029	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	4280	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF8	157301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	NA	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RASSF8	317532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr12	26658315	26658658	26658486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	325473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	28127967	28128359	28128243	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	155823	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	28275745	28275985	28275876	Y	NA	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	8197	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr12	28283625	28284072	28283761	Y	PTHLH,PTHLH	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	110	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	31886733	31886952	31886810	Y	NA	AMN1,RP11-467L13.5	C12orf35	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMN1	6625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	31899631	31900083	31899901	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	METTL20,AMN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-467L13.5	5568	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-467L13.5	3085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.42025592062397
chr12	33137070	33137259	33137186	Y	PKP2	NA	NA	NA	NA	NA	PKP2	89296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	33571713	33571885	33571799	Y	NA	SYT10	NA	NA	NA	NA	SYT10	18869	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.736932023374125
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	39800065	39800203	39800134	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	34989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr12	43367937	43368309	43368123	Y	NA	NA	PRICKLE1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-25I15.1	297011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	45638356	45638816	45638511	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	30532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	46272544	46272693	46272552	Y	ARID2,SLC38A1,SCAF11	NA	NA	NA	NA	NA	SCAF11	111210	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr12	47601157	47601488	47601298	Y	FAM113B	PCED1B-AS1	NA	NA	NA	NA	PCED1B-AS1	6751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCED1B-AS1	62209	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	47671815	47672221	47672059	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCED1B-AS1	63576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	47754530	47754854	47754696	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	PCED1B-AS1	146291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	47755231	47755452	47755328	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	PCED1B-AS1	146992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr12	48205363	48205594	48205444	Y	PFKM	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	19321	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	48227481	48227636	48227559	Y	OR10AD1	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	2566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	48579978	48580344	48580161	Y	OR8S1,OR10AD1	ASB8,DKFZP779L1853	NA	NA	NA	NA	ASB8	6982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	48701216	48701352	48701234	Y	SENP1,PFKM,C12orf54,H1FNT	ZNF641	NA	NA	NA	NA	ZNF641	41845	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr12	49449678	49450138	49449974	Y	CCDC65,DHH	PRKAG1,RHEBL1,DHH	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	11670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,RHEBL1,DHH,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	8956	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	59919	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	49695692	49695788	49695732	Y	RHEBL1	TROAP,C1QL4,DNAJC22	NA	NA	NA	NA	TROAP	19231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	49762011	49762098	49762055	Y	TUBA1A,PRPF40B	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	3644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	50056796	50057319	50056974	Y	TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	42189	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr12	50286298	50286441	50286370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCDIN3D	51386	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	NA	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RACGAP1	85140	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr12	50555629	50555991	50555816	Y	ACCN2,DIP2B	CERS5	NA	NA	NA	NA	CERS5	3297	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	50911573	50911988	50911666	Y	SLC11A2,DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	14805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	50913232	50913640	50913328	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	16464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	51322260	51322312	51322286	Y	DIP2B	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	7005	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	51327584	51327783	51327682	Y	NA	METTL7A	NA	NA	NA	NA	METTL7A	12329	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr12	51534048	51534251	51534150	Y	POU6F1	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	30675	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	57866	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr12	52299499	52299740	52299665	Y	NA	ANKRD33,ACVR1B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	19755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr12	52525424	52525587	52525584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf44	64394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	NA	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	C12orf44	79934	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	53229830	53230092	53229928	Y	PFDN5	KRT79	NA	NA	NA	NA	KRT79	3751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	KRT79	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT79	41702	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619212919522186
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	KRT79	NA	NA	NA	NA	KRT79	47190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	53368339	53368600	53368386	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	26601	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	53368990	53369278	53369065	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	27252	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.565604793397908
chr12	53795240	53795255	53795248	Y	ATP5G2,ATF7	SP1,AMHR2,PRR13,PCBP2	NA	NA	NA	NA	AMHR2	20384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	53885903	53886227	53886219	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	5620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	54017367	54017528	54017445	Y	NA	ATF7	NA	NA	NA	NA	ATF7	671	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	NA	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	79446	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC9,HOXC-AS1	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	20067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.829432514995149
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.600880679958378
chr12	54690191	54690205	54690198	Y	NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	NFE2	2700	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.883931795667079
chr12	54700865	54701198	54701063	Y	NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPZ1	7879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.657214130471279
chr12	54745877	54746035	54745904	Y	NA	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	37047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	29198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.473104301776883
chr12	54814164	54814540	54814466	Y	GPR84	ZNF385A,ITGA5	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	2920	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264891	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	56193144	56193361	56193252	Y	OR6C3,OR6C75	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	SARNP	16179	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.4242975091949
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TAC3,TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	58168960	58169095	58169042	Y	TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM	NA	NA	NA	NA	RP11-571M6.15	4149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	62644447	62644716	62644645	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	USP15	MCF7	ChIA-PET	22265404	USP15	7403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	111271	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	66048868	66049228	66049091	Y	NA	RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	14716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.38403701877018
chr12	66059684	66059892	66059792	Y	NA	RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	25532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	66060821	66060972	66060881	Y	NA	RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	26669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-230G5.2	100974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	CAND1	386296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.837210042209906
chr12	69006143	69006530	69006154	Y	CPM,IFNG,RAP1B	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RAP1B	3524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.784990508652775
chr12	69122207	69122406	69122269	Y	NA	NUP107,SLC35E3	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	15480	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	69311802	69312020	69311891	Y	CPM	NA	NA	NA	NA	NA	MDM2	111846	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	69724869	69725108	69724964	Y	LYZ	LYZ,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	15013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr12	72125908	72126059	72125950	Y	NA	TMEM19,RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	20595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	73639499	73639785	73639508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	1289766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	76982645	76982853	76982748	Y	OSBPL8	OSBPL8	OSBPL8,ZDHHC17	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL8	31056	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	77156465	77156658	77156516	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	1097	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr12	79918085	79918441	79918422	Y	NA	NA	SYT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-84G21.1	408240	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	81405150	81405419	81405285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244J10.1	910037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	86013160	86013354	86013263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTS	252719	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	88527986	88528043	88528042	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	5950	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	89632867	89633143	89633005	Y	NA	NA	POC1B,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	POC1B	284658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	169322	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	91737863	91738211	91738037	Y	C12orf12	NA	EPYC,DCN,PLEKHG7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-796E2.4	799138	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	91900299	91900534	91900371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	636815	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	92189163	92189178	92189169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	348171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792322458593706
chr12	92290576	92290698	92290637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	246651	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr12	93762169	93762549	93762358	Y	NA	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	7110	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	93767024	93767186	93767090	Y	CRADD,NUDT4	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	2473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	93770329	93770575	93770474	Y	NUDT4	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.372826282941101
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	93949724	93949882	93949803	Y	NA	SOCS2,SOCS2-AS1	NA	NA	NA	NA	SOCS2	11708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr12	94135673	94136306	94136137	Y	NUDT4,SOCS2	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	66522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr12	94172136	94172517	94172167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	102985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	94495978	94496358	94496187	Y	NA	NA	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC41	355406	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	94681590	94681805	94681698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	169959	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	77597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	95034280	95034617	95034465	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	182516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	95597894	95598075	95597980	Y	NA	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	11183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr12	96794959	96795305	96795211	Y	CDK17	CDK17	NA	NA	NA	NA	CDK17	2621	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	97355714	97355975	97355919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	56713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	99021055	99021169	99021113	Y	NA	SLC25A3,SNORA53,IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	IKBIP	15722	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr12	99235060	99235389	99235225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	198141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	100596885	100596960	100596910	Y	NA	ACTR6,RP11-175P13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-175P13.3	5324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	102873089	102873325	102873232	Y	NA	IGF1	NA	NA	NA	NA	IGF1	666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	102892301	102892634	102892501	Y	NA	IGF1	NA	NA	NA	NA	IGF1	19878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	IGF1	NA	NA	NA	NA	IGF1	37185	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	104872178	104872670	104872343	Y	HCFC2,EID3,CHST11	CHST11	NA	NA	NA	NA	CHST11	25105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr12	104912129	104912512	104912321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	65056	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	105815131	105815436	105815284	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	187115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.67924188560128
chr12	108511265	108511472	108511371	Y	NA	WSCD2	NA	NA	NA	NA	WSCD2	9776	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428216718160683
chr12	108920909	108921183	108921031	Y	NA	FICD,SART3,ISCU	NA	NA	NA	NA	FICD	13947	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	1724	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.995210104125736
chr12	109035890	109036155	109035901	Y	NA	SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	10155	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	109083720	109083964	109083780	Y	SSH1	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	39408	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	109093619	109093939	109093779	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	29433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	109899131	109899209	109899162	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	13998	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr12	110517321	110517546	110517448	Y	ARPC3	C12orf76,IFT81	C12orf76	K562	ChIA-PET	22265404	C12orf76	7830	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	110517549	110517856	110517740	Y	GIT2,RAD9B,C12orf76	C12orf76,IFT81	C12orf76	K562	ChIA-PET	22265404	C12orf76	8058	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	110540205	110540443	110540322	Y	NA	C12orf76,IFT81	ANKRD13A,C12orf76,IFT81,ATP2A2,ANAPC7,ARPC3,GPN3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFT81	19697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	111001824	111001977	111001904	Y	NA	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	17148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	111043428	111043840	111043517	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1,HVCN1	PPTC7,TCTN1	GPN3,FAM216A,RAD9B,PPTC7,C12orf76,TCTN1,ARPC3,VPS29,HVCN1,PPP1CC	IMR90	Hi-C	24141950	TCTN1	5992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	111252728	111252961	111252814	Y	NA	NA	CUX2	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CC	73984	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.20412014366147
chr12	111847309	111847501	111847415	Y	ALDH2,SH2B3	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	5557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	111875686	111876044	111875771	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	33934	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	111881338	111881509	111881420	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	39586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	113741046	113741165	113741159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLBD2	53206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDSL	171229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.57414206558403
chr12	114200256	114200532	114200390	Y	NA	RP11-438N16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-438N16.1	8956	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr12	114917726	114918063	114917895	Y	NA	NA	TBX5,RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	201906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	116383050	116383163	116383141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	329980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr12	116530359	116530538	116530483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	182605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	116796896	116797249	116796984	Y	NA	NA	MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	83753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392049677052561
chr12	116946088	116946451	116946189	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22776	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	117173952	117174265	117174216	Y	MED13L,MAP1LC3B2	C12orf49	NA	NA	NA	NA	RNFT2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	117478325	117478369	117478352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESC	56915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	117480044	117480441	117480323	Y	TESC	NA	NA	NA	NA	NA	TESC	54843	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	118123457	118123641	118123524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	325752	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	118605193	118605499	118605376	Y	NA	PEBP1,VSIG10	NA	NA	NA	NA	VSIG10	33362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	118626739	118626832	118626769	Y	KSR2	NA	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	VSIG10	54908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	118632324	118632442	118632383	Y	NA	RPS2P5	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P5	49435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	118795182	118795561	118795499	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	TAOK3	13189	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	120372601	120372782	120372690	Y	NA	NA	CIT,TMEM233	IMR90	Hi-C	24141950	CIT	59506	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr12	120926786	120926862	120926830	Y	SIRT4	TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	21133	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	120967554	120967708	120967668	Y	NA	RNF10,COQ5,POP5	NA	NA	NA	NA	RNF10	1575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	121634517	121635169	121634888	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	P2RX4	P2RX4	IMR90	Hi-C	24141950	P2RX4	10491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	64817	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.865153978829445
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM120B	23540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	122155083	122155323	122155204	Y	NA	TMEM120B	NA	NA	NA	NA	TMEM120B	6425	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	122462417	122462775	122462615	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	7089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	122519763	122520228	122519936	Y	ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	5135	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	122681575	122681727	122681651	Y	NA	B3GNT4,DIABLO	NA	NA	NA	NA	B3GNT4	4363	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.638436313633646
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.673266622920291
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	123872201	123872612	123872414	Y	NA	hsa-mir-8072,SBNO1,SETD8,RILPL2	NA	NA	NA	NA	SETD8	5881	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr12	124009741	124009949	124009845	Y	NA	RILPL1	NA	NA	NA	NA	RILPL1	6316	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	124198913	124199092	124199012	Y	ATP6V0A2	TCTN2,ATP6V0A2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A2	4048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr12	124511422	124511512	124511486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	56044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	452167	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.03182221030698
chr12	125050536	125050830	125050706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	314384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr12	125229298	125229517	125229417	Y	NA	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	135697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	125353523	125353887	125353860	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	SCARB1	11327	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.564713638850256
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	6796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr12	127563994	127564267	127564131	Y	NA	RP11-575F12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.1	21048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	127567979	127568114	127568034	Y	NA	RP11-575F12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.1	25033	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	RP11-575F12.2,AC079949.1	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.2	18217	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	127645786	127646010	127646007	Y	NA	RP11-575F12.2,AC079949.1	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	2662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.51409314406647
chr12	129301742	129302776	129302427	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	3752	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr12	131338058	131338482	131338208	Y	NA	STX2,RAN	RAN	K562	ChIA-PET	22265404	RAN	15942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	131714239	131714475	131714357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-76C10.5	237718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr12	132014283	132014643	132014520	Y	NA	NA	GPR133	IMR90	Hi-C	24141950	SFSWAP	178983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	132203397	132203510	132203472	Y	ULK1	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	9771	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr12	133065143	133065512	133065289	Y	NA	FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	1006	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	20546038	20546426	20546233	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	15228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	20692936	20693199	20693068	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	22583629	22583981	22583861	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	382475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264273298871067
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	12616	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.574325335905986
chr13	24290088	24290194	24290124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	170834	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	24365850	24365860	24365855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	95168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	NA	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	66738	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.58946671836888
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	29106909	29107160	29107135	Y	NA	FLT1	FLT1,PAN3,POMP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FLT1	39644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.673712200194116
chr13	29148829	29149214	29148994	Y	POMP	EIF4A1P7	FLT1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	21756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.390661084485415
chr13	29156851	29157013	29156932	Y	POMP	EIF4A1P7	FLT1,PAN3	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	13957	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr13	29232247	29232368	29232342	Y	NA	POMP	NA	NA	NA	NA	POMP	1006	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	31444557	31445090	31444788	Y	C13orf26	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	254727	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	31585731	31585921	31585826	Y	NA	NA	USPL1,C13orf33,TEX26-AS1,KATNAL1,TEX26,ALOX5AP	IMR90	Hi-C	24141950	HSPH1	148604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	272945	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.774933234323219
chr13	36853236	36853259	36853249	Y	CCNA1,C13orf38	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	NA	NA	NA	NA	CCDC169	16718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	41558714	41559024	41558959	Y	C13orf15,FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	64804	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	41591294	41591779	41591504	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	41631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	41825625	41825697	41825634	Y	KBTBD7,NAA16	MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	10045	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr13	42162855	42163294	42163201	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	279514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	42228867	42229175	42229114	Y	NAA16,C13orf15	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	345526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	385716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	42453037	42453433	42453235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	390856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	139032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	42721459	42721826	42721635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	122463	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr13	44833229	44833563	44833337	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZP1	292669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr13	45774024	45774110	45774098	Y	KCTD4	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	81374	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	49888133	49888426	49888280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	68086	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	50630657	50630910	50630784	Y	NA	MIR16-1,DLEU1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	9460	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	MIR16-1,DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	50804549	50804739	50804670	Y	NA	NA	DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	DLEU2	106693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	50819119	50819505	50819321	Y	KPNA3	NA	DLEU1,DLEU2,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	114394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	51176389	51176436	51176413	Y	NA	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	242490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	63622021	63622216	63622150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	1025928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr13	63626096	63626398	63626247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	1021746	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr13	64596462	64596642	64596562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	51502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr13	67204176	67204298	67204237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2556032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	67633828	67634032	67633930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00383	2160446	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	67730122	67730387	67730193	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00383	2064091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.692044439757926
chr13	69285358	69285440	69285385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00383	509038	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	74340193	74340396	74340347	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	365998	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr13	76159377	76159493	76159435	Y	NA	COMMD6,UCHL3,LMO7	NA	NA	NA	NA	LMO7	33077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363660163159197
chr13	81913928	81913973	81913949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	1000842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	84480650	84480755	84480723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00351	1454981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr13	87444403	87444606	87444585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00351	1508667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	93083293	93083662	93083475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	373196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr13	93096966	93097333	93097096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	386869	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr13	93870012	93870383	93870198	Y	NA	GPC6	GPC6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC6	6712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	93880621	93881133	93881009	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	3526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	93899040	93899272	93899121	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	21945	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr13	93947360	93947697	93947394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	70265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.810654698157515
chr13	95925874	95926219	95926059	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	25468	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01170817384857
chr13	95931058	95931197	95931128	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	20490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	95938060	95938332	95938319	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	13355	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	95951518	95951672	95951596	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	15	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr13	96350660	96350996	96350828	Y	NA	DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	23267	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	96424038	96424083	96424061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	96645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	98082020	98082299	98082214	Y	MBNL2,RAP2A	RAP2A	RAP2A	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2A	2177	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	99068008	99068369	99068130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	159825	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr13	99223213	99223429	99223417	Y	STK24	STK24	NA	NA	NA	NA	STK24	4765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	99644715	99645037	99644840	Y	DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	205927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	99698656	99698961	99698809	Y	DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	152003	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	99934888	99935365	99935021	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	22294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	21650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	100310859	100311153	100311058	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	53940	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	100314131	100314374	100314299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	57212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	100523777	100524089	100523900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC5	98074	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	101253370	101253509	101253428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	71838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	107222796	107223196	107222998	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	4284	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	107448247	107448283	107448269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	134462	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	108503880	108504176	108504028	Y	FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	12907	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	108520964	108521235	108521194	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3881	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	108987608	108987753	108987666	Y	FAM155A	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF13B	86020	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr13	110352571	110352699	110352636	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	84216	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr13	110359460	110359633	110359542	Y	IRS2	NA	MYO16,IRS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRS2	77282	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr13	110443694	110443751	110443735	Y	IRS2	IRS2	MYO16,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	6779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.845485007444157
chr13	111616634	111616920	111616701	Y	NA	NA	LINC00346,ING1,ANKRD10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD10	51218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr13	111633427	111633785	111633577	Y	NA	NA	ARHGEF7,LINC00346,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	68011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	113588902	113588931	113588917	Y	NA	NA	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	F10	186197	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	113928610	113928824	113928747	Y	CUL4A	LAMP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	20732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.72277278195754
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	20895931	20896136	20896054	Y	RNASE3,RNASE6,TEP1,TMEM55B,PNP	TEP1,OSGEP,APEX1,TMEM55B,PNP	NA	NA	NA	NA	TEP1	16343	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	21268104	21268276	21268208	Y	NA	RNASE6,RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	1161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	RNASE6,RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	19176	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	23169368	23169492	23169430	Y	REM2	CTD-2555K7.1	OXA1L,SLC7A7,DAD1,RBM23	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2555K7.1	7624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MRPL52	2521	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	23357263	23357473	23357436	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	18441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	23367708	23367835	23367778	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	RBM23	18558	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	23907435	23907682	23907559	Y	NA	NGDN	NA	NA	NA	NA	NGDN	29215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	24058094	24058646	24058322	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4,DHRS2	NA	NA	NA	NA	JPH4	12085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	43958	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	24891908	24892270	24892086	Y	NA	NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	KHNYN	4222	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	25464405	25464804	25464526	Y	CMA1,CTSG,GZMB,STXBP6	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP6	52699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3006G17.2	314777	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	29533740	29533892	29533834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2384A14.1	236290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	30757003	30757069	30757036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKD1	97899	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	58389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	31408112	31408404	31408271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	66392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	36583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	31528867	31529033	31528949	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	STRN3	35260	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A,RP11-176H8.1	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.565159216124082
chr14	34407631	34407737	34407684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGLN3-AS1	99566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	EGLN3-AS1	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	EGLN3-AS1	22097	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	35675118	35675537	35675232	Y	NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	70302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	35836736	35837242	35837045	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	19033	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	35855857	35856187	35856101	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	88	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.628824616577916
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	35876265	35876636	35876451	Y	FAM177A1,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	4310	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	35886115	35886382	35886280	Y	FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,BRMS1L,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,NFKBIA,KIAA0391,PPP2R3C,FAM177A1	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIA	14160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	36778207	36778309	36778259	Y	NA	MBIP	NA	NA	NA	NA	MBIP	9573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	37233433	37233885	37233827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	108660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	37317346	37317701	37317507	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	192573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	37440604	37440817	37440729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	199254	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.90386307400423
chr14	37445830	37445969	37445900	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	194102	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	37586141	37586465	37586450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	53606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.600880679958378
chr14	45483090	45483569	45483224	Y	NA	KLHL28	NA	NA	NA	NA	KLHL28	25956	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	50090977	50091033	50091007	Y	METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2	RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2	NA	NA	NA	NA	MGAT2	5488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	50256678	50256775	50256761	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	24352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30298239404586
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428216718160683
chr14	50406046	50406061	50406054	Y	NA	ARF6	NA	NA	NA	NA	ARF6	48236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	81921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	108078	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	168019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	167466	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr14	50562564	50562863	50562716	Y	RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	133413	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr14	51434779	51434836	51434798	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	25325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	52328681	52329167	52329039	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	125026	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	53209302	53209454	53209392	Y	NA	ERO1L,PSMC6,STYX,GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	STYX	14404	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	55104908	55105113	55104939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	73093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	55115744	55116109	55115959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	83929	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	55166048	55166175	55166112	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	134233	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	55173516	55173842	55173679	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	141701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	55197259	55197652	55197332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	165444	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	55565052	55565329	55565247	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	MAPK1IP1L,LGALS3	LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	23499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.28902637838969
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	56677019	56677095	56677057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	94487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	150761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	57265284	57265457	57265441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	468269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	57424216	57424296	57424257	Y	OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	309430	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	57459148	57459304	57459264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	274422	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.19084483634675
chr14	58726838	58727438	58727133	Y	NA	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	PSMA3	17289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	59216036	59216189	59216096	Y	ARID4A	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	43183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr14	61456427	61456721	61456474	Y	SLC38A6	RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5	NA	NA	NA	NA	TRMT5	10351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCH	81318	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	61948602	61948733	61948613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	211498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	190118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	62170336	62170562	62170449	Y	NA	HIF1A,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2	NA	NA	NA	NA	HIF1A	10105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281662523141555
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	64705009	64705329	64705170	Y	PLEKHG3,SYNE2	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1	147420	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	65147051	65147198	65147125	Y	NA	NA	SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBTB25	177120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	65324744	65324966	65324847	Y	SPTB	SPTB	SPTB,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPTB	19635	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	65347160	65347466	65347258	Y	RAB15	SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB	SPTB	IMR90	Hi-C	24141950	SPTB	2559	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	65546452	65546770	65546602	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	20643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	65905118	65905243	65905181	Y	NA	FUT8	NA	NA	NA	NA	FUT8	29808	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456160654780222
chr14	66394661	66394897	66394828	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	519351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	67735210	67735475	67735304	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	29384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337550396380631
chr14	68420679	68421053	68420830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	136183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	68662623	68662933	68662778	Y	RDH12	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	223980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	68827959	68828328	68828144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	58585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	69247986	69248278	69248131	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	12912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	69361596	69361764	69361692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	82393	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	69424468	69424783	69424642	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	19374	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510659935452152
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	70110235	70110559	70110279	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	33922	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	70168752	70169016	70168820	Y	SLC8A3,KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	22601	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	103200	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	73934074	73934542	73934230	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,ZNF410,C14orf43,NUMB	NUMB,C14orf169	NA	NA	NA	NA	NUMB	5726	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	74220065	74220506	74220203	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	31557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	26595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr14	74238517	74238805	74238733	Y	C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	13258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr14	75750758	75751180	75750884	Y	PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS	FOS	NA	NA	NA	NA	FOS	7281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	75768536	75769006	75768683	Y	NA	FOS	NA	NA	NA	NA	FOS	25059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr14	78129695	78129950	78129826	Y	NA	SPTLC2,ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	42413	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr14	89935615	89935871	89935745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	483250	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	91002583	91003004	91002750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	141737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	91134460	91134696	91134603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	146127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr14	91267745	91267886	91267834	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	12937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281662523141555
chr14	91269936	91270352	91270297	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	10471	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.865153978829445
chr14	91272597	91272889	91272776	Y	NA	TTC7B,CTD-3035D6.2	NA	NA	NA	NA	TTC7B	7934	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	91583338	91583593	91583462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	58358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	91696123	91696361	91696283	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	171143	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	91729802	91729926	91729864	Y	GPR68,GPR68	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	152262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.9708302734961
chr14	91752749	91752962	91752855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	129226	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	92997430	92998230	92997929	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	214817	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	93738394	93738720	93738557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD7	58718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr14	95992355	95992583	95992552	Y	NA	GLRX5,SCARNA13,SNHG10	NA	NA	NA	NA	GLRX5	5257	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	98559516	98559667	98559576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	1297875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr14	100463833	100464185	100464009	Y	NA	EVL	EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	EVL	28047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EVL	59732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	100633368	100633655	100633513	Y	YY1	NA	NA	NA	NA	NA	YY1	68980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr14	100687969	100688087	100687996	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	YY1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	YY1	14548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	100874667	100875097	100874987	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	WARS	33525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	101020509	101020866	101020628	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN	NA	NA	NA	NA	NA	DLK1	169176	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	101147038	101147458	101147200	Y	NA	DLK1	NA	NA	NA	NA	DLK1	42584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr14	101237616	101237781	101237733	Y	NA	DLK1,MEG3	WDR25,LINC00523,DLK1	IMR90	Hi-C	24141950	MEG3	5966	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.92264089084187
chr14	102050999	102051149	102051091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	174986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	102173765	102174142	102173896	Y	NA	NA	PPP2R5C,DYNC1H1,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R5C	51993	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R5C	49347	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.39939306466153
chr14	102181963	102182125	102182053	Y	PPP2R5C	PPP2R5C	PPP2R5C	K562	ChIA-PET	22265404	PPP2R5C	44010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.38752208813017
chr14	102226478	102227031	102226824	Y	HSP90AA1	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	343	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.893989069996636
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	102288392	102288845	102288491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	62257	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.18332961608387
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	102977207	102977381	102977329	Y	AMN	ANKRD9	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	3071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	23148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.493716288455488
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr14	103585248	103585668	103585540	Y	NA	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	2111	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr14	103672017	103672095	103672056	Y	NA	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.76697243678651
chr14	103781496	103782004	103781810	Y	EXOC3L4,TNFAIP2	EIF5	RCOR1,EIF5,MARK3,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF5	15877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr14	103848844	103849188	103848935	Y	TNFAIP2,EIF5,MARK3	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.00209647679284
chr14	105191285	105191466	105191451	Y	NA	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	2762	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr14	105265888	105266206	105266005	Y	NA	SIVA1,AKT1,RPS26P49	NA	NA	NA	NA	AKT1	5800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	C14orf79,CDCA4,GPR132	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr14	105536057	105536658	105536303	Y	CRIP1,GPR132	GPR132	NA	NA	NA	NA	GPR132	6275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr14	106857348	106857526	106857389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00221	78919	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03826351790096
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	925265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01398792096337
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	25587380	25587405	25587393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	94723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	25606189	25606253	25606221	Y	UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	75875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr15	25624061	25624357	25624209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	57771	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	27333003	27333354	27333179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	1225444	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	27509398	27509798	27509429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL41P2	1049000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	32964268	32964677	32964326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	58923	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	33502141	33502453	33502281	Y	NA	NA	TMCO5B	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	596796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	RP11-323I15.2	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	2271	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	1090	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr15	35599049	35599138	35599102	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	9408	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr15	35650165	35650403	35650284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	60524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	199113	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr15	35840171	35840395	35840294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	250530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.738268755195602
chr15	36720333	36720777	36720654	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf41	149035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581657285846918
chr15	37203314	37203431	37203373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	94654	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	98737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.59291988242166
chr15	39447330	39447720	39447666	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	423560	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	39650604	39651044	39650772	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	220236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2AK4	13095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	40390220	40390395	40390296	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	8698	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr15	40463815	40464014	40463832	Y	NA	BUB1B	NA	NA	NA	NA	BUB1B	12591	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.58349145568789
chr15	41581854	41582095	41581909	Y	NA	OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1	NA	NA	NA	NA	OIP5-AS1	7666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.877045422999972
chr15	42221521	42221787	42221671	Y	MGA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	40989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	42226984	42227301	42227216	Y	LTK,MGA,JMJD7,VPS39,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	35475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	42786035	42786158	42786098	Y	SNAP23	SNAP23	NA	NA	NA	NA	SNAP23	4604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	42788912	42789178	42789135	Y	TTBK2	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	SNAP23	7481	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	42792289	42792533	42792361	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	10858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	42800654	42800904	42800762	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	19223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	43321563	43321622	43321602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR1	74689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347607670710187
chr15	43806421	43806594	43806505	Y	NA	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	5265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr15	43810666	43810996	43810786	Y	MAP1A	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	9510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76,PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	4337	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	44524937	44524986	44524960	Y	NA	NA	CTDSPL2,WDR76,FRMD5,CASC4	IMR90	Hi-C	24141950	CASC4	53941	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.600880679958378
chr15	45076532	45076874	45076594	Y	B2M	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM69	57346	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	45340934	45341315	45341066	Y	SPG11,B2M,SPATA5L1	SORD	NA	NA	NA	NA	SORD	27632	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr15	49217829	49218211	49218108	Y	SHC4	EID1,SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	35430	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	49598906	49599159	49599033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS2	153048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	42409	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	50475759	50476090	50475833	Y	SLC27A2	SLC27A2	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	3366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	50948351	50948714	50948533	Y	NA	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	28298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	51172834	51173079	51172965	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	51455036	51455205	51455156	Y	NA	NA	GLDN,TNFAIP8L3,CYP19A1	IMR90	Hi-C	24141950	AP4E1	256167	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	51911355	51912275	51911714	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	DMXL2	NA	NA	NA	NA	DMXL2	755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	51912435	51913121	51913004	Y	TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	51964465	51964685	51964575	Y	MAPK6,DMXL2	SCG3	TMOD2,LYSMD2,DMXL2,SCG3	IMR90	Hi-C	24141950	SCG3	6865	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	52135746	52136104	52135949	Y	DMXL2,MAPK6,TMOD3	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	15921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	52148809	52148818	52148812	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	28984	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354494043377293
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	55503902	55504218	55504040	Y	RAB27A,PIGB	RSL24D1	RSL24D1	K562	ChIA-PET	22265404	RSL24D1	16637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	55571935	55572134	55572019	Y	RAB27A,PIGB	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	37024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	55581016	55581448	55581368	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	27710	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	156305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	57529031	57529296	57529123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	320210	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	57614367	57614619	57614484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	267612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.664991657686037
chr15	57946197	57946519	57946360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	63966	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	58293229	58293587	58293482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPC	407181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	58751372	58751614	58751455	Y	AQP9,SLTM,ADAM10	ALDH1A2	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	36451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	58797096	58797251	58797174	Y	NA	ALDH1A2	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	9031	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	110027	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	59194300	59194605	59194559	Y	NA	RNF111,SLTM	NA	NA	NA	NA	SLTM	29247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	59978652	59978797	59978720	Y	BNIP2	GTF2A2,BNIP2	NA	NA	NA	NA	RP11-361D15.2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	60874514	60874871	60874792	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	105137	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	60881604	60881753	60881652	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	112227	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	62411576	62411892	62411783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	60904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	62574155	62574333	62574245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	106392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510659935452152
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	63803463	63803731	63803481	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	8670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	64000367	64000635	64000532	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	123506	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	64187573	64187676	64187624	Y	DAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	63432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.32576989414722
chr15	64188807	64189333	64189164	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	64666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0570413347386
chr15	64231829	64232283	64232065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	107688	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	64538820	64539298	64539122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	85416	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	64754012	64754177	64754162	Y	NA	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	3071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	72252	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr15	64940943	64941327	64941079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	52153	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501493815670248
chr15	65277772	65277992	65277893	Y	OAZ2,PLEKHO2	SPG21,MTFMT	NA	NA	NA	NA	SPG21	2656	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382437979996831
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	66006814	66006895	66006855	Y	NA	RAB11A	SLC24A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11A	9497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	66060795	66060948	66060877	Y	NA	RAB11A,DENND4A	NA	NA	NA	NA	DENND4A	21683	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354494043377293
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr15	66446289	66446658	66446570	Y	DIS3L,DIS3L	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3L	136897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	66870695	66870962	66870743	Y	MAP2K1	LCTL,RP11-321F6.1	ZWILCH,SNORD16,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,LCTL,SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-321F6.1	1566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	66923146	66923585	66923353	Y	NA	NA	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-321F6.1	50618	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	66965990	66966192	66966090	Y	MAP2K1	NA	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-321F6.1	93462	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-321F6.1	120759	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.96891706702522
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-321F6.1	222996	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.610046799740282
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	67378105	67378547	67378289	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	24004	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr15	67394592	67394967	67394687	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	40491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	67401891	67402640	67402087	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	47790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	67926783	67927143	67926830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	93736	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr15	68174845	68175044	68174931	Y	PIAS1,CALML4	NA	PIAS1,CLN6,CALML4,C15orf61,LOC100506686,IQCH,SKOR1	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	169473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	68176779	68177152	68176934	Y	NA	NA	PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	167365	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr15	68238127	68238678	68238396	Y	NA	NA	PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	105839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	68366463	68366575	68366519	Y	NA	PIAS1	NA	NA	NA	NA	PIAS1	21946	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr15	69817910	69818170	69818070	Y	NA	NA	C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	74787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67992259394273
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	73061587	73061861	73061724	Y	PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	14326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	74287730	74287905	74287836	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	2716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	74681899	74682338	74682078	Y	SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	42470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr15	74801015	74801389	74801202	Y	NA	UBL7,ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	30129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	74909072	74909376	74909224	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	20231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	75365607	75365911	75365770	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	NA	C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	PPCDC	51711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	75382415	75382988	75382870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPCDC	68519	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	75445545	75445830	75445694	Y	SIN3A,SIN3A,CSK,C15orf39	C15orf39	PPCDC,C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	40154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	75470847	75471095	75470955	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39	C15orf39	C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	14889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.66847672704603
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.636156566518847
chr15	75939210	75939595	75939262	Y	NA	SNUPN,SNX33,IMP3	NA	NA	NA	NA	IMP3	163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.947151618847087
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	78535918	78535943	78535931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR61	54193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	78598854	78599004	78598959	Y	NA	WDR61	WDR61,IDH3A,DNAJA4,IREB2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR61	8718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.575976235425
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	81291796	81292315	81292076	Y	NA	MESDC2,MESDC1,C15orf26	NA	NA	NA	NA	MESDC1	501	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr15	81393942	81394130	81394078	Y	NA	NA	IL16,C15orf26	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf26	96568	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.473549879050709
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	82156047	82156216	82156161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	180266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.547769991853594
chr15	83412156	83412209	83412183	Y	NA	RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.6	5107	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.628824616577916
chr15	83722004	83722168	83722109	Y	NA	C15orf40,BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	11938	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	83761220	83761490	83761347	Y	TM6SF1	BTBD1,TM6SF1	BTBD1,MIR4515	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM6SF1	12669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3052	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr15	83847712	83847957	83847821	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	26813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	83857860	83858021	83857985	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr15	83869144	83869263	83869183	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.557381688909323
chr15	87949710	87950004	87949857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00052	168156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	89672730	89673081	89673051	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	4645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	89675943	89676620	89676217	Y	ISG20,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	1106	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00925	103036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	90382635	90382956	90382796	Y	ZNF710,CIB1	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	26002	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	90581471	90581912	90581727	Y	AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	38847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	90602725	90603219	90603002	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	40517	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	90605290	90605500	90605324	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	38236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	90708840	90709227	90709106	Y	NA	SEMA4B	CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	7004	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	91191799	91192162	91191976	Y	UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	66210	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.45536048673123
chr15	91193387	91193792	91193747	Y	FES,FES,FES,C15orf58	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	64580	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63799073635982
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLM	72770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463492604721153
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	7723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	91476522	91476977	91476740	Y	NA	MAN2A2,UNC45A,HDDC3,AC068831.3,RCCD1	NA	NA	NA	NA	AC068831.3	162	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	92012941	92013525	92013349	Y	SLCO3A1,VPS33B	NA	NA	NA	NA	NA	AC068831.10	449092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510659935452152
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	74413	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr15	93580534	93580838	93580719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	134905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1478467	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr15	96369112	96369214	96369163	Y	NA	NA	LOC400456,NR2F2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	497953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr15	96377158	96377292	96377225	Y	NA	NA	NR2F2,LOC400456	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NR2F2	489875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	96703320	96703585	96703453	Y	NA	NA	LOC400456,NR2F2	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	163582	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555101941794526
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4721	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	5042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	98400609	98400736	98400673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	60048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr15	98545444	98546413	98546248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	84660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	99661093	99661479	99661184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC23	127949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	101979646	101980007	101979833	Y	PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	83398	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr15	101999244	101999620	101999441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	63785	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr15	102156175	102156504	102156244	Y	NA	TM2D3	PCSK6,SNRPA1,TM2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM2D3	34090	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr16	130955	131250	131103	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	5949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	154913	155267	155125	Y	NHLRC4,HBQ1,HBM	RHBDF1,MPG,NPRL3,HBZ	NA	NA	NA	NA	MPG	29907	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	163381	163878	163678	Y	NA	RHBDF1,MPG,NPRL3,HBZ	NA	NA	NA	NA	NPRL3	22981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr16	193028	193281	193155	Y	NHLRC4,HBQ1,HBM	NPRL3,HBZ,HBA2,HBA1,HBQ1	RHBDF1,SNRNP25,POLR3K,MPG,NPRL3,HBM,HBA2,HBA1,HBQ1,LUC7L,MRPL28,TMEM8A,LOC100134368,HBZ,ITFG3	K562,HELA,H1ESC,GM12878,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	NPRL3	6169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	199321	199454	199390	Y	HBM	NPRL3,HBZ,HBA2,HBA1,HBQ1	NPRL3	K562	ChIA-PET	22265404	HBZ	1232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	357702	358064	357991	Y	SOLH	ARHGDIG,PDIA2,AXIN1	NA	NA	NA	NA	PDIA2	26550	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	374352	374895	374583	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	PDIA2,AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25778	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	C16orf11,PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	C16orf11	32590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	C16orf11,PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	C16orf11	29266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.28237040736725
chr16	756470	756692	756669	Y	NA	RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,NARFL	NA	NA	NA	NA	FBXL16	2641	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	1210403	1210717	1210625	Y	NA	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	9162	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr16	1519780	1519909	1519802	Y	SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	3672	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	1522812	1522824	1522818	Y	MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	757	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	1698080	1698287	1698168	Y	CLCN7	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	27970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	2561562	2561710	2561655	Y	PKD1,RAB26,CASKIN1,PDPK1	TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474938471617856
chr16	3013245	3013631	3013382	Y	KREMEN2	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1	NA	NA	NA	NA	KREMEN2	1300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	3031604	3031823	3031757	Y	PAQR4	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	PKMYT1	3064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.28491246143392
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr16	3055976	3056164	3056082	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	10282	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr16	3058105	3058264	3058160	Y	ZNF434,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NAT15,NAT15,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1,SRRM2,PRSS33,MMP25	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	8182	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.674157777467942
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr16	3202363	3202472	3202417	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	24585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	3221173	3221513	3221502	Y	NA	ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	43395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	3858926	3859164	3859045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	69563	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3849800340635
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.96708289718424
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.838598634777054
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	4460708	4460927	4460812	Y	CORO7	VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	CORO7	12779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.637545159085996
chr16	4678373	4678564	4678416	Y	CORO7,UBN1,UBN1,GLYR1,MGRN1	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	13879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	4732185	4732598	4732284	Y	CORO7,ROGDI	NUDT16L1,C16orf71,ANKS3	NA	NA	NA	NA	NUDT16L1	9097	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	8010227	8010459	8010246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	703081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	8015278	8015380	8015329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	698160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	8032889	8032980	8032935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	680560	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr16	8035197	8035214	8035207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	678326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264273298871067
chr16	8159340	8159643	8159579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	553897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555101941794526
chr16	8852303	8852368	8852337	Y	NA	PMM2,TMEM186	PMM2,TMEM186	IMR90	Hi-C	24141950	PMM2	28312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	9141634	9142026	9141729	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	41479	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.69202397211876
chr16	9171086	9171431	9171335	Y	C16orf72,USP7	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	12074	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	10221722	10221780	10221751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	196511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	10549193	10549271	10549232	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	123284	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	11155783	11156117	11155981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	119438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	11295999	11296122	11296015	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1	RMI2	NA	NA	NA	NA	RMI2	45354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	11318108	11318467	11318211	Y	NA	RMI2,SOCS1	CLEC16A,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RMI2	23009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr16	11325318	11325468	11325393	Y	SOCS1	RMI2,SOCS1	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	RMI2	16008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	11326911	11327269	11327154	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1	RMI2,SOCS1	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	RMI2	14207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.728211480866046
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.519826055234056
chr16	12713340	12713716	12713664	Y	NA	NA	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	CPPED1	182158	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	13873618	13873819	13873731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC4	138195	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	14752031	14752218	14752119	Y	NA	PARN,BFAR	NA	NA	NA	NA	BFAR	27359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr16	15611948	15612359	15612167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	85796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	15615028	15616079	15615654	Y	KIAA0430	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	88876	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.473104301776883
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.86612417000701
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr16	16092294	16092782	16092512	Y	NDE1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	50860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	16115976	16116215	16116101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	74542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr16	16198084	16198445	16198250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	156650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	17231064	17231355	17231210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	1189630	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	18153312	18153685	18153560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	646020	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.964043405098079
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	20729381	20729771	20729568	Y	LYRM1,DCUN1D3	THUMPD1	NA	NA	NA	NA	THUMPD1	21635	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01993127833716
chr16	22203475	22203890	22203761	Y	POLR3E	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,EEF2K,PDZD9,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	11713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	22227582	22228085	22227763	Y	EEF2K	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	11979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	22406960	22407340	22407096	Y	NA	SMG1P1,CDR2,RRN3P3	POLR3E,CDR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMG1P1	38989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	23419986	23420351	23420270	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	42150	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	23837875	23838190	23838037	Y	GGA2	PRKCB	PRKCB	K562	ChIA-PET	22265404	PRKCB	7132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	23855109	23855743	23855120	Y	NA	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	9787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr16	23867520	23867900	23867586	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	22198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	23868974	23869227	23869116	Y	NA	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	23652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	23869264	23869516	23869360	Y	GGA2	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	23942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	23869779	23870194	23869980	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	24457	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	23871062	23871733	23871381	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	25740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr16	23921671	23922056	23921730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	76349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr16	23947196	23947582	23947202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	101874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	23989243	23989380	23989313	Y	PRKCB	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	143921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	27249665	27249878	27249750	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	28237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	27263252	27263592	27263361	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	14523	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	27543393	27543748	27543573	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	15486	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	28204572	28204722	28204690	Y	CCDC101,APOBR,XPO6,SBK1	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	16519	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	29020643	29020909	29020839	Y	NA	SPNS1	NA	NA	NA	NA	SPNS1	37101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.49353301813353
chr16	29666391	29666471	29666431	Y	NA	SLC7A5P1,SPN,QPRT	SPN	K562	ChIA-PET	22265404	SPN	5829	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,SEPT1,ZNF771,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	DCTPP1	10853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.33556486152491
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	8038	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr16	30927821	30927845	30927833	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1,ORAI3,SETD1A	NA	NA	NA	NA	FBXL19	4531	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	31083220	31083516	31083291	Y	NA	STX4,ZNF668,ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	ZNF646	227	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	31891820	31892363	31891972	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	8741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.95540662864287
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	46776803	46777018	46776928	Y	MYLK3	MYLK3	ORC6,VPS35	K562	ChIA-PET	22265404	MYLK3	45301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456160654780222
chr16	46780849	46781142	46780994	Y	MYLK3	MYLK3	NA	NA	NA	NA	MYLK3	41177	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	MYLK3	1464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26864952277871
chr16	46839113	46839505	46839309	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	MYLK3	16794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	46863838	46864241	46863904	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	47669133	47669265	47669199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITFG1	173073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr16	48631315	48631363	48631339	Y	NA	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	20696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	49316261	49316466	49316357	Y	CBLN1,C16orf78	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	664202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	49656058	49656138	49656098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR3	441714	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	49893175	49893278	49893262	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	204574	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	50297167	50297573	50297410	Y	NA	ADCY7	PAPD5,BRD7,ADCY7	IMR90	Hi-C	24141950	ADCY7	19119	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr16	50313130	50313496	50313255	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	35082	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	53095278	53095286	53095282	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	8333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr16	53128013	53128430	53128279	Y	RBL2	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	41068	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	56645516	56645845	56645554	Y	MT2A,MT1M,MT1E,MT1A	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	5405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.1434942352938
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr16	58299498	58299672	58299601	Y	NA	CCDC113,GINS3	NA	NA	NA	NA	GINS3	27312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	66195856	66196211	66196038	Y	CMTM2,CMTM1,CMTM1	NA	CDH11,LOC283867	IMR90	Hi-C	24141950	TK2	388236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13859339748241
chr16	67047765	67048035	67047886	Y	FBXL8,CES4A	CBFB	NA	NA	NA	NA	CBFB	12984	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	67250789	67251131	67250954	Y	NA	NOL3,KIAA0895L,E2F4,LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1	NA	NA	NA	NA	LRRC29	7820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	67278264	67278626	67278472	Y	RRAD,C16orf70,FAM65A,ATP6V0D1,ACD,LRRC29,LRRC29,PLEKHG4,FHOD1	LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1,PLEKHG4	NA	NA	NA	NA	FHOD1	935	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	67435763	67435871	67435819	Y	NA	HSD11B2	NA	NA	NA	NA	HSD11B2	26684	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	67513836	67514185	67514007	Y	C16orf70,LRRC29,LRRC29,PSMB10,ACD,FAM65A,ATP6V0D1	ATP6V0D1,FAM65A	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D1	696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	67538327	67538734	67538468	Y	NA	ATP6V0D1,FAM65A	AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,RLTPR,CTRL	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65A	11587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	67993555	67993691	67993621	Y	NA	PSMB10,SLC12A4	NA	NA	NA	NA	SLC12A4	7813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	68113537	68113949	68113713	Y	SLC7A6OS,RLTPR,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3	NFATC3	NA	NA	NA	NA	NFATC3	2705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	53949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.537215279504544
chr16	68418958	68419037	68419019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	57526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	69019845	69020210	69019891	Y	NA	NA	CHTF8,HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	CHTF8	132121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHTF8	91850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.810654698157515
chr16	69819174	69819469	69819322	Y	NA	NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	24965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr16	70464772	70465160	70465031	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	5980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.818432225372271
chr16	70467076	70467247	70467197	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	3893	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18392655837244
chr16	70564094	70564236	70564165	Y	NA	COG4,SF3B3,SNORD111B	NA	NA	NA	NA	SNORD111B	2682	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	70712649	70712861	70712739	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	5108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	70783169	70783447	70783290	Y	NA	VAC14	NA	NA	NA	NA	VAC14	49617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	70918380	70918652	70918516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	85316	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	SNORD71,AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	71931018	71931097	71931057	Y	DHX38,ATXN1L,KIAA0174	ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	3779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.992930357010939
chr16	72460868	72461258	72460965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	334538	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	545548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr16	72751239	72751276	72751266	Y	NA	NA	HP,HPR	IMR90	Hi-C	24141950	TXNL4B	624909	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	74599295	74599588	74599442	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	39424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr16	74970861	74971182	74971035	Y	MLKL	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	59746	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	75109200	75109655	75109345	Y	TMEM170A,ZNRF1	LDHD	NA	NA	NA	NA	LDHD	39014	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	75454988	75455069	75455029	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	CFDP1	10314	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	75594050	75594208	75594144	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	CHST5,TMEM231	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GABARAPL2	4041	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr16	75683626	75683906	75683817	Y	NA	ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	KARS	3085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	81436864	81437191	81437044	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	39584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	81659418	81659741	81659491	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	81666319	81666849	81666608	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	103853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	77260	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	69174	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	81785976	81786155	81786044	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	PLCG2	ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720	IMR90	Hi-C	24141950	PLCG2	15274	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392049677052561
chr16	82168947	82168959	82168953	Y	NA	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	32872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	84130238	84130438	84130330	Y	NA	MBTPS1,HSDL1	NA	NA	NA	NA	MBTPS1	18073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	HSDL1	637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	84784930	84785133	84785062	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53346	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	85080631	85081139	85080973	Y	KIAA0513	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	21256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	10.2421327922786
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.13046127949249
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr16	85339922	85340091	85340012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	280547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr16	85415557	85415973	85415759	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	305706	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr16	85470615	85470779	85470696	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250900	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	85496879	85497321	85497140	Y	FAM92B,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	224358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	85569816	85569916	85569832	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	151763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	85570517	85570742	85570617	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	150937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583045878414065
chr16	85591342	85591727	85591695	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	129952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr16	85600571	85600865	85600718	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120814	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr16	85601000	85601159	85601100	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120520	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.455715077506396
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.11406220183803
chr16	85603902	85604423	85603949	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	117256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04054326501576
chr16	85606114	85606473	85606294	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	115206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr16	85608106	85608214	85608158	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	113465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491882118614517
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619658496796012
chr16	85672210	85672324	85672267	Y	NA	GINS2	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	49355	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	111288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	87498995	87499259	87499135	Y	BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO31	75247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	87781357	87781475	87781397	Y	C16orf95	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16123	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.436937260668762
chr16	87888208	87888468	87888297	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	12626	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr16	88366840	88367234	88367013	Y	BANP,BANP,ZC3H18,CYBA	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	150491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr16	88535003	88535267	88535135	Y	NA	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	17278	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	88557943	88558427	88558193	Y	FAM38A,CBFA2T3,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	40218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr16	88560841	88560974	88560886	Y	FAM38A,CBFA2T3,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	43116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.782710761537976
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr16	88771579	88772211	88771675	Y	ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166	MVD,SNAI3,RNF166,CTU2	NA	NA	NA	NA	CTU2	708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.36803638706684
chr16	88836450	88836610	88836518	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	13009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.07443055900909
chr16	88839973	88840262	88840126	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	9357	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602714849799349
chr16	88847421	88847701	88847601	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	1918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr16	88848168	88848452	88848343	Y	CYBA,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	1167	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	88848890	88849172	88848995	Y	CYBA,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	88857121	88857244	88857196	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	7502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.683769474523672
chr16	88955496	88955935	88955760	Y	NA	TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	GALNS	34118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73737760064795
chr16	89038174	89038503	89038425	Y	CYBA,PABPN1L,CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	NA	ACSF3	114280	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	89039891	89040100	89039996	Y	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	NA	ACSF3	112683	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr16	89040833	89040974	89040903	Y	CBFA2T3,CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	NA	ACSF3	111809	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr16	89045543	89045751	89045645	Y	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	NA	ACSF3	107032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.02202775513
chr16	89048691	89049270	89049005	Y	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	NA	ACSF3	103513	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr16	89066514	89066746	89066599	Y	CBFA2T3	NA	ACSF3	IMR90	Hi-C	24141950	ACSF3	86037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	89070544	89070800	89070714	Y	CBFA2T3	NA	ACSF3,CBFA2T3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACSF3	81983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	89086731	89086969	89086798	Y	NA	NA	ACSF3,CBFA2T3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACSF3	65814	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.820266395213245
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.829432514995149
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.55903258842834
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	89388621	89389157	89388908	Y	ZNF276,C16orf7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	106503	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	89475542	89475927	89475838	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	79042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30481656388683
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr16	89688213	89688598	89688406	Y	NA	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	33655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	89893816	89894170	89893993	Y	SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	11229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr16	90024486	90024764	90024610	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	DEF8	12153	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	505873	506062	505986	Y	VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	52725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR,TUSC5	NA	NA	NA	NA	TUSC5	9149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr17	1358484	1358816	1358590	Y	NA	CRK,MYO1C	NA	NA	NA	NA	CRK	5640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr17	1466992	1467380	1467296	Y	RILP	INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA	NA	NA	NA	NA	PITPNA	2882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392049677052561
chr17	1521068	1521369	1521308	Y	CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	8811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	1533068	1533815	1533453	Y	CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	2888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	1666519	1666783	1666685	Y	RTN4RL1,WDR81,WDR81,SERPINF1	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	3266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	1863470	1863779	1863610	Y	SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	62860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	1926126	1926449	1926286	Y	NA	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583045878414065
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	2397010	2397265	2397138	Y	NA	METTL16	LOC284009	IMR90	Hi-C	24141950	METTL16	15920	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	2409124	2409453	2409310	Y	NA	METTL16	NA	NA	NA	NA	METTL16	3732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1,P2RX1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	3817602	3817987	3817757	Y	UBE2G1,P2RX5,ZZEF1,P2RX1,ATP2A3	CAMKK1,ATP2A3	NA	NA	NA	NA	P2RX1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,INCA1,KIF1C	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	5505945	5506132	5506040	Y	NA	NA	WSCD1,AIPL1,FAM64A	IMR90	Hi-C	24141950	DERL2	117814	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr17	6478669	6478853	6478761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNDC17	63225	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	6790647	6790875	6790776	Y	SLC16A11,DLG4,DLG4	ALOX12P2	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	35467	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	6839831	6840063	6839905	Y	XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49	NA	LOC100506713,ALOX12,ALOX12P2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC027763.2	73605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	6897797	6898308	6898020	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,BCL6B,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	15360	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	7119118	7119286	7119174	Y	WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1	NA	NA	NA	NA	ACADVL	674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.77747528838989
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.87068366423661
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.527603582448813
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.62843812049554
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.70210171408748
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.520271632507882
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583937032961716
chr17	8532647	8532776	8532657	Y	KRBA2	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	568	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	13390789	13390935	13390899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	112309	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr17	15160656	15161352	15160970	Y	NA	PMP22	NA	NA	NA	NA	PMP22	5291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	15321203	15321403	15321304	Y	CDRT4,TEKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	153930	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	16191035	16191327	16191109	Y	TRPV2	NA	CENPV	IMR90	Hi-C	24141950	CENPV	63643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354939620651119
chr17	17098696	17098916	17098799	Y	MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN	PLD6,FLCN	NA	NA	NA	NA	PLD6	8713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	17432878	17433112	17432995	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	35169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411273071164022
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.34035475739917
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	17831776	17831833	17831804	Y	NA	TOM1L2	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	41903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	1020	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	19147768	19147949	19147793	Y	PRPSAP2,RNF112	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	131085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	19207556	19207821	19207642	Y	MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	71213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.685603644364645
chr17	20814751	20814975	20814753	Y	KCNJ18	RP11-344E13.3,CCDC144NL	NA	NA	NA	NA	CCDC144NL	17298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr17	21029344	21029732	21029473	Y	MAP2K3,MAP2K3,KCNJ18,C17orf103	DHRS7B	NA	NA	NA	NA	DHRS7B	4667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.665934672979359
chr17	21515861	21516199	21516031	Y	NA	C17orf51	CCDC144NL	K562	ChIA-PET	22265404	C17orf51	40139	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	11.5253990836164
chr17	21908682	21908761	21908685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	432960	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr17	25415234	25415538	25415430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203564	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.34786997766206
chr17	25415760	25416041	25415903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203061	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	156.852138784336
chr17	25479961	25480088	25479965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	139014	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546381399286447
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.62307123777117
chr17	25784873	25785075	25784939	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	KSR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KSR1	3203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	25821459	25821654	25821516	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	39789	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	25856308	25856397	25856353	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	74638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	25891638	25891876	25891756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALS9	62948	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr17	25981784	25982180	25981982	Y	NA	LGALS9	NA	NA	NA	NA	LGALS9	26960	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	26361320	26361470	26361415	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	5293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.520271632507882
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	27189702	27189769	27189736	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	ERAL1	9746	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	27192241	27192644	27192466	Y	SPAG5,DHRS13	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	ERAL1	12285	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr17	27199839	27200032	27199936	Y	DHRS13	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	ERAL1	19883	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	27264479	27264617	27264556	Y	UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12	FLOT2,DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	12172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	27405810	27406234	27406188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	99196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.612326546855081
chr17	27482450	27482602	27482543	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	22828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428216718160683
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	28033849	28034236	28034039	Y	NUFIP2,TAOK1,SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	85924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	89928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.828986937721323
chr17	28050852	28051063	28050953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	102927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	29176780	29177123	29176952	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	ATAD5	19792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.12987285497434
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	30846365	30846870	30846526	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	34728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	30847234	30847756	30847477	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	35597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	30907001	30907345	30907172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	95364	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	30923806	30924081	30923942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	112169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	31062983	31063086	31063034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	139109	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	31159026	31159151	31159124	Y	NA	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	43044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	31224473	31224751	31224610	Y	NA	MYO1D,TMEM98	MYO1D,ACCN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1D	22278	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr17	32200329	32200425	32200396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	379879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	32201845	32202055	32201932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	378249	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr17	33378276	33378529	33378387	Y	SLFN5,SLFN12L,ZNF830,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	35809	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34887	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	33868194	33868343	33868266	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,SLFN12L,CCL5	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34722	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	34227790	34227961	34227895	Y	SLFN12L,CCL5	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	21993	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr17	35078576	35079010	35078700	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRM1	122575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.40331227362731
chr17	35278050	35278157	35278104	Y	MRM1	AATF	LHX1,AATF	MCF7	ChIA-PET	22265404	AATF	26018	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	35608489	35608691	35608590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	156218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.956763315902818
chr17	37010933	37011093	37011014	Y	FBXO47,C17orf98	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	RPS20P35	1366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr17	37159505	37159646	37159582	Y	CWC25,FBXL20,CDK12,FBXO47	NA	PLXDC1,LOC100131347,MIR4727,CWC25,C17orf98,RPL23,LASP1,LOC100505576,FBXO47,FLJ43826,STAC2,RPL19,ARL5C,CACNB1,FBXL20,CDK12,PIP4K2B	IMR90	Hi-C	24141950	LASP1	135393	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	37751880	37751882	37751881	Y	NA	STARD3	NA	NA	NA	NA	STARD3	39436	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	37832582	37832871	37832624	Y	NA	STARD3,PNMT,PGAP3	NA	NA	NA	NA	PNMT	10348	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	37845270	37845675	37845499	Y	NA	PNMT,PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	PGAP3	5375	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr17	38227745	38227903	38227871	Y	NEUROD2,THRA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	12277	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	38229285	38229466	38229392	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	13817	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	38359505	38359802	38359637	Y	RARA	RAPGEFL1,WIPF2	CDC6,RARA,WIPF2	IMR90	Hi-C	24141950	WIPF2	13754	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	38477236	38480096	38479169	Y	IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	13792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	38481659	38482183	38482002	Y	IKZF3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	RARA	18215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	38502716	38503032	38502793	Y	NA	RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	GJD3	15035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	38509274	38509600	38509311	Y	NA	RARA,GJD3	NA	NA	NA	NA	GJD3	8467	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	38602883	38603101	38603015	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	5181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4,CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	14876	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr17	39705098	39705383	39705310	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	22538	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr17	39835188	39835696	39835517	Y	RAB5C,NKIRAS2,DHX58,EIF1	EIF1	SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,KRT19,EIF1,HAP1,JUP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF1	7441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510214358178326
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	40155760	40155995	40155877	Y	STAT5A	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	5405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	40418689	40419364	40419075	Y	EZH1,KLHL11,DNAJC7,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,RAB5C,STAT3,STAT3,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	GHDC,HCRT,KCNH4,RAB5C	IMR90	Hi-C	24141950	STAT5B	7361	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr17	40438296	40438586	40438441	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.811100275431341
chr17	40464466	40464885	40464704	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	26901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.736932023374125
chr17	40517094	40517456	40517393	Y	NA	STAT3	NA	NA	NA	NA	STAT3	21130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	40559988	40560462	40560227	Y	RAMP2,CNP	STAT3,PTRF,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	13073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	AC067852.1,NAGLU,HSD17B1,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	41198878	41199234	41199056	Y	NA	IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	RND2	23620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	41324260	41324525	41324381	Y	TMEM106A	BRCA1,NBR2,NBR1	NA	NA	NA	NA	NBR1	3762	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	NA	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP3	56868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.22970529653629
chr17	42365739	42366179	42366097	Y	UBTF,SLC4A1,SLC25A39	SLC4A1,SLC25A39	SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39,ATXN7L3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC4A1	22230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	42589268	42589584	42589359	Y	C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104	GPATCH8	ATXN7L3,GPATCH8	K562	ChIA-PET	22265404	GPATCH8	10470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH8	55222	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418159443831127
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	43095998	43096402	43096133	Y	NA	NMT1,DCAKD	NA	NA	NA	NA	NMT1	30576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	43221862	43221955	43221890	Y	ACBD4,HEXIM1	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM1	729	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.27249640335965
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	268397	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	43919032	43919225	43919129	Y	STH	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	50523	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	185731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.12026115791861
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63799073635982
chr17	44896658	44896796	44896753	Y	WNT3,WNT9B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	99125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	CDC27	120552	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	45282406	45282554	45282495	Y	NA	CDC27,MYL4,ITGB3	CDC27,MYL4	K562	ChIA-PET	22265404	MYL4	6594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	45352964	45353080	45353020	Y	WNT9B	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	23701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP6,SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	46079914	46080281	46080131	Y	NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2	CDK5RAP3,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP3	36738	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	80297	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	46318516	46318700	46318601	Y	SKAP1,HOXB4	NA	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	51009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	46569094	46569227	46569161	Y	CALCOCO2	HOXB-AS1	HOXB3,HOXB-AS3,HOXB6,HOXB5,SKAP1,HOXB2,HOXB4,HOXB9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOXB-AS1	49686	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	46643791	46644035	46643913	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6	NA	NA	NA	NA	HOXB4	11438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	46654606	46654947	46654902	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB4	526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7211	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.75660099475941
chr17	46696942	46697254	46696999	Y	NA	HOXB4,HOXB6,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	4585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,HOXB6,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	47049793	47049986	47049890	Y	IGF2BP1,SNF8	SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1	IGF2BP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IGF2BP1	22788	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr17	47113510	47113580	47113552	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	40736	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555547519068352
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	47468290	47468719	47468487	Y	ZNF652,ZNF652	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	21527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	47647130	47647802	47647650	Y	NA	NA	ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NGFR	76475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr17	47792509	47793110	47792630	Y	PPP1R9B,MYST2	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	8133	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	47815825	47816028	47815963	Y	MYST2,FAM117A,DLX4,DLX4	SLC35B1,KAT7,FAM117A	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	31449	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr17	49196679	49197214	49196965	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	453	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	55801190	55801558	55801374	Y	NA	NA	MSI2,AKAP1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS23	123859	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	56410599	56410851	56410735	Y	RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	56411173	56411562	56411307	Y	SRSF1,MTMR4,BZRAP1	MIR142,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281662523141555
chr17	56413212	56413667	56413409	Y	VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	1829	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.992930357010939
chr17	56417498	56417914	56417645	Y	MTMR4,HSF5	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	6115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	56419503	56419633	56419507	Y	OR4D2	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	8120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	MIR142,MIR4736	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr17	56441767	56441894	56441848	Y	NA	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	13313	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	56468859	56469318	56469005	Y	RNF43	SUPT4H1,RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	23638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	56744054	56744558	56744332	Y	SUPT4H1	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	NA	NA	NA	NA	RNU1-108P	1996	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr17	57298532	57298798	57298672	Y	NA	SMG8,GDPD1	NA	NA	NA	NA	GDPD1	2704	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr17	57908316	57908645	57908515	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	7982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	57925185	57925429	57925290	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	8558	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	57952277	57952457	57952367	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	15847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	58467674	58467818	58467746	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,APPBP2,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	30013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	59843979	59844190	59844083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRIP1	94692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	60058924	60058941	60058933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS2	55547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	60247601	60248070	60247921	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	106958	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr17	60250221	60250413	60250340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	109578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	60721967	60722242	60722046	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	19205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561,ACE	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	61779039	61779508	61779383	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	2507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	10653	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,TCAM1P	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr17	62174589	62174791	62174690	Y	NA	ERN1,SNORD104	ICAM2	IMR90	Hi-C	24141950	ERN1	31388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	62919203	62919414	62919306	Y	NA	LRRC37A3	LRRC37A3,RGS9	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC37A3	5605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	62958497	62958860	62958615	Y	NA	LRRC37A3,AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	10834	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	62981858	62982486	62982198	Y	DDX5,CEP95,GNA13	AMZ2P1	AMZ2P1,GNA13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AMZ2P1	12164	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	63019276	63019534	63019390	Y	RGS9,GNA13	AMZ2P1,GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	31423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.739211770488921
chr17	63169538	63169893	63169706	Y	RGS9	NA	NA	NA	NA	NA	GNA13	118581	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA13	588973	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2031499524839
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	102432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	64503657	64504241	64503882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	206903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	64544919	64545280	64544935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	248165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	65130860	65131108	65130984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HELZ	108997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	65220181	65220399	65220279	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	19706	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	65780558	65780827	65780693	Y	NA	BPTF	BPTF	IMR90	Hi-C	24141950	BPTF	38813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.21276164953963
chr17	66434083	66434422	66434387	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	17232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	67089514	67089753	67089674	Y	ABCA6	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA8	139981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	68033950	68033965	68033958	Y	NA	NA	KCNJ16,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	AC002539.1	89035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	68117312	68117458	68117416	Y	KCNJ2	AC002539.1	NA	NA	NA	NA	AC002539.1	5542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	68127333	68127525	68127373	Y	NA	AC002539.1	NA	NA	NA	NA	AC002539.1	4333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	85009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	71007352	71007521	71007427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	79330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr17	71529957	71530242	71530108	Y	SSTR2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	223643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	72247418	72247796	72247504	Y	NA	RPL38,CTD-2514K5.2,TTYH2	NA	NA	NA	NA	TTYH2	39765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	72782605	72783105	72782848	Y	CD300A,CD300LB,CD300C,CD300E,CD300LF,RAB37,RAB37,SLC9A3R1,SLC16A5,GGA3,TMEM104	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	11983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.893543492722807
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	73032786	73033119	73032977	Y	TSEN54,GGA3	ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5	NA	NA	NA	NA	KCTD2	6116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	73456599	73456615	73456608	Y	NA	KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	21359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	73850621	73850811	73850693	Y	GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65	NA	NA	NA	NA	WBP2	33	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	73854851	73855120	73855038	Y	GRB2,GRB2,C17orf109,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,ACOX1,UNC13D,WBP2	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	UNC13D,UNK,WBP2	IMR90	Hi-C	24141950	WBP2	4263	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr17	73860608	73860975	73860910	Y	NA	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	UNC13D,UNK,WBP2	IMR90	Hi-C	24141950	WBP2	10020	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	74195648	74195812	74195731	Y	UBE2O,AANAT,FBF1,RNF157,FAM100B	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	25075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293108390038257
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	74359249	74359572	74359412	Y	RHBDF2,SPHK1,SPHK1	SPHK1,PRPSAP1	PRPSAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPHK1	11093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	74496600	74496786	74496748	Y	NA	UBE2O,RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	74525125	74525268	74525197	Y	NA	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	29253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	74525744	74526079	74526045	Y	ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	29872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr17	75103651	75103906	75103737	Y	JMJD6,SRSF2	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	22853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.52236810930072
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	43555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	75318595	75318736	75318679	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	43944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474938471617856
chr17	75359988	75360125	75360083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	85337	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	75456086	75456409	75456172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	181435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	75468767	75469129	75469011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	194116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	75830749	75830836	75830793	Y	TMC8,TMC6	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	TMC8	294015	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	9.81024773443594
chr17	76151038	76151473	76151368	Y	SYNGR2,TMC8	TMC8,TMC6,C17orf99,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	C17orf99	10604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	76154299	76154669	76154484	Y	C17orf99	TMC8,TMC6,C17orf99,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	7970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC8,TMC6,C17orf99,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	76247000	76247249	76247129	Y	TMEM235	BIRC5,RP11-219G17.4	NA	NA	NA	NA	RP11-219G17.4	25324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	76254688	76254992	76254867	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,C17orf99,SOCS3,PGS1	BIRC5,RP11-219G17.4	NA	NA	NA	NA	RP11-219G17.4	17581	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.34218892724014
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	RP11-219G17.4	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-219G17.4	3600	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	RP11-219G17.4,SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219G17.4	37498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr17	76325206	76325964	76325662	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	28194	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	76384421	76384943	76384751	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	11700	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	76409170	76409735	76409347	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	36449	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr17	76412850	76413399	76413170	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	40129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.06576187724668
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03276573780101
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr17	78126105	78126434	78126234	Y	NA	EIF4A3	EIF4A3,CARD14,SLC26A11,SGSH	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4A3	7123	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510214358178326
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.31285639805346
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	78756741	78756888	78756815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	206510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr17	78992000	78992331	78992033	Y	C17orf56	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	14617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.40192368106016
chr17	79064673	79065032	79064884	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	57725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	79127170	79127523	79127264	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	67276	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	35205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	36737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	37096	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38277	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.391604099778736
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720879530925113
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	87742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr17	79375864	79375954	79375909	Y	DYSFIP1,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	94816	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr17	79399639	79399699	79399664	Y	GCGR,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78390	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	79439092	79439387	79439261	Y	PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	38702	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.628824616577916
chr17	79448388	79448678	79448571	Y	NPB,AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	29411	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03965211046811
chr17	79450324	79450444	79450386	Y	NA	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	27645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.865153978829445
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	79779684	79779899	79779792	Y	NA	FAM195B,PPP1R27,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	9279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465326774562126
chr17	79789691	79790066	79789800	Y	NA	FAM195B,PPP1R27,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	513	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	79925685	79926075	79926048	Y	TSPAN10	SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASPSCR1	6608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.481824844284962
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30253681677203
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	80079695	80079832	80079748	Y	NA	FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	25487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	80184723	80185021	80184926	Y	NA	CCDC57,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CCDC57	16017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CCDC57	20044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TEX19	17805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347162093436361
chr17	80303096	80303383	80303257	Y	NA	TEX19	DCXR,FOXK2,CSNK1D,SECTM1,CD7,C17orf101,UTS2R,TEX19,HEXDC,C17orf62,NARF	IMR90	Hi-C	24141950	TEX19	11740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr17	80330864	80331011	80330938	Y	NA	TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	15741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.89563996951565
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr17	80821463	80821609	80821520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	113523	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	159482	159743	159659	Y	CETN1	USP14	NA	NA	NA	NA	USP14	3099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr18	395862	395959	395924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	129812	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.591268982902648
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.68626637608976
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	RNU1-109P,YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.610046799740282
chr18	1888648	1888915	1888782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	566562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	46774	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	2854165	2854304	2854234	Y	NA	EMILIN2	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	EMILIN2	9137	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	2855586	2855865	2855617	Y	NA	EMILIN2	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	EMILIN2	10558	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	3015219	3015501	3015351	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2	LPIN2	LPIN2	K562	ChIA-PET	22265404	LPIN2	3906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYOM1,MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	3333671	3334067	3333870	Y	NA	NA	DLGAP1,TGIF1,MYL12B,FLJ35776	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYL12B	73764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.57896386676549
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.791876881319881
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr18	3639477	3639730	3639610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	229871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	3660906	3661002	3660956	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	251300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	3661317	3661540	3661407	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	251711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	3676188	3676369	3676278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	266582	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr18	3689767	3690120	3689945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	280161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	8912604	8912903	8912754	Y	NA	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	187725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	8916965	8917035	8917006	Y	NA	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	183593	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.738268755195602
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	8949015	8949649	8949122	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	150979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr18	9008810	9009212	9009095	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	91416	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01170817384857
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr18	9101793	9102110	9101852	Y	RAB12,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	NDUFV2	1165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347607670710187
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	9758210	9758472	9758414	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	52048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	TXNDC2	71437	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.52566990833876
chr18	9829152	9829470	9829321	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	TXNDC2	54293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr18	9835366	9835644	9835528	Y	NA	TXNDC2	NA	NA	NA	NA	TXNDC2	48119	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	9849459	9849859	9849589	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	TXNDC2	NA	NA	NA	NA	TXNDC2	33904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr18	9869849	9870152	9869995	Y	VAPA	TXNDC2,VAPA	NA	NA	NA	NA	TXNDC2	13611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354939620651119
chr18	9877272	9877635	9877453	Y	VAPA	TXNDC2,VAPA	NA	NA	NA	NA	TXNDC2	6128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr18	9899069	9899359	9899167	Y	NA	TXNDC2,VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	12640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428216718160683
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	TXNDC2,VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.2395793005439
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.304370986613
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	12880036	12880906	12880743	Y	NA	PTPN2	NA	NA	NA	NA	PTPN2	46736	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	19774212	19774351	19774284	Y	GATA6	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	491294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr18	20035500	20035848	20035676	Y	NA	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	340376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	20138967	20139156	20139093	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	237068	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	160326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr18	20913960	20914007	20913982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	101918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr18	21091625	21091887	21091629	Y	C18orf8	C18orf8	NA	NA	NA	NA	C18orf8	10152	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr18	32558962	32559433	32559316	Y	ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	4070	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	32622568	32623026	32622758	Y	ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	67676	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr18	32684186	32684352	32684206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr18	33038926	33039146	33039052	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	36809	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	34406593	34406898	34406790	Y	NA	KIAA1328,TPGS2	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr18	34915511	34915689	34915620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	508353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	38447528	38447658	38447616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1085513	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	42295257	42295574	42295401	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	37119	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	43210324	43210708	43210352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	334532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	43266827	43267110	43266932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	278130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309160882487267
chr18	43543003	43543287	43543010	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	1953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	43622844	43623013	43623010	Y	NA	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	27225	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281662523141555
chr18	46269539	46269878	46269723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	206122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	46324397	46324797	46324645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	260980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr18	46449093	46449527	46449211	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	385676	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	46740928	46741364	46741195	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	244353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	46753809	46754041	46753926	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	231676	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	47252630	47252839	47252704	Y	LIPG	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	85491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	19820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr18	47794579	47794725	47794639	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	11419	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	55108186	55108329	55108231	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	55250571	55250884	55250819	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	1120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr18	55255652	55255824	55255739	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	3648	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720433953651289
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	67285857	67286143	67286048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	585038	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM21	1277474	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	72452985	72453338	72453047	Y	C18orf63	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	189879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr18	72683878	72684340	72684028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234963	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	72835144	72835775	72835214	Y	NA	NA	ZNF407	IMR90	Hi-C	24141950	ZADH2	83528	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	305101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	75688457	75688848	75688673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	1138437	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.729600073433194
chr18	75697384	75697771	75697683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	1129514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.20782038865062
chr18	76737711	76738510	76737981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	88775	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr18	77552344	77552827	77552464	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	114543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr18	77558494	77558673	77558529	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	120693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,GZMM,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	604629	604764	604680	Y	THEG	BSG,HCN2,POLRMT	NA	NA	NA	NA	HCN2	16736	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347607670710187
chr19	661410	661735	661571	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PRSS57,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	133	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PRSS57,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PRSS57,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	791303	791398	791349	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3677	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr19	791656	792058	791976	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD	NA	NA	NA	NA	MIR3187	12073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.49397859540736
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	888565	888780	888647	Y	SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	MED16	2438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	907464	907615	907488	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CNN2,ARID3A,ABCA7,C19orf22	MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	3625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411273071164022
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr19	909116	909504	909461	Y	STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22	MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	1736	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	933164	933556	933549	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	9383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	951651	951841	951690	Y	NA	R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	27870	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr19	953220	953565	953383	Y	EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A	R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	27609	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.573434181358334
chr19	954903	955312	954982	Y	KISS1R,ARID3A	R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	25862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63799073635982
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.48622824407685
chr19	980601	980803	980725	Y	NA	WDR18,RNU6-2,CNN2	NA	NA	NA	NA	WDR18	371	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.34836741568155
chr19	1016614	1016952	1016783	Y	C19orf6	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	RNU6-2	2569	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	1140329	1140530	1140433	Y	NA	POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	31752	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.756155417485585
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.956763315902818
chr19	1400453	1400832	1400746	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	GAMT	884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	1632932	1633212	1633140	Y	STK11	MBD3,UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	17392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04881823025002
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	NA	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	75115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	NA	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP8B3	62725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356773790492092
chr19	1840916	1841078	1840939	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16	NA	NA	NA	NA	REXO1	5374	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.55764399586119
chr19	1856794	1856864	1856840	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4703	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3849800340635
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.683323897249846
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3492585702292
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.390661084485415
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	2719845	2720284	2720049	Y	JSRP1,TLE6,AES,GNG7,DIRAS1	GNG7,DIRAS1,SLC39A3	NA	NA	NA	NA	DIRAS1	429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77,TLE6	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.42070149789779
chr19	3153392	3153939	3153476	Y	GNA15,FZR1	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	29622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	3154006	3154458	3154241	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	29103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619212919522186
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr19	3484915	3485311	3484976	Y	NA	C19orf77,DOHH,FZR1	NA	NA	NA	NA	C19orf77	6375	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	3521162	3521389	3521298	Y	FZR1	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16891	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	2910	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.32246809510919
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr19	3671007	3671294	3671202	Y	NFIC,MAP2K2,EEF2,PIP5K1C,APBA3	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	27183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	3812391	3812689	3812466	Y	CCDC94,FZR1,APBA3,MATK,ZBTB7A	MATK	MATK	K562	ChIA-PET	22265404	MATK	12264	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	4123124	4123351	4123249	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	MAP2K2	NA	NA	NA	NA	MAP2K2	998	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291274220197285
chr19	4374109	4374366	4374283	Y	TICAM1,SEMA6B	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	24178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	LRG1	36802	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	4936813	4936840	4936828	Y	NA	UHRF1,KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	30285	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	4970760	4971027	4970931	Y	NA	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	3635	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	5091152	5091532	5091191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124027	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr19	5322399	5322569	5322473	Y	PTPRS	RPL32P34,PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	16245	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	5804044	5804378	5804211	Y	NA	DUS3L	NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUS3L	14795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	5968077	5968307	5968208	Y	NA	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7846	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	5989815	5989915	5989890	Y	SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	13662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	84805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.527158005174987
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr19	6111447	6111675	6111584	Y	SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	85908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	6276497	6276777	6276641	Y	NA	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	1182	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	48461	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	58264	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	6600003	6600291	6600148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF14	68308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	6601519	6601863	6601720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF14	66736	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	6674780	6675150	6675080	Y	DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	TNFSF14	NA	NA	NA	NA	TNFSF14	6181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr19	7456079	7456435	7456169	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1564	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,C19orf59,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	8051436	8051456	8051449	Y	NA	TIMM44,ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	17087	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.574325335905986
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr19	8593443	8593633	8593538	Y	NA	PRAM1,ZNF414,MYO1F	NA	NA	NA	NA	ZNF414	16395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	MYO1F,ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr19	9517572	9518021	9517955	Y	NA	ZNF266	NA	NA	NA	NA	ZNF266	26233	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	9903168	9903577	9903239	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	32915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	10317020	10317257	10317138	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4	DNMT1	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR2	22691	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	10346765	10347120	10347031	Y	TYK2,S1PR5,S1PR5,DNM2,ATG4D,ZNF846,FBXL12,C19orf66,PPAN,ICAM3	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4	NA	NA	NA	NA	DNMT1	6803	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	10526573	10526793	10526623	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	14359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	10529596	10529758	10529677	Y	NA	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	17382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	10862011	10862152	10862080	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	35256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	10949257	10949551	10949405	Y	CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	TMED1	4263	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	10988040	10988081	10988060	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	7851	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,RGL3	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,CCDC151,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ZNF653	21415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	11675625	11675958	11675811	Y	CCDC159,ACP5,ACP5	CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	ZNF627	7436	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	11878639	11879058	11878901	Y	NA	ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF441	2824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	12065633	12065838	12065735	Y	NA	ZNF700,ZNF763,CTD-2006C1.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2006C1.2	30594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	12131760	12131812	12131786	Y	NA	CTD-2006C1.2,ZNF433,ZNF878,ZNF844	NA	NA	NA	NA	ZNF433	12744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	12245844	12245929	12245887	Y	NA	ZNF788,ZNF20,ZNF625,ZNF136	NA	NA	NA	NA	ZNF20	3293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.699821966972681
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	12895349	12896178	12895559	Y	ZNF563,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	12994554	12994766	12994660	Y	ZNF490,MAN2B1,LYL1,DNASE2,KLF1	HOOK2,DNASE2,KLF1,GCDH,SYCE2,FARSA	NA	NA	NA	NA	KLF1	1229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	13129050	13129163	13129107	Y	MAST1,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	24628	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	13180372	13180812	13180634	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1	NA	NA	NA	NA	LYL1	31163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.08684661708336
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.976432287288103
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364551317706849
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354939620651119
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	14126359	14126500	14126444	Y	NANOS3,IL27RA	RFX1,IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	10508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	14241315	14241555	14241521	Y	NA	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	4213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	14466734	14466953	14466791	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	CD97	LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97	IMR90	Hi-C	24141950	CD97	22360	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	14467223	14467368	14467308	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	CD97	LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97	IMR90	Hi-C	24141950	CD97	21945	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	14485924	14486626	14486057	Y	NA	CD97,DDX39A	DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	2687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	14545712	14545849	14545765	Y	NDUFB7,PKN1	DDX39A,PKN1,PTGER1	NA	NA	NA	NA	PKN1	3847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	14545997	14546246	14546106	Y	NA	DDX39A,PKN1,PTGER1	NA	NA	NA	NA	PKN1	4132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	14665322	14665552	14665478	Y	SLC1A6	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	15322	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	14895618	14895793	14895687	Y	CD97,DDX39A,PKN1,DNAJB1,EMR3,ZNF333,EMR2	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	5328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NA	NA	NA	NA	NA	ILVBL	99498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	15666666	15666804	15666739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F3	82903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F2	58811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602269272525524
chr19	16085655	16086068	16085771	Y	TPM4	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F2	78725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	16462018	16462188	16462137	Y	CIB3	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	28390	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	16998454	16998573	16998467	Y	NA	F2RL3	NA	NA	NA	NA	F2RL3	783	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr19	17225282	17225997	17225467	Y	SIN3B,CPAMD8	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	40691	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr19	17371801	17372164	17371849	Y	NXNL1,GTPBP3	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,MRPL34,DDA1,ABHD8	NR2F6	K562	ChIA-PET	22265404	BABAM1	3995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	18064785	18064952	18064869	Y	NA	CCDC124,KCNN1,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	KCNN1	4683	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.5546882698279
chr19	18155923	18156099	18156029	Y	NA	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	45982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363660163159197
chr19	18393747	18393881	18393780	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	MIR3188	2860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.43196409447254
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555547519068352
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.27414730287867
chr19	18430446	18430898	18430653	Y	ARRDC2,IL12RB1,IFI30,LRRC25	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	1186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401215796834466
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,LRRC25,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.63799073635982
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	LRRC25	8450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.49353301813353
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.24924285834529
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.12848426240719
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555101941794526
chr19	18603161	18603534	18603395	Y	NA	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	27403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	19192588	19193136	19192878	Y	NA	SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SLC25A42	19780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	19248225	19248392	19248286	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	19562909	19563265	19563209	Y	RFXANK,MEF2BNB,MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	61280	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	19571175	19572073	19571752	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	52472	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF90	23551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	20337633	20337845	20337749	Y	ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF486	61596	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	21505293	21505670	21505490	Y	ZNF429,ZNF708,ZNF493	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	4557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	21511296	21511520	21511376	Y	NA	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	1069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	21689202	21689645	21689487	Y	ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	11718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr19	23971294	23971621	23971458	Y	NA	ZNF681,RPSAP58	NA	NA	NA	NA	RPSAP58	27487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	28252920	28253113	28253061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	28914991	28915131	28915061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	787317	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	28917737	28917979	28917845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	784469	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	29093592	29093747	29093670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	608701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	29096561	29096764	29096663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	605684	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.629270193851742
chr19	29104448	29104951	29104611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	597497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.74953135177035
chr19	29109267	29109431	29109349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	593017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	30206961	30207337	30207149	Y	NA	C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	2597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	30207596	30207744	30207670	Y	NA	C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	3232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr19	32842918	32843112	32843016	Y	ZNF507	ZNF507	NA	NA	NA	NA	ZNF507	8418	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	32866000	32866258	32866129	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	DPY19L3	28191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	33541924	33542310	33542117	Y	NA	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	11484	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	33664629	33664677	33664651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH1	94843	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH1	98322	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	33784292	33784447	33784359	Y	CEBPG,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	7023	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	33796303	33796393	33796348	Y	SLC7A9,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	4833	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	33963951	33964351	33964166	Y	NA	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	46349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr19	34841130	34841321	34841272	Y	LSM14A,KIAA0355	GPI	NA	NA	NA	NA	GPI	7064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.420439190945926
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	35453242	35453666	35453504	Y	ZNF792	ZNF30,ZNF792,GRAMD1A	NA	NA	NA	NA	ZNF792	289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr19	35494139	35494542	35494364	Y	NA	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	10451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.61125212198547
chr19	35696373	35696472	35696417	Y	FFAR1,CD22,USF2	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	40761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	36400295	36400642	36400477	Y	FFAR2,MLL4,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP	NFKBID,HCST,TYROBP,LRFN3	NA	NA	NA	NA	TYROBP	3098	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	36757480	36757645	36757542	Y	NA	ZNF565	ZNF146	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF565	22321	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.873874521337522
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	37171128	37171323	37171227	Y	NA	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	ZNF383,ZNF461,ZNF567,ZNF850	IMR90	Hi-C	24141950	AC074138.3	5028	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr19	37408041	37408149	37408081	Y	ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF790	68352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	37942009	37942313	37942161	Y	ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569	ZNF570,ZNF569	NA	NA	NA	NA	ZNF570	14174	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	ZNF570,ZNF569	NA	NA	NA	NA	ZNF570	3160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	38717073	38717581	38717079	Y	NA	DPF1,PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	DPF1	773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	38807798	38808031	38807971	Y	MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	KCNK6	453	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.722792737396
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	39453898	39453904	39453901	Y	NA	MRPS12,SARS2,FBXO17	NA	NA	NA	NA	FBXO17	10646	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	39755176	39755398	39755266	Y	ZFP36	NA	NA	NA	NA	NA	GMFG	75614	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	39801345	39801461	39801375	Y	NA	GMFG,SAMD4B	NA	NA	NA	NA	GMFG	29551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.71082225659556
chr19	39810585	39810976	39810672	Y	CLC,LRFN1	GMFG,SAMD4B	NA	NA	NA	NA	GMFG	20036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	40473949	40474218	40474067	Y	ZNF546,FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546	NA	NA	NA	NA	PSMC4	694	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.747434874977506
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.582102863120743
chr19	40951707	40952008	40951966	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	3095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr19	40969437	40969789	40969613	Y	BLVRB	SERTAD1,SERTAD3,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	BLVRB	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	41120897	41121111	41120992	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	24108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.411273071164022
chr19	41170823	41170969	41170914	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	23908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	41226531	41226793	41226653	Y	PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B	NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA	NA	NA	NA	NA	ADCK4	4419	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	42432096	42432209	42432128	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	29333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.839489789324705
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	NA	RABAC1	53077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	POU2F2,DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	POU2F2	5462	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67625425426078
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33137190793922
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337550396380631
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.98331865995521
chr19	44140740	44141114	44140925	Y	ZNF223,ZNF221,LYPD5,ZNF428,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR	NA	NA	NA	NA	CADM4	877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr19	44284114	44284247	44284152	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.857822028888514
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.591268982902648
chr19	44308607	44308871	44308732	Y	CADM4	KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	ZNF283	20573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.27598147271964
chr19	45447166	45447474	45447219	Y	NA	APOE,CLPTM1	NA	NA	NA	NA	CLPTM1	8368	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	45803954	45804164	45804074	Y	NA	KLC3	NA	NA	NA	NA	KLC3	30528	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	PPP1R13L	24386	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.992930357010939
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr19	46379598	46379943	46379895	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	7433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.737823177921776
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	7192	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,PTGIR,GNG8,DACT3	NA	NA	NA	NA	GNG8	6253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	47221635	47221817	47221775	Y	ZC3H4,PRKD2	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	PRKD2	3251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.673712200194116
chr19	47458912	47459233	47458939	Y	ZC3H4,CCDC9	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS1	61844	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr19	47613894	47614902	47614503	Y	PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	47744387	47744529	47744512	Y	SLC8A2	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	10364	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.27668935694533
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.68403178147554
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	31401	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	47833817	47834081	47833932	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16457	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,KPTN	NA	NA	NA	NA	MEIS3	29420	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr19	48395340	48395779	48395530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23AP80	99193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr19	48642255	48642637	48642446	Y	NA	PLA2G4C,LIG1	NA	NA	NA	NA	LIG1	29223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	48761702	48761955	48761773	Y	CARD8,CARD8,RASIP1,CYTH2,EMP3,CCDC114	CARD8	NA	NA	NA	NA	CARD8	4499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,SYNGR4,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328829853872553
chr19	48927915	48927964	48927940	Y	NA	KDELR1,GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	GRWD1	19066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474938471617856
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.15878698277145
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.56202021976883
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	26338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr19	49698080	49698342	49698211	Y	NA	HRC,TRPM4	NA	NA	NA	NA	TRPM4	39082	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	50231635	50231822	50231729	Y	NA	AP2A1	NA	NA	NA	NA	AP2A1	36403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465772351835952
chr19	50835103	50835475	50835356	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	KCNC3	331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720879530925113
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.865153978829445
chr19	50888786	50889179	50888984	Y	ACPT,LOC342918	POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	3325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	50990086	50990332	50990328	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	12076	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr19	51003635	51004295	51004006	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	8315	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9014	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr19	51068838	51069258	51069152	Y	NA	LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	44	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	51104864	51105235	51104932	Y	NA	LRRC4B,C19orf81	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	35562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	51111018	51111676	51111369	Y	NA	LRRC4B,C19orf81	NA	NA	NA	NA	C19orf81	39026	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	51166998	51167396	51167198	Y	KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918	C19orf81,SYT3	NA	NA	NA	NA	SYT3	2255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr19	51898753	51899047	51898851	Y	SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1	ETFB	NA	NA	NA	NA	ETFB	31081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.610046799740282
chr19	51944053	51944530	51944252	Y	SIGLEC9,SIGLEC7,ZNF649,ZNF175,SIGLEC6,SIGLEC10	CEACAM18	NA	NA	NA	NA	CEACAM18	33308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr19	51944873	51945376	51945168	Y	NA	CEACAM18	NA	NA	NA	NA	CEACAM18	32462	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	51971340	51971606	51971413	Y	ZNF613,SIGLEC7,CD33,ZNF649,ZNF175,SIGLEC6,SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12	CEACAM18,SIGLEC12	NA	NA	NA	NA	CEACAM18	6232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.55838327319341
chr19	51971719	51972098	51971894	Y	ZNF613,SIGLEC7,ZNF649,ZNF175,SIGLEC6,SIGLEC8	CEACAM18,SIGLEC12	NA	NA	NA	NA	CEACAM18	5740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.610046799740282
chr19	51972517	51972837	51972747	Y	NA	CEACAM18,SIGLEC12	NA	NA	NA	NA	CEACAM18	5001	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.66918461127172
chr19	52049983	52050318	52050095	Y	ZNF615,SIGLEC7,CD33,SIGLEC8,SIGLEC6,ZNF175	SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175	ZNF175,CEACAM18	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SIGLEC6	16873	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.609601222466456
chr19	52051082	52051228	52051165	Y	ZNF615,ZNF614,CD33,SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF649,ZNF175	SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175	ZNF175,CEACAM18	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SIGLEC6	17972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr19	52051924	52052067	52051980	Y	ZNF175	SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175	ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5	IMR90	Hi-C	24141950	SIGLEC6	18814	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.71485911574354
chr19	52052884	52053120	52052983	Y	NA	SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175	ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF175	19431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	12.9200379460584
chr19	52053461	52053588	52053498	Y	NA	SIGLEC6,ZNF175	ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF175	18963	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20131578264293
chr19	52054305	52054840	52054378	Y	SIGLEC12,SIGLEC12	SIGLEC6,ZNF175	ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF175	17711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr19	52068853	52069119	52068985	Y	SIGLEC7,CD33,SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175	SIGLEC6,ZNF175	NA	NA	NA	NA	ZNF175	3432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E,HAS1	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.10148334108097
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E,HAS1	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E,HAS1	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	94	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E,HAS1	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E,HAS1	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	MIRLET7E,HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	4069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	52299371	52299818	52299543	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	FPR3,FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR3	2955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.35842469001111
chr19	52302339	52303044	52302768	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	FPR3,FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	2319	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	52303612	52304072	52303819	Y	SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175,FPR3	FPR3,FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	1291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr19	53132219	53132465	53132335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	59284	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	53660263	53660559	53660411	Y	NA	ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF347	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.813380022546138
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM	NA	NA	NA	NA	MYADM	6258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	55038222	55038527	55038355	Y	NA	NA	KIR3DX1	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP5	55811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	55540419	55540558	55540460	Y	SHISA7,KIR2DL3,NCR1	GP6,RDH13	NA	NA	NA	NA	GP6	7074	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	55600172	55600429	55600236	Y	NA	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	RDH13	19513	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13,TNNI3	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C,TNNI3	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr19	55629952	55630354	55629995	Y	NA	RDH13,PPP1R12C,TNNI3	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	3025	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281662523141555
chr19	55787779	55788010	55787914	Y	KIR3DL1,KIR2DS4,KIR3DL2,NCR1,ZNF628,SUV420H2,EPN1,PPP6R1	PPP6R1,HSPBP1,BRSK1	NA	NA	NA	NA	HSPBP1	1739	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	56098668	56099098	56098905	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	8457	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.50662978454925
chr19	56623049	56623274	56623140	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	7375	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	56698517	56698525	56698522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF444	56549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr19	56789143	56789486	56789342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	87982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	80532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZNF542,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZNF542	45824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	56833034	56833496	56833435	Y	ZSCAN5A	ZNF542,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZNF542	43972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	57980425	57980680	57980553	Y	NA	ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	6258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551,ZNF154	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	58218479	58218613	58218485	Y	ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154	ZNF551,ZNF671,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF154	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	44565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	58784706	58785064	58784920	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	NA	NA	NA	NA	ZNF8	3254	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr19	58788473	58788748	58788728	Y	NA	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22	NA	NA	NA	NA	ZNF8	155	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.10219122530667
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	MGC2752	3527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581657285846918
chr2	3226904	3227345	3227045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	152308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	6903255	6903557	6903407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSAD2	100380	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	7081985	7082191	7081999	Y	NA	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	26462	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	7191649	7191931	7191786	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	136126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	8743061	8743194	8743128	Y	ID2	AC011747.4	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011747.4	21139	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	8872785	8872976	8872902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.7	52792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM17	52334	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.35957815151063
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr2	10418251	10419155	10418675	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	21860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	10441145	10441558	10441458	Y	KLF11	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	10489892	10489997	10489924	Y	HPCAL1	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	48877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.473104301776883
chr2	10950898	10951279	10951023	Y	NA	PDIA6	ATP6V1C2	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA6	24824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	64464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.472658724503057
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	AC096559.1	NA	NA	NA	NA	AC096559.1	16136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	12417696	12417905	12417812	Y	TRIB2	NA	LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	AC096559.1	430948	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	12.6749361805531
chr2	12466136	12466597	12466183	Y	TRIB2	NA	LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	388418	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	12596433	12596805	12596535	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	258210	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	12633247	12633315	12633291	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	221700	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293108390038257
chr2	12703835	12703993	12703936	Y	NA	NA	TRIB2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	151022	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr2	15339978	15339997	15339988	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	359457	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	15570627	15571117	15570982	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	128337	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	15594564	15594826	15594695	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	104628	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	15700375	15700622	15700454	Y	DDX1,NBAS	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	NBAS	921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	17005594	17005646	17005620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	159995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	519354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	19986322	19986559	19986384	Y	TTC32	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	80062	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	195	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	20252703	20252899	20252848	Y	NA	LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	2914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	NA	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	136494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382437979996831
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	20817015	20817334	20817182	Y	RHOB,GDF7	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	31515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	24234264	24234694	24234378	Y	MFSD2B	MFSD2B,C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	MFSD2B	3313	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.656768553197455
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	62972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	25021346	25021618	25021482	Y	NA	CENPO,PTRHD1	NA	NA	NA	NA	PTRHD1	7095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	25193628	25193634	25193631	Y	NA	DNAJC27-AS1,DNAJC27	NA	NA	NA	NA	DNAJC27	665	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	25482494	25482888	25482692	Y	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	80571	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	26259161	26259559	26259360	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	4185	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	26291590	26291772	26291648	Y	FAM59B,RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	36614	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr2	26567616	26567683	26567653	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	2	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	26605539	26605826	26605756	Y	RAB10	GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	37854	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	37818	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.746098143156028
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	28582195	28582710	28582283	Y	NA	FOSL2	NA	NA	NA	NA	FOSL2	30605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	29674441	29674554	29674498	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	558932	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	30063514	30063882	30063849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL5	303925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	30414681	30414956	30414777	Y	NA	YPEL5,LBH	LCLAT1,LBH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LBH	37441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	33702756	33702976	33702846	Y	RASGRP3,RASGRP3	RASGRP3	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	43365	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	37139828	37140219	37140054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	51396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	37308622	37308977	37308800	Y	NA	HEATR5B	NA	NA	NA	NA	HEATR5B	508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	200099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	37788822	37789049	37788928	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	174562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.3836186173806
chr2	37797953	37798358	37798079	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	165253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	37811087	37811457	37811150	Y	NA	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	152154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	37843563	37844180	37844009	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	119431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	37885188	37885619	37885408	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	77992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	38049848	38050212	38050057	Y	QPCT,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,LOC100505876,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	86237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	38334903	38335105	38334999	Y	NA	NA	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P12	121605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	82480	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	38735582	38735946	38735766	Y	NA	RPLP0P6	ATL2,GALM,SRSF7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPLP0P6	28662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	38840461	38840529	38840511	Y	GALM	NA	GALM,HNRPLL,ATL2,SRSF7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GALM	50523	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	42359577	42359846	42359732	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	34644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr2	43151826	43152270	43152066	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	299478	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	43152648	43152978	43152751	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	298770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	43153788	43153898	43153799	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	297850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	43195156	43195444	43195331	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	256304	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619658496796012
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	182425	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.18576072821341
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012354.8	56383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	45811183	45811373	45811272	Y	NA	SRBD1	NA	NA	NA	NA	SRBD1	25931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	46483860	46484088	46483965	Y	RHOQ	EPAS1	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	34718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	47210404	47210621	47210509	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	43410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	47463585	47463776	47463681	Y	NA	NA	CALM2,TTC7A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALM2	61845	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	70453	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr2	48373241	48373406	48373298	Y	FOXN2	NA	FOXN2,PPP1R21	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN2	166370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	54165408	54165630	54165519	Y	NA	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	ACYP2	30345	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	54330282	54330384	54330333	Y	NA	NA	SPTBN1,RTN4,EML6,ACYP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSME4	134305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL6	306094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.57387975863216
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL6	315515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	54800045	54800558	54800206	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL6	318636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr2	55327095	55327368	55327210	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	10389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr2	55364745	55365096	55365046	Y	NA	RTN4	RTN4,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	26988	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	55687761	55687975	55687969	Y	NA	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	CCDC88A	42704	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	56344982	56345239	56345001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	195708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	58938057	58938367	58938299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	471550	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	59955397	59955917	59955602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	653823	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	60228228	60228402	60228315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	381338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	61126778	61127091	61126822	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	9347	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	61207503	61207627	61207564	Y	NA	PEX13,PUS10	NA	NA	NA	NA	PEX13	34733	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.37397974444062
chr2	62424513	62424632	62424578	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	3265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	62531997	62532204	62532030	Y	B3GNT2	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	110749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	63633298	63633304	63633301	Y	OTX1	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	180439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	64291243	64291430	64291349	Y	NA	VPS54	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	VPS54	47037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.858267606162339
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	65609993	65610402	65610168	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	47369	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.354939620651119
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	68432380	68432395	68432387	Y	NA	WDR92,PNO1,PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	48974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	68997602	68997807	68997698	Y	PLEK,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	BMP10	98842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	17159	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	69852685	69852770	69852748	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	16787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	69888349	69888615	69888483	Y	NA	ANXA4,AAK1	NFU1,AAK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AAK1	10866	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	70202880	70203539	70203203	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	15483	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	70285414	70285703	70285559	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	26882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	70296121	70296604	70296392	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	15981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	70331843	70331986	70331900	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	4160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.874765675885175
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	71679813	71679928	71679869	Y	NAGK,ZNF638,DYSF	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF638	178122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	71819414	71819502	71819458	Y	PAIP2B,DYSF	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF638	317723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	73402910	73403369	73403123	Y	SFXN5	RAB11FIP5,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	21061	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	74259703	74260366	74260024	Y	NA	AC073046.25,TET3	TET3,ACTG2,BOLA3	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	31863	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr2	74298270	74298885	74298717	Y	MOBKL1B	FNBP1P1	NA	NA	NA	NA	FNBP1P1	46922	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	74408934	74409182	74409080	Y	NAT8B,TET3,MOBKL1B	BOLA3,BOLA3-AS1,MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MOB1A	4909	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	74765672	74765911	74765792	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	LBX2,PCGF1,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	DOK1	8242	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	43077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	78328146	78328439	78328293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	314638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	78401270	78401306	78401289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	387762	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	78525487	78525634	78525561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	511979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr2	84106267	84106552	84106366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	578617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr2	85057054	85057454	85057405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	73295	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr2	86221169	86221618	86221314	Y	NA	NA	POLR1A,ST3GAL5,LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	107032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	86224309	86224458	86224357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr2	86224674	86224821	86224747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	106457	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491882118614517
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	96995983	96996007	96995995	Y	ITPRIPL1,ITPRIPL1	SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	3518	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	97012594	97012961	97012778	Y	ASTL	SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	13069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	97540190	97540589	97540281	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	5696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	97561594	97561991	97561828	Y	FAM178B	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	27100	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	97565299	97565614	97565457	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	30805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	97587789	97588030	97587916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	53295	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.59187736285926
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	99250910	99251133	99251091	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	27868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	28407	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	139	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	101010496	101010959	101010820	Y	AFF3	CHST10	NA	NA	NA	NA	CHST10	21159	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	101270237	101270473	101270387	Y	RPL31	NA	NPAS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDCL3	93085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	101922226	101922443	101922331	Y	NA	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	101922561	101923216	101923063	Y	NA	SNORD89	NA	NA	NA	NA	RNF149	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	102399741	102400097	102399970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	88429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	103038381	103038663	103038448	Y	IL1R2,IL18RAP	NA	NA	NA	NA	NA	IL18R1	112392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr2	103280963	103281189	103281017	Y	IL1RL2,SLC9A2	SLC9A2	NA	NA	NA	NA	SLC9A2	46797	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	103390349	103390733	103390541	Y	NA	MFSD9,TMEM182	NA	NA	NA	NA	TMEM182	38982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	105664202	105664255	105664229	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	11761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	106417583	106417937	106417755	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	58229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	109648298	109648660	109648428	Y	LIMS1,RANBP2	NA	MALL,EDAR	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC138	247085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	113058633	113059002	113058901	Y	NA	ZC3H8,ZC3H6	NA	NA	NA	NA	ZC3H6	27462	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	113341105	113341247	113341152	Y	POLR1B	POLR1B,CHCHD5,AC079922.2	NA	NA	NA	NA	CHCHD5	1288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	113388786	113388926	113388836	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	11042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	113398370	113398650	113398523	Y	NA	AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	2784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr2	113444240	113444400	113444290	Y	NA	SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	42806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364551317706849
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	47169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	113551784	113552157	113551927	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CKAP2L	31530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	CKAP2L	137517	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	114644100	114644364	114644199	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1173	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	114652011	114652405	114652035	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	6474	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	DPP10	NA	NA	NA	NA	DPP10	20172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	118578074	118578451	118578195	Y	CCDC93,DDX18	DDX18	NA	NA	NA	NA	DDX18	7848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	118737562	118738119	118738029	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	31590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	223627	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	120887789	120888032	120887910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	90952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	122994452	122994784	122994618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	501773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	127416778	127417376	127416886	Y	NA	GYPC	NA	NA	NA	NA	GYPC	5269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	ERCC3	134317	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	NA	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	128761594	128761964	128761779	Y	NA	SAP130	NA	NA	NA	NA	SAP130	21730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	130928401	130928722	130928538	Y	NA	MZT2B,SMPD4	NA	NA	NA	NA	MZT2B	8588	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	131110123	131110429	131110276	Y	NA	IMP4,CCDC115,PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	1151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.356773790492092
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	363500	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr2	132152335	132152426	132152381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBA3D	79240	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	133914495	133914622	133914567	Y	NCKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	960932	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	135931129	135931440	135931285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3GAP1	123294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	139289140	139289372	139289256	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	31769	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	911578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.05615018019095
chr2	143451325	143451501	143451413	Y	NA	NA	KYNU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KYNU	181566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.600880679958378
chr2	144499811	144499873	144499842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	588262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	144941420	144941641	144941519	Y	GTDC1,ZEB2,GTDC1,GTDC1	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	146494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03093156796003
chr2	145215157	145215664	145215657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	64483	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	145338212	145338608	145338410	Y	NA	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	ZEB2	58065	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	145423698	145423921	145423827	Y	GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	143551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	145439912	145440212	145440023	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	159765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	146450569	146451281	146450882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	357771	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr2	149633974	149634183	149633979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	233965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144449.1	219134	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.36649642948494
chr2	150314581	150314916	150314749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144449.1	126794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.50359029246309
chr2	152159553	152159620	152159604	Y	TNFAIP6	RBM43,NMI	RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NMI	14982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	152789657	152790028	152790018	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	106651	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	156219806	156220106	156219936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	976754	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.718599783810316
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.33671832302443
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	44105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	5821	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.30421962159825
chr2	158118717	158119062	158118890	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	6607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr2	159749466	159749905	159749830	Y	NA	NA	LY75-CD302,TANC1,WDSUB1,BAZ2B	IMR90	Hi-C	24141950	WDSUB1	391405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	161951172	161951432	161951220	Y	NA	TANK	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	TANK	39987	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	162565636	162565807	162565722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	369799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	165683192	165683287	165683237	Y	NA	COBLL1	NA	NA	NA	NA	COBLL1	14902	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	166779898	166780276	166780103	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	28077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	167269953	167270071	167269980	Y	NA	SCN9A	NA	NA	NA	NA	SCN9A	39450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	168714852	168714864	168714859	Y	B3GALT1	NA	NA	NA	NA	NA	AC016723.4	80790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	170441657	170442069	170441908	Y	NA	FASTKD1,PPIG	NA	NA	NA	NA	PPIG	2807	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr2	171112437	171112843	171112772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	430469	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	171222273	171222592	171222467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP5	347269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.40656221191968
chr2	171623254	171623407	171623331	Y	NA	AC007405.4,AC007405.6,GAD1	NA	NA	NA	NA	AC007405.4	1869	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	171977769	171978174	171977980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	107650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	171997679	171997950	171997833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	87874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	172747551	172747817	172747684	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	29141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	172792873	172793084	172792979	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	15915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	173116941	173117298	173117012	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	151313	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	173117910	173118399	173118084	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	152282	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	173941754	173942308	173942062	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	MLK7-AS1	202456	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	174776201	174776462	174776332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	51968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	179471296	179471384	179471314	Y	TTN	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	87386	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	180871045	180871158	180871103	Y	NA	CWC22	NA	NA	NA	NA	CWC22	1205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	181749072	181749389	181749231	Y	NA	FTH1P20	NA	NA	NA	NA	FTH1P20	12931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	183876955	183877317	183877185	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	24269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr2	183950583	183950613	183950599	Y	NA	NCKAP1,DUSP19,NUP35	NA	NA	NA	NA	DUSP19	9296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	187922387	187922712	187922454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007319.1	56440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	188340607	188340894	188340852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	87593	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	188414787	188415077	188415012	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	13410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35999	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	189194773	189194794	189194784	Y	NA	GULP1	NA	NA	NA	NA	GULP1	40377	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	189391407	189391613	189391501	Y	GULP1	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	237011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	190477917	190478080	190477982	Y	NA	SLC40A1,ASNSD1	SLC40A1,WDR75,ASNSD1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC40A1	31433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	12229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBCH	130946	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr2	191324757	191324843	191324828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD6	53676	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	192430419	192430599	192430542	Y	NA	NA	TMEFF2,OBFC2A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC098617.1	278666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	192436242	192436430	192436383	Y	OBFC2A	NA	TMEFF2,OBFC2A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC098617.1	272835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	205616	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	192540623	192541368	192540746	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	167897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	164033	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	146347	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	192707967	192708344	192708338	Y	NA	AC098617.1,SDPR	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	192717272	192717408	192717316	Y	NA	AC098617.1,SDPR	NA	NA	NA	NA	SDPR	7291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	192889960	192890123	192890039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	179979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	1432402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	196278119	196278504	196278172	Y	NA	NA	SLC39A10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A10	160197	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	196336170	196336186	196336178	Y	NA	NA	SLC39A10	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC39A10	102515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	197188373	197188663	197188518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC020571.3	65625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	198774163	198774487	198774325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL1	106737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr2	198834136	198834535	198834225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL1	166710	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	200209653	200209909	200209897	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	110514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr2	201397001	201397079	201397012	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	14494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	201403171	201403461	201403317	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	20664	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr2	201922447	201922672	201922559	Y	NA	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3	ORC2	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB3	11484	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.08315110151716
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	16486	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr2	202104378	202104489	202104432	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	8212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	203131534	203131826	203131673	Y	FAM117B,NOP58	SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	3095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	507561	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	208176046	208176541	208176319	Y	CREB1,CCNYL1	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	215920	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	192605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	208368128	208368502	208368141	Y	CREB1	CREB1	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	23959	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	211406237	211406446	211406310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	65861	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	216158816	216158951	216158871	Y	NA	ATIC	ATIC,ABCA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATIC	15589	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	216483720	216484034	216483877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FN1	184825	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	216698635	216698894	216698754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	197925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	216867934	216868318	216868147	Y	TMEM169	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	28501	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	217797120	217797464	217797294	Y	NA	NA	DIRC3,TNP1,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	323438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	217954839	217955031	217954913	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	481157	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	496806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr2	218018283	218018714	218018395	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	544601	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr2	218019781	218019880	218019809	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	546099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr2	218083635	218083865	218083750	Y	NA	NA	DIRC3,TNP1,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	609953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	219198042	219198221	219198149	Y	CXCR2,ARPC2,ARPC2,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1	TMBIM1,AC021016.7,AC021016.6	NA	NA	NA	NA	AC021016.7	18577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.829878092268973
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	AC021016.6,CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	VIL1	9441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.32042347906201
chr2	220374836	220375176	220374958	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF	NA	NA	NA	NA	GMPPA	13247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2929251197163
chr2	222305020	222305156	222305087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	1213900	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	FARSB	691645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	223757137	223757389	223757313	Y	NA	ACSL3	NA	NA	NA	NA	ACSL3	33485	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr2	224079705	224079957	224079831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	356053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	224452508	224452858	224452683	Y	SCG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	247886	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	131064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	224751909	224752110	224752042	Y	WDFY1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	51165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	224761528	224761781	224761678	Y	WDFY1	WDFY1	NA	NA	NA	NA	WDFY1	46323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	24291	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr2	231277179	231277351	231277276	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	231523565	231523670	231523633	Y	GPR55,SP110,SP140	NA	CAB39	K562	ChIA-PET	22265404	CAB39	51890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr2	231523854	231524330	231524235	Y	GPR55,SP110,SP140,SP140L,CAB39	NA	CAB39	K562	ChIA-PET	22265404	CAB39	51230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.69458649382459
chr2	231822084	231822525	231822233	Y	GPR55	NA	NA	NA	NA	NA	ITM2C	94730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	231965808	231966135	231965987	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	46230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446994534998318
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	232580827	232581056	232580891	Y	NA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	11222	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	232840477	232840577	232840527	Y	DIS3L2	DIS3L2	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	16522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	233563344	233563704	233563468	Y	NA	GIGYF2	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	3335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr2	238066036	238066584	238066320	Y	MLPH,COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	73576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	238581844	238582251	238582110	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	47625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	238832423	238832667	238832502	Y	NA	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	40802	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	239330884	239331265	239331162	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	2118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.59939258312215
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.43031319495353
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr2	240199614	240199929	240199643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	121201	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr2	240238754	240239047	240238989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	82083	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.564713638850256
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	NA	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV2	116345	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	241431316	241431521	241431419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC1	58228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr2	241719463	241720148	241720097	Y	ANKMY1,AQP12B,AQP12A,KIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN10	195330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	483361	483443	483402	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	CSNK2A1	39022	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	623135	623319	623297	Y	NA	TCF15,SRXN1,SCRT2	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8695	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr20	623492	623974	623709	Y	NA	TCF15,SRXN1,SCRT2	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	652993	653392	653352	Y	NA	SRXN1,SCRT2	NA	NA	NA	NA	SCRT2	1431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	37961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	1415597	1415981	1415837	Y	NA	FKBP1A,NSFL1C	FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NSFL1C	36506	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	2295693	2295966	2295830	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD119	145717	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	2851057	2851398	2851292	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	8227	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	3779808	3780100	3779895	Y	PANK2,PANK2,CDC25B	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	14230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.527603582448813
chr20	4018656	4019040	4018859	Y	PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	16104	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr20	4045309	4045541	4045432	Y	C20orf27,CENPB,C20orf29	FTLP3	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	42757	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	4063526	4063882	4063813	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35745	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	4063933	4064413	4064294	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35214	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	4072203	4072410	4072307	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	27217	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	4203123	4203484	4203336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	103496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr20	5059148	5059500	5059412	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	45772	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0144334982372
chr20	5739573	5739619	5739595	Y	PROKR2	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10534	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	466137	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	120077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr20	17919475	17919751	17919605	Y	NA	SNORD17,SNX5	NA	NA	NA	NA	SNORD17	21838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	21147247	21147656	21147458	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	42623	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr20	21153673	21153920	21153797	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	49049	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRN2	204564	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	21501213	21501475	21501344	Y	NKX2-2	NA	PLK1S1	IMR90	Hi-C	24141950	XRN2	219271	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	22392618	22392869	22392732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	936504	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	297273	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	23102095	23102284	23102188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	227089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	23117564	23117783	23117655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	211590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.09187164402524
chr20	23132994	23133379	23133148	Y	THBD,CD93,GZF1,CST3	NA	THBD	K562	ChIA-PET	22265404	NXT1	195994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	23134714	23134832	23134773	Y	THBD,CD93	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	194541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	23136585	23137102	23136883	Y	THBD,CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	192271	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	166731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.02341634769715
chr20	29518777	29518943	29518821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1B	90914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.69249001703175
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.326995684031581
chr20	30104625	30104737	30104681	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	4394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.628824616577916
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	30263216	30263335	30263276	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46457	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	30303594	30303801	30303667	Y	TTLL9,DUSP15	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	5991	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	ASXL1	118917	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.42159265244545
chr20	31126196	31126450	31126244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	182041	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	31152951	31153099	31153025	Y	PLAGL2,MAPRE1	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD7	176704	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	31171182	31171312	31171248	Y	DNMT3B,C20orf203	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD7	158491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr20	31192929	31193228	31193169	Y	PLAGL2,MAPRE1,DNMT3B	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD7	136575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	31269107	31269491	31269215	Y	C20orf185,C20orf203	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD7	60312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	31352490	31352753	31352633	Y	C20orf203,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	4299	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	31410946	31411262	31411169	Y	NA	MAPRE1	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	5247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	32753335	32753546	32753441	Y	NA	RPS2P1	ITCH,AHCY,PXMP4,ZNF341,DYNLRB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P1	45059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	33152713	33153029	33152857	Y	TP53INP2	MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	20055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GGT7,GSS	NA	NA	NA	NA	GGT7	33010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	34330989	34331372	34331294	Y	SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39	ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	RBM39	2755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19652588676866
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr20	35964748	35965459	35965134	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	5629	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	36007590	36007925	36007762	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	36502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.610492377014108
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	36616982	36617239	36617111	Y	NA	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	42631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	36618785	36619379	36619133	Y	RALGAPB,RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	40491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	36722822	36723019	36722924	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	NA	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	62874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	36763112	36763416	36763201	Y	NA	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	29564	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	36986320	36986515	36986447	Y	BPI	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA71C	69931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.919207682227549
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	38988320	38988484	38988394	Y	MAFB	NA	MAFB	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAFB	327396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	39620099	39620424	39620302	Y	MAFB,TOP1	RNU2-52P,TOP1	TOP1,PLCG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU2-52P	30421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	39771751	39772110	39771932	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	8151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	39939044	39939335	39939233	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	4977	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.43031319495353
chr20	42938917	42939166	42938990	Y	NA	FITM2	GDAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	FITM2	1108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	42948601	42948866	42948737	Y	NA	FITM2	GDAP1L1,FITM2,C20orf111,LOC100505783,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FITM2	10792	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	43596220	43596403	43596301	Y	SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4	TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	STK4	3105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	45251611	45251999	45251807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53RK	64419	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr20	45943818	45944172	45944095	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	35133	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463492604721153
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11274593765572
chr20	46067997	46068157	46068096	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60444	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	46097168	46097722	46097476	Y	NA	NCOA3	NCOA3,ZMYND8,EYA2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	30879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	47373433	47373685	47373559	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	68735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr20	47390467	47391044	47390713	Y	STAU1,PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	51376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	47455528	47455923	47455726	Y	NA	PREX1	PREX1,ARFGEF2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PREX1	13108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	47470610	47470767	47470691	Y	NA	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	28190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	47784409	47784640	47784548	Y	PREX1,ZNFX1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	18264	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr20	48040275	48040654	48040626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD12	145055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	48285223	48285402	48285313	Y	SPATA2,SLC9A8	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	43013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	48381625	48382070	48381853	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	37246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474938471617856
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	48406938	48407203	48407095	Y	B4GALT5,SNAI1,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	48804007	48804349	48804187	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,PTPN1,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	1027	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	48950504	48950697	48950581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	145128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.756155417485585
chr20	49130261	49130753	49130448	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	5370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	49306526	49306915	49306601	Y	NA	PARD6B	PARD6B,PTPN1,EYA2,MIR645	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARD6B	39166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	49341306	49341865	49341532	Y	NA	PARD6B	NCOA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARD6B	4216	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	49539044	49539098	49539071	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	6423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	49598879	49599145	49599015	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	25516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MOCS3	76973	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	49996416	49996699	49996558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	180671	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418159443831127
chr20	50021136	50021625	50021333	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	155745	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	50100584	50100753	50100686	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	76617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	50141744	50142683	50142582	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	34687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	52238527	52238650	52238555	Y	NA	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	14081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	52356771	52357178	52357063	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	132325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	SUMO1P1	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUMO1P1	42219	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	52550838	52551665	52551067	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	60742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr20	54937921	54938113	54938021	Y	C20orf108,AURKA	FAM210B,AURKA,CSTF1,CASS4	NA	NA	NA	NA	FAM210B	5950	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr20	55014874	55015273	55015037	Y	CASS4,CASS4,C20orf43	AURKA,CSTF1,CASS4	NA	NA	NA	NA	CASS4	29706	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	55723431	55723679	55723544	Y	RAE1,RAE1,BMP7	NA	NA	NA	NA	NA	RAE1	200387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	56008066	56008273	56008156	Y	ZBP1	RBM38,RP4-800J21.3	NA	NA	NA	NA	RP4-800J21.3	41948	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	56027077	56027304	56027131	Y	NA	HMGB1P1	MIR5095	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	34779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr20	56032255	56032633	56032497	Y	NA	HMGB1P1	MIR5095,CTCFL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	29450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	56881907	56882420	56882011	Y	STX16,RAB22A	PPP4R1L,RAB22A	NA	NA	NA	NA	PPP4R1L	75	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,TUBB1,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr20	57596187	57596442	57596344	Y	NA	CTSZ,TUBB1,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	TUBB1	3878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.11683938697233
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr20	61057611	61057886	61057678	Y	NA	GATA5	NA	NA	NA	NA	GATA5	8585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	61267975	61268016	61267996	Y	NA	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	3781	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr20	61282674	61283033	61282738	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	10877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	62260	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	61903396	61903541	61903451	Y	NKAIN4	BIRC7,ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	ARFGAP1	1259	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	62478016	62478296	62478069	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	16300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363660163159197
chr20	62479673	62479738	62479706	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914	IMR90	Hi-C	24141950	TPD52L2	14858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.15119272587864
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583937032961716
chr21	11095741	11096142	11095942	Y	BAGE2,BAGE	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	15899272	15899518	15899378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMSN1	54205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	15913641	15914593	15914326	Y	SAMSN1	SAMSN1	NA	NA	NA	NA	SAMSN1	39130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428216718160683
chr21	15919647	15919962	15919914	Y	HSPA13,SAMSN1	SAMSN1	NA	NA	NA	NA	SAMSN1	33761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	16128294	16128498	16128458	Y	NA	AF127936.3	NA	NA	NA	NA	AF127936.3	4110	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	16129964	16130277	16130229	Y	NA	AF127936.3	NA	NA	NA	NA	AF127936.3	5780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr21	16431175	16431558	16431528	Y	NA	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	3763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	17103695	17103792	17103750	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	3351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr21	17153700	17154031	17153865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	53356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	18984370	18984546	18984496	Y	NA	BTG3	NA	NA	NA	NA	BTG3	1105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr21	19331237	19331510	19331374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL37P3	66435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	20000884	20000961	20000923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL109763.2	129360	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	20866297	20866716	20866515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL109763.2	735976	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	176393	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr21	22555444	22555624	22555534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	186811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr21	22572618	22572960	22572789	Y	NCAM2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	203985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr21	22573367	22573424	22573395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	204734	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	23435216	23435382	23435330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	1066583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	1169380	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.54400214790257
chr21	30390843	30391016	30390919	Y	NA	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	NA	NA	NA	NA	RWDD2B	1144	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	30535648	30535784	30535688	Y	NA	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	15176	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	30675702	30676052	30675894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	111310	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr21	30758449	30758782	30758692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	194057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	31019760	31020010	31019831	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	290341	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr21	31029045	31029571	31029224	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	280780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26587233764441
chr21	33042550	33042842	33042696	Y	NA	SOD1	NA	NA	NA	NA	SOD1	12615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	33105563	33105881	33105775	Y	SCAF4	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	3175	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	34718616	34718973	34718794	Y	OLIG2,OLIG1	IFNAR1	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	23882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	34736733	34736848	34736790	Y	OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNAR1,IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	36354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	35402450	35402634	35402553	Y	GART,GART	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	40890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	35750965	35751183	35751074	Y	KCNE1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	307095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	700101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	36203156	36203348	36203246	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	759286	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	36220749	36221095	36220890	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	776879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	790683	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	810334	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	814041	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	36263020	36263336	36263172	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	819150	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX1	951109	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	36475401	36475555	36475452	Y	NA	NA	RUNX1,SETD4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RUNX1	899410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr21	37670543	37670742	37670650	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	19745	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr21	38349168	38349478	38349323	Y	TTC3,DYRK1A,HLCS	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	HLCS	11058	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	38825760	38825986	38825873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	89668	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.88946148107424
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr21	39430494	39430871	39430698	Y	DSCR4	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR4	60583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr21	39551710	39551858	39551784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR8	60165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	39568176	39568479	39568328	Y	NA	NA	KCNJ6	IMR90	Hi-C	24141950	DSCR8	76631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.517991885393083
chr21	40357559	40358114	40357780	Y	ETS2	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	ETS2	182328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr21	40716228	40716377	40716303	Y	NA	BRWD1,HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	HMGN1	3196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	40814197	40814412	40814270	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	LCA5L	1319	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	NA	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	TFF1	129421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	43860192	43860442	43860317	Y	UMODL1,UBASH3A	UBASH3A	NA	NA	NA	NA	UBASH3A	38184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	43881255	43881524	43881384	Y	NA	SLC37A1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	43885293	43886049	43885531	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	28069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	44278308	44278654	44278481	Y	NA	WDR4,NDUFV3	NA	NA	NA	NA	WDR4	19024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr21	44425410	44425661	44425536	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	32790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	44499901	44500036	44499938	Y	NA	CBS,U2AF1	NA	NA	NA	NA	CBS	4848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	44529146	44529448	44529286	Y	U2AF1	CBS,U2AF1	NA	NA	NA	NA	U2AF1	3449	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.23748282375105
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	45237788	45238060	45237872	Y	TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	30394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	45275167	45275241	45275205	Y	NA	MYL6P1,AGPAT3	AGPAT3,PDXK,LOC284837,TRAPPC10	IMR90	Hi-C	24141950	MYL6P1	944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501493815670248
chr21	45341940	45342414	45342095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT3	58873	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10,H2AFZP1	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr21	45577373	45578052	45577512	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	25886	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	45616099	45616530	45616288	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	ICOSLG	AIRE,PFKL,C21orf33,PWP2,ICOSLG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ICOSLG	42319	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	45627966	45628150	45628090	Y	NA	ICOSLG	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	30699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	46495480	46495526	46495490	Y	KRTAP10-12,ADARB1	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	3712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr21	46726845	46727332	46727050	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	21032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr21	46831544	46831752	46831652	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	8492	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	46953548	46953790	46953669	Y	NA	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	8535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	863	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.883486218393253
chr21	47010868	47011351	47011033	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	217	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr21	47012173	47012565	47012399	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2,PCBP3	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2,COL18A1-AS1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr21	47442529	47442669	47442610	Y	NA	COL6A1	NA	NA	NA	NA	COL6A1	42878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr21	47651317	47651563	47651562	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	MCM3AP-AS1	4186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	17091097	17091180	17091141	Y	IL17RA	FABP5P11,TPTEP1	NA	NA	NA	NA	TPTEP1	10320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364551317706849
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr22	17568441	17568522	17568513	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	4597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	17849400	17850329	17849515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	177574	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	18155331	18155602	18155421	Y	NA	ATP6V1E1,BCL2L13	NA	NA	NA	NA	BCL2L13	45710	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	22.6693974651748
chr22	19331396	19331535	19331466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	54157	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	19337870	19338225	19337898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	60631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr22	19410653	19410889	19410838	Y	HIRA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	6536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr22	19683407	19683522	19683466	Y	NA	SEPT5,GP1BB	UFD1L,TXNRD2,CLDN5,HIRA,GP1BB,SEPT5,TBX1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEPT5	16465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	19749283	19749521	19749403	Y	NA	SEPT5,GP1BB,TBX1	NA	NA	NA	NA	TBX1	7057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	19930770	19931097	19930953	Y	ZDHHC8,COMT	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	3429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr22	19946850	19947150	19946987	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	19509	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	19983308	19983423	19983389	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr22	19983834	19983932	19983883	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18399	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	20199029	20199266	20199148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4R	69503	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	18274	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74	NA	NA	NA	NA	ZNF74	26142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	21221716	21221966	21221814	Y	NA	SNAP29,PI4KA,CRKL	NA	NA	NA	NA	PI4KA	10011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr22	21273214	21273312	21273263	Y	NA	CRKL	NA	NA	NA	NA	CRKL	3500	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.474938471617856
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20131578264293
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr22	22186398	22186549	22186531	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	33421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr22	22187099	22187411	22187395	Y	PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	32559	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	22204010	22204393	22204300	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	15577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	22205229	22205454	22205405	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	14516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	22290676	22291029	22290778	Y	MAPK1,PPM1F	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	PPM1F	14180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	22478098	22478432	22478244	Y	CCDC116,YPEL1,ZNF280B	NA	NA	NA	NA	NA	TOP3B	142885	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr22	22861017	22861374	22861318	Y	ZNF280B	ZNF280B,ZNF280A,PRAME	NA	NA	NA	NA	ZNF280B	131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	23356474	23356833	23356654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB36	128680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	23528251	23528416	23528284	Y	BCR	RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	8360	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	23876230	23876637	23876426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	133317	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.855542281773716
chr22	24470506	24470556	24470531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABIN1	64864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	15543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	25082452	25082825	25082629	Y	ADORA2A,GGT1	NA	PIWIL3	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	95277	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	25587613	25587664	25587639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5L	211680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	26145852	26146077	26145889	Y	NA	MYO18B	NA	NA	NA	NA	MYO18B	9741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr22	27028638	27029036	27028851	Y	NA	TPST2,CRYBA4,MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	11356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.711713411143209
chr22	27038834	27039211	27039123	Y	NA	TPST2,CRYBA4,MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	1181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.455715077506396
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CRYBA4,MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr22	27695108	27695506	27695341	Y	NA	NA	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	413597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC28-AS1	247638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	197459	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	28122669	28123242	28122949	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	190122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	29548210	29548510	29548260	Y	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	51330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	29548778	29549084	29549009	Y	XBP1,KREMEN1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	50756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.490990964066867
chr22	29601085	29601300	29601289	Y	NA	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	1245	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	29603016	29603222	29603044	Y	NA	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	3176	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	30018031	30018407	30018261	Y	NF2	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	20486	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	NA	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBC1D10A	115760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr22	30801557	30801812	30801706	Y	OSM,CCDC157,SF3A1	RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	13948	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	30938421	30938985	30938910	Y	LIF,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18	NA	NA	NA	NA	NA	TCN2	61840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	31005316	31005631	31005442	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4	NA	NA	NA	NA	PES1	4246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	31626331	31627201	31626769	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	20106	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	31629034	31629491	31629163	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	22809	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	31639719	31639839	31639804	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	32291389	32291694	32291650	Y	RFPL2,SFI1,PRR14L,DEPDC5	YWHAH	NA	NA	NA	NA	YWHAH	46753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr22	32819656	32819735	32819695	Y	RFPL3,TIMP3	FBXO7	NA	NA	NA	NA	FBXO7	48928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	35528321	35528338	35528332	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	96711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309160882487267
chr22	35529944	35530291	35530139	Y	ISX	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	94758	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	35555825	35556131	35555978	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	68918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	36310688	36310985	36310744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	111488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	37299850	37299981	37299916	Y	C1QTNF6	CSF2RB	NA	NA	NA	NA	CSF2RB	7689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	37310268	37310667	37310471	Y	RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB	CSF2RB	NA	NA	NA	NA	CSF2RB	2598	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	Z82188.1,CYTH4	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.13880384368862
chr22	37655075	37655389	37655235	Y	NA	Z82188.1,RAC2,CYTH4	CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	16587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	37663226	37663580	37663275	Y	MFNG,MFNG,NCF4,RAC2	Z82188.1,RAC2,CYTH4	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH4	12488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	37669607	37669944	37669799	Y	LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,CYTH4	Z82188.1,RAC2,CYTH4	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH4	6124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr22	38199242	38199532	38199401	Y	NA	GCAT,MIR658,EIF3L,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	GCAT	2380	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	38859370	38859653	38859488	Y	NA	KDELR3,DDX17	NA	NA	NA	NA	KDELR3	2414	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	39270050	39270413	39270293	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3H,APOBEC3G	NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	CBX6	3731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	39570081	39570473	39570178	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBX7	23402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	39679510	39679847	39679626	Y	NA	PDGFB,RPL3	CBX7,PDGFB,SNORD83A,SNORD83B,RNU86,RPL3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL3	34547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr22	39695935	39696099	39695991	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	18295	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	39698105	39698354	39698234	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	16040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	39869379	39869438	39869422	Y	NA	MGAT3,ATF4	ATF4,SMCR7L	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT3	18030	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	40228787	40228973	40228863	Y	SYNGR1,GRAP2	UQCRFS1P1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1P1	40320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.02959483613855
chr22	40357456	40357744	40357564	Y	TNRC6B,GRAP2	NA	NA	NA	NA	NA	GRAP2	62370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr22	40384673	40384943	40384833	Y	FAM83F	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6B	53878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.32909216082442
chr22	40451411	40451463	40451437	Y	NA	TNRC6B,RPL7P52	NA	NA	NA	NA	TNRC6B	12590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	40573139	40573276	40573210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	72069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr22	40575185	40575584	40575306	Y	TNRC6B,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	74115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	40908486	40908830	40908701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	121876	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.791876881319881
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr22	41416837	41417114	41416960	Y	NA	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	40942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.81275117495036
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337550396380631
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr22	42339043	42339310	42339264	Y	NA	SHISA8,TNFRSF13C,CENPM	NA	NA	NA	NA	CENPM	1858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	42839941	42840323	42840234	Y	POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1	CTA-126B4.7	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-126B4.7	7912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	42840483	42840921	42840577	Y	SEPT3	CTA-126B4.7	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-126B4.7	8454	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	42944911	42945251	42945081	Y	NA	RRP7A,SERHL2,RRP7B	NA	NA	NA	NA	SERHL2	2372	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARA	120819	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARA	79221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARA	63160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	47149923	47150411	47150155	Y	NA	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	6107	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	47150443	47150659	47150583	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	5859	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	47330872	47331057	47330965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	174354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	47487256	47487562	47487389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	330738	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	47579960	47580142	47580051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	423442	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr22	48184441	48184585	48184513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	159018	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr22	48185959	48186142	48186052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	160536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	49860945	49861166	49860973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	188024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	49918072	49918223	49918148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	130967	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	50004783	50004984	50004947	Y	NA	C22orf34	NA	NA	NA	NA	C22orf34	44206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428216718160683
chr22	50496914	50497067	50497001	Y	NA	MLC1	NA	NA	NA	NA	MLC1	25264	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr22	50680113	50680250	50680180	Y	SELO	SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11	NA	NA	NA	NA	TUBGCP6	1171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr22	50769449	50769513	50769481	Y	MOV10L1	PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	PLXNB2,FAM116B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PPP6R2	10220	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	50815545	50815813	50815668	Y	MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B	PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	35812	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr22	50982591	50982963	50982680	Y	NA	LMF2,NCAPH2,SCO2,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	SYCE3	16371	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr22	51051274	51051666	51051314	Y	NA	CHKB-CPT1B,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	ARSA	12941	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	3219649	3219829	3219819	Y	NA	CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr3	3639816	3640081	3639965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRBN	420422	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	4468384	4468713	4468579	Y	NA	SUMF1	NA	NA	NA	NA	SUMF1	38252	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	4780474	4780964	4780800	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	146013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	4781579	4781854	4781808	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	145123	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.673712200194116
chr3	4782990	4783362	4783182	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	143615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	4870922	4871280	4871101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	55697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	4871506	4871670	4871602	Y	ITPR1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	55307	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	4881719	4881745	4881731	Y	ITPR1	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	45232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	40890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr3	4908577	4908896	4908639	Y	BHLHE40	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	18081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.782710761537976
chr3	5030402	5030899	5030722	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	10756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.408993324049223
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr3	5043972	5044716	5044216	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	24326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	5052861	5053708	5053449	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	33215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	35312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr3	5058332	5058543	5058409	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	38686	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	39920	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr3	5061219	5061509	5061357	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	41573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773544641756071
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.838598634777054
chr3	5097421	5097705	5097571	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	NA	ITPR1,BHLHE40,EGOT,LOC100507582	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8B	64200	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	5157481	5157555	5157517	Y	NA	ARL8B	NA	NA	NA	NA	ARL8B	4350	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	5470535	5470892	5470804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	243204	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	6573697	6574039	6573711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1346366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	8906303	8906783	8906429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	96674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	9904404	9904624	9904511	Y	OGG1,LOC401052,ARPC4,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE	NA	NA	NA	NA	RPUSD3	20118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	10276652	10276834	10276729	Y	NA	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	10873	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.40124770214167
chr3	10402355	10402452	10402401	Y	FANCD2	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	41493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	10593561	10593984	10593868	Y	NA	NA	ATP2B2	IMR90	Hi-C	24141950	SEC13	232699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	12555203	12555562	12555379	Y	NA	TSEN2,MKRN2	NA	NA	NA	NA	TSEN2	31272	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	12917586	12917878	12917745	Y	NA	RPL32	IQSEC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL32	36499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	12994805	12995095	12994927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32	113718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.59635309103599
chr3	13040844	13041238	13041111	Y	RAF1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	71379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr3	13455554	13455885	13455702	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	3924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	13460446	13460799	13460651	Y	NA	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.920596274794694
chr3	13920516	13920583	13920566	Y	WNT7A	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD4	243787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	NA	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHCHD4	227194	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	14246419	14246703	14246618	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	28136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr3	14257734	14258042	14257871	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	39451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	14287496	14287739	14287546	Y	GRIP2	NA	SLC6A6,GRIP2	IMR90	Hi-C	24141950	XPC	69213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	14413329	14413583	14413465	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC6A6	28493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	14444961	14445761	14445267	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	2885	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr3	14481056	14481424	14481147	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	38980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr3	15285479	15285699	15285585	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	39820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	15450643	15451124	15450971	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	15738	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	15847096	15847637	15847448	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	51641	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	ANKRD28	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	2597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	16352603	16353027	16352777	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	47897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	16381472	16381685	16381579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	76766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	978919	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	940686	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	17622451	17622654	17622556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	861655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	17650424	17650697	17650561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	833612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.685158067090819
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	19973337	19973743	19973575	Y	RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	EFHB	12774	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr3	20082717	20083237	20083200	Y	RAB5A,KAT2B	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	3202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	20096123	20096547	20096288	Y	RAB5A	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	16608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	20200050	20200329	20200065	Y	NA	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	25455	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	19705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr3	20931659	20931901	20931719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	650407	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.81914010959797
chr3	21654380	21654503	21654471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	72072	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	21722785	21723001	21722895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	140477	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	21755607	21755966	21755787	Y	ZNF385D	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	173299	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	23206478	23206499	23206488	Y	NA	UBE2E2	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	36012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr3	29496223	29496522	29496266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	1107586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	31584966	31585359	31585050	Y	NA	STT3B	NA	NA	NA	NA	STT3B	12836	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	33040516	33040939	33040781	Y	NA	CCR4,SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	32416	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	33639579	33639904	33639592	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	117944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	33977707	33978124	33977933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	139863	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	39.3023765910829
chr3	34023342	34023687	34023515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	185498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	36942339	36942611	36942476	Y	TRANK1,GOLGA4	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	41937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	36953847	36954333	36954176	Y	TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1	TRANK1	NA	NA	NA	NA	TRANK1	30215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	37131567	37131685	37131626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL29P11	75062	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	37304089	37304216	37304152	Y	GOLGA4	GOLGA4,AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	20403	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	37526942	37526947	37526945	Y	C3orf35	NA	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	243256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	XIRP1	9434	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr3	39680809	39681095	39680963	Y	CSRNP1	NA	MYRIP,RPSA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPSA	234629	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	40341288	40341806	40341708	Y	EIF1B	EIF1B	NA	NA	NA	NA	EIF1B	7369	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392049677052561
chr3	40491258	40491489	40491375	Y	NA	ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619	NA	NA	NA	NA	ENTPD3-AS1	1331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	42065241	42065265	42065254	Y	NA	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	11947	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	RP11-219I21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-219I21.1	22502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	42725545	42725856	42725623	Y	LYZL4,KRBOX1,HHATL,CCDC13	RP4-613B23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-613B23.1	31665	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	ZNF662	NA	NA	NA	NA	ZNF662	22430	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	97126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	43431181	43431702	43431413	Y	SNRK,ABHD5	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	93670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	43458781	43458976	43458878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	66396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546381399286447
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	45085220	45085486	45085391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	69543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	45103596	45103920	45103694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	81994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr3	45106032	45106094	45106072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	79820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	79456	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.36436804738489
chr3	45117821	45118043	45117953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	67871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	45141662	45142027	45141978	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43887	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	45146738	45147081	45147019	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38833	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	45155178	45155398	45155286	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	30516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr3	45161726	45162069	45161866	Y	TMEM158	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	23845	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	45175300	45175656	45175542	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10258	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr3	45208648	45208845	45208728	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	8981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.683323897249846
chr3	45315271	45315676	45315515	Y	SACM1L	AC010170.1,TMEM158	LARS2,CLEC3B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM158	49501	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr3	45657242	45657607	45657425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	62356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	45673092	45673584	45673283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACM1L	54964	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	46277874	46278115	46278014	Y	CCR3,CCR2	NA	SLC6A20,FYCO1,CCR1,CCR3,CCR5,CCR2,CCRL2,LTF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-24F11.2	168435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	46427756	46428118	46427902	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	RP11-24F11.2,CCRL2	CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-24F11.2	18432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	46434949	46435277	46435219	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	RP11-24F11.2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	RP11-24F11.2	11273	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	46440905	46441384	46441314	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	RP11-24F11.2,CCRL2	CCR1,CCR2,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-24F11.2	5166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	46546407	46546628	46546504	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	CCRL2	99753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	46591078	46591347	46591239	Y	CCR2	NA	NA	NA	NA	NA	CCRL2	144424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	46995135	46995433	46995392	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	23740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	47078393	47078462	47078449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	56893	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	47327082	47327178	47327130	Y	NA	KLHL18,KIF9	NA	NA	NA	NA	KIF9	4141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	47520842	47520999	47520921	Y	NA	SCAP	NA	NA	NA	NA	SCAP	4226	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr3	47584263	47584567	47584468	Y	NA	CSPG5	NA	NA	NA	NA	CSPG5	35715	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	49968490	49968553	49968522	Y	NA	MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MON1A	2884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	50040739	50040850	50040788	Y	SEMA3B	NA	NA	NA	NA	NA	RBM6	65299	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr3	50370591	50370860	50370724	Y	RBM6,SEMA3B,RASSF1	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	5551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	50627976	50628161	50628029	Y	RASSF1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	18790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr3	50628296	50628501	50628442	Y	RASSF1,RASSF1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	18450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	50638353	50638905	50638586	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	8046	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	50639346	50639782	50639525	Y	C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	52088878	52089257	52089156	Y	ACY1,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	52122540	52122780	52122660	Y	PPM1M,PPM1M,GLYCTK	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	33974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	52143667	52143964	52143845	Y	NA	POC1A	NA	NA	NA	NA	POC1A	42742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	52235110	52235291	52235183	Y	PBRM1,PBRM1,GLYCTK,DNAH1	POC1A,ALDOAP1,ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M	NA	NA	NA	NA	ALAS1	5008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	52334165	52334539	52334405	Y	NA	GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	WDR82	14129	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	53360286	53360418	53360351	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	19236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	53362706	53362961	53362819	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	16693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	54734224	54734587	54734407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	75982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	56443112	56443203	56443174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	145986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	58162589	58162663	58162637	Y	KCTD6	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	58570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	58339773	58340193	58340113	Y	NA	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	23166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	58885194	58885598	58885457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	148212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	59371498	59371574	59371525	Y	NA	NA	FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	337688	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	60360991	60361355	60361182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	873778	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	60745368	60745684	60745652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	489449	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	63942094	63942115	63942105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	65543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	65013149	65013388	65013334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	341473	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555547519068352
chr3	67455058	67455415	67455236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	247623	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-460N16.1	128502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	71109660	71109993	71109875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	521147	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	71158778	71158960	71158907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	472180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr3	71494304	71494367	71494336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	136773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	71564915	71565059	71565002	Y	PROK2,GPR27,FOXP1,EIF4E3,EIF4E3,EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	66081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	71628462	71628802	71628743	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	2338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	72135635	72136114	72135743	Y	RYBP,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2	NA	SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00870	62294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr3	72213087	72213177	72213133	Y	NA	LINC00870	NA	NA	NA	NA	LINC00870	14679	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	72319196	72319527	72319350	Y	RYBP	NA	RYBP,SHQ1,LOC201617,PPP4R2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00870	120788	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	72338130	72338451	72338187	Y	NA	NA	SHQ1,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00870	139722	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	107533	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	72536556	72536893	72536709	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	42487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	73049169	73049333	73049244	Y	PPP4R2,EBLN2	PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	5233	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	73998423	73998717	73998570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	767981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	74641204	74641330	74641267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	840931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	79674571	79674688	79674630	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	140277	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.39496498000822
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.11230036038189
chr3	87101402	87101690	87101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	172731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	98414776	98414949	98414863	Y	ST3GAL6	NA	ST3GAL6	IMR90	Hi-C	24141950	CPOX	104209	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	99570772	99571127	99571120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	260230	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	99596957	99597300	99597045	Y	TBC1D23	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	234057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	99646991	99647087	99647049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	184270	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	99782957	99783256	99783070	Y	NA	FILIP1L	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	48101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	101046086	101046265	101046174	Y	ZBTB11,SENP7,CEP97	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	183820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	101109184	101109394	101109269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	120691	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	101353542	101353691	101353631	Y	NA	ZBTB11,RPL24	NA	NA	NA	NA	ZBTB11	40648	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.77480904519271
chr3	101355184	101355535	101355371	Y	NA	ZBTB11,RPL24	NA	NA	NA	NA	ZBTB11	38804	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0639277074057
chr3	101358042	101358155	101358098	Y	NA	ZBTB11,RPL24	NA	NA	NA	NA	ZBTB11	36184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.90664025913853
chr3	101359268	101359291	101359280	Y	NA	ZBTB11,RPL24	NA	NA	NA	NA	ZBTB11	35048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.982873082681383
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	105974625	105975465	105974915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	388229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	107843189	107843582	107843382	Y	MYH15,CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	35317	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	107844539	107845078	107844606	Y	DZIP3,IFT57,CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	36667	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	111289781	111290083	111289847	Y	CD96	NA	NA	NA	NA	NA	CD96	280215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	112436805	112436974	112436889	Y	NA	NA	CD200R1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	70428	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	112465605	112465931	112465711	Y	CCDC80,CD200R1	NA	CD200R1,CCDC80,CD200R1L,GTPBP8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	99228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	152852	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	83902	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	114373701	114374062	114373901	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	600241	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	114500516	114500693	114500605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	727056	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	114813239	114813371	114813303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	526800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	162587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	117134107	117134368	117134238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	390562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	888747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1,CD80	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	119314990	119315304	119315163	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH,COX17	CD80,ADPRH,RP11-190C22.1	NA	NA	NA	NA	ADPRH	18875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	119514057	119514298	119514132	Y	NR1I2,NR1I2	NA	NA	NA	NA	NA	COX17	119756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293108390038257
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	121798487	121798500	121798494	Y	PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	243591	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	122463361	122463618	122463490	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	47053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	122493180	122493752	122493620	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	16919	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	122787344	122787648	122787385	Y	SEMA5B,PDIA5	PDIA5	NA	NA	NA	NA	PDIA5	3435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	123511748	123512001	123511875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC14	166563	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	124535064	124535375	124535191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	82890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	124823348	124823728	124823623	Y	OSBPL11	NA	HEG1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB5	205083	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	125235229	125235600	125235483	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	1441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	125351909	125352225	125352071	Y	OSBPL11	OSBPL11	NA	NA	NA	NA	OSBPL11	39975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.410827493890196
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	74839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	126680194	126680270	126680232	Y	NA	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	25167	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.85598785904754
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	2213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	27082	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr3	128129010	128129170	128129084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	76885	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.14865067181197
chr3	128134219	128134423	128134321	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	71632	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.44953658906498
chr3	128134820	128135360	128135009	Y	EEFSEC,GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	70695	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13903897475624
chr3	128135736	128135843	128135790	Y	GATA2,GATA2,GATA2,C3orf27,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	70212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555993096342178
chr3	128214371	128214730	128214426	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4,GATA2	DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA2	4343	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4,GATA2	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GATA2	6492	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr3	128267469	128267837	128267725	Y	NA	NA	GATA2	K562	ChIA-PET	22265404	GATA2	57441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.69249001703175
chr3	128777311	128777632	128777514	Y	C3orf25	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	62012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	128837764	128838022	128837873	Y	MBD4,H1FX,C3orf37,C3orf37,KIAA1257,ISY1,CNBP,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	1622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	128947996	128948470	128948199	Y	MBD4,KIAA1257,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43,ISY1,CNBP	CNBP	KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	47231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	128964355	128964687	128964560	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	63590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	128967680	128967946	128967799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H1FX-AS1	64289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	129167159	129167354	129167260	Y	NA	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	10191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.70584909039934
chr3	129180710	129180864	129180787	Y	IFT122	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	23742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	129204579	129204997	129204770	Y	NA	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	47611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	132138974	132139193	132139084	Y	NA	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	4604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	135235230	135235627	135235440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	446888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	136466232	136466235	136466234	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	2985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	137938227	137938395	137938336	Y	ARMC8	DBR1,ARMC8	NA	NA	NA	NA	ARMC8	34118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	138410318	138410460	138410372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAIM	84870	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	138510806	138511198	138511002	Y	NA	PIK3CB	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	40582	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	138552268	138552612	138552378	Y	MRAS	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	138581550	138581663	138581597	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.7509199443375
chr3	138594717	138594956	138594896	Y	NA	PIK3CB	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	42937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.574770913179812
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	FOXL2,C3orf72	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXL2	29292	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr3	139018358	139018692	139018412	Y	FOXL2,C3orf72	NA	BPESC1	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	87882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr3	141047061	141047339	141047200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACPL2	101493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	84769	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	141173878	141174028	141173977	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	29861	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	141693372	141693614	141693574	Y	TFDP2,TFDP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	67426	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	141887290	141887616	141887590	Y	NA	TFDP2	NA	NA	NA	NA	TFDP2	20904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	142804014	142804376	142804307	Y	NA	CHST2	CHST2	K562	ChIA-PET	22265404	CHST2	31797	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	143352573	143352896	143352700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	335744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr3	145959602	145959992	145959865	Y	PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	6974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	146745799	146745822	146745813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	485148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	694953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	148781933	148782210	148782183	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-278L15.6	59005	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	128818	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	150445626	150445906	150445750	Y	SIAH2	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	FAM194A	25868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr3	150478267	150478712	150478564	Y	TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	151917246	151917489	151917451	Y	MBNL1	MBNL1	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	42128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	151923088	151923367	151923343	Y	MBNL1	MBNL1	MBNL1,LOC401093	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MBNL1	36250	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.766212691815139
chr3	151970606	151970904	151970617	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	10989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	151971438	151971777	151971516	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	11821	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	151976173	151976628	151976408	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	8716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	151996540	151996946	151996646	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	11196	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	152120876	152121103	152120983	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	135532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr3	152313972	152314194	152314081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P2RY1	236542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.17476043859054
chr3	152705631	152705718	152705686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P2RY1	154895	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	153007263	153007499	153007331	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	129234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	155316441	155316741	155316588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCH1	144115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr3	156202207	156202259	156202239	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	68714	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309160882487267
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	156361646	156361882	156361788	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1	TIPARP,TIPARP-AS1	TIPARP,TIPARP-AS1,LEKR1,LOC100498859,LOC339894	IMR90	Hi-C	24141950	TIPARP	27142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	2421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	158048767	158049059	158048913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	226475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	72930	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	161145857	161145887	161145872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	324685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	167468188	167468573	167468282	Y	NA	PDCD10,SERPINI1	NA	NA	NA	NA	SERPINI1	17157	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	169941070	169941418	169941334	Y	MYNN,MYNN,LRRIQ4,PHC3	PHC3,PRKCI	NA	NA	NA	NA	PRKCI	2917	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	170795068	170795319	170795194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	170586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	170966636	170966947	170966845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	209250	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	4090	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	171531632	171532210	171532036	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	PLD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLD1	4892	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.01126259657475
chr3	171693285	171693478	171693411	Y	FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	61940	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	172418207	172418359	172418236	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	8649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	176080356	176080644	176080432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	645898	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.654934383356482
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	177315732	177315915	177315819	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	402471	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	178983793	178983839	178983817	Y	KCNMB3	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	6732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr3	179049621	179049719	179049674	Y	NA	ZNF639,MFN1	NA	NA	NA	NA	ZNF639	10842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	179161841	179162229	179161903	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	5149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	180040639	180040822	180040650	Y	NA	NA	PEX5L	IMR90	Hi-C	24141950	TTC14	277096	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	182727471	182727797	182727625	Y	NA	DCUN1D1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	25730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	182973152	182973434	182973425	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	182973593	182973879	182973736	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4561	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	182978108	182978472	182978157	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	9076	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	183079075	183079309	183079198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	65257	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr3	183250743	183250943	183250799	Y	HTR3D,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	KLHL6	NA	NA	NA	NA	KLHL6	20534	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr3	184078263	184078665	184078465	Y	NA	EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,THPO,CHRD	NA	NA	NA	NA	POLR2H	757	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	185948324	185948597	185948503	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	122217	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	186695100	186695431	186695266	Y	RTP1	ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	48826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	187458720	187459019	187458856	Y	LPP,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	2496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	187464496	187464942	187464863	Y	NA	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	2981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	191160044	191160233	191160139	Y	PYDC2	NA	FGF12	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC50	115178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	44238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.612326546855081
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	194210438	194211060	194210799	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	6033	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	194843909	194844196	194844053	Y	APOD	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	22404	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	4439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	194882926	194883249	194883145	Y	FAM43A	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	16326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	32063	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.01330721262192
chr3	194909017	194909237	194909137	Y	NA	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	42417	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	195531239	195531516	195531404	Y	NA	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5632	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	195542423	195542578	195542499	Y	MUC20,MUC4	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr3	195849521	195850263	195850145	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	42461	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr3	195854063	195854320	195854202	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	47003	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	195871770	195871934	195871856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	64710	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr3	195891844	195892227	195892035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	84784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	195906363	195907075	195906446	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,TNK2,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	99303	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	195908745	195909032	195908753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	101685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	195919575	195919687	195919655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	93141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	195946209	195946432	195946330	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	66396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	196001542	196001805	196001683	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,PCYT1A	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	11023	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	196064212	196064579	196064504	Y	WDR53,ZDHHC19	TCTEX1D2,TM4SF19	NA	NA	NA	NA	TM4SF19	838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.11437688173627
chr3	196208308	196208582	196208445	Y	NA	RNF168	NA	NA	NA	NA	RNF168	20057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr3	196694427	196694825	196694642	Y	NA	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792768035867532
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr3	197153931	197154131	197153988	Y	MFI2,MFI2	NA	BDH1,DLG1,LOC100507086	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	129760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr3	197838995	197839386	197839068	Y	NA	ANKRD18DP,AC073135.3	LMLN,ANKRD18DP	IMR90	Hi-C	24141950	AC073135.3	4012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	43553	43799	43797	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	7380	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	47637	47939	47761	Y	ZNF141	ZNF595	ZNF718	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF595	3240	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	49782	50031	49981	Y	NA	ZNF595	NA	NA	NA	NA	ZNF595	1148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	640356	640557	640503	Y	ZNF141,ZNF721,TMEM175,CPLX1,PDE6B	MYL5,ATP5I	NA	NA	NA	NA	MYL5	24812	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	770204	770556	770391	Y	ZNF141	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	3081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	989726	990085	990037	Y	NA	DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	SLC26A1	4498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	SLC26A1	6027	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	1968542	1968629	1968571	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	73060	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	2365260	2365459	2365325	Y	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	52931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	2385582	2385754	2385689	Y	TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,LOC402160	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	32636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	2392234	2392240	2392237	Y	ZFYVE28	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	26150	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	2403922	2404158	2403968	Y	ZFYVE28	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	14232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.293108390038257
chr4	2415721	2415975	2415729	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	2415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.36892754161449
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	3085381	3085754	3085447	Y	NA	HTT	NA	NA	NA	NA	HTT	10973	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	3389642	3390154	3389980	Y	HTT,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	96887	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	3391112	3391254	3391201	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	98357	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	3829713	3829948	3829819	Y	ADRA2C	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	FAM86EP	125198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	4542716	4543043	4542880	Y	ZBTB49,STX18	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	4679221	4679437	4679332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX18	137148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	5587454	5587568	5587511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	121707	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	6592942	6593078	6593012	Y	NA	MAN2B2,MRFAP1	NA	NA	NA	NA	MAN2B2	18040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	6732429	6732641	6732536	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	22822	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328829853872553
chr4	6732812	6732932	6732874	Y	TBC1D14,TBC1D14	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	23205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr4	6754865	6755056	6754928	Y	NA	MRFAP1L1,KIAA0232	LOC100129931,TADA2B,KIAA0232,TBC1D14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0232	26046	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	6841864	6842265	6841993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	60762	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	6893983	6894399	6894044	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	14570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	6895356	6895637	6895499	Y	KIAA0232	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	13332	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	6918330	6918775	6918508	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	9361	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr4	6920106	6920340	6920183	Y	MAN2B2,S100P,KIAA0232,TADA2B,GRPEL1,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	11137	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	6934348	6934486	6934417	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	25379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr4	7012933	7013112	7013014	Y	NA	TADA2B,CCDC96	NA	NA	NA	NA	TADA2B	28514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	7209017	7209262	7209117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRPEL1	141093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	7648496	7648718	7648592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	105099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr4	7649791	7650390	7650086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1-AS1	103427	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr4	8551076	8551407	8551242	Y	NA	CPZ	GPR78	IMR90	Hi-C	24141950	CPZ	40980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	10171339	10171713	10171495	Y	NA	NA	CLNK,WDR1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WDR1	54766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.09923549927338
chr4	10174055	10174638	10174268	Y	NA	NA	WDR1,CLNK	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	57482	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr4	10182678	10183260	10182921	Y	WDR1	NA	WDR1,CLNK,ZNF518B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	66105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.900429865389914
chr4	10184786	10184981	10184889	Y	NA	NA	WDR1,CLNK,ZNF518B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	68213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr4	10202500	10202707	10202580	Y	NA	NA	WDR1	K562	ChIA-PET	22265404	WDR1	85927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr4	10308538	10308874	10308706	Y	NA	NA	WDR1	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF518B	148160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	10459917	10460083	10460004	Y	NA	ZNF518B	NA	NA	NA	NA	ZNF518B	2883	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.78569839287847
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	13257922	13258131	13258027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	74907	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	13329661	13329866	13329822	Y	NA	HSP90AB2P	HSP90AB2P	IMR90	Hi-C	24141950	HSP90AB2P	3172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	14857906	14858386	14858211	Y	CPEB2	LINC00504	CPEB2,LOC441009	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC00504	29407	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	15151544	15151754	15151565	Y	NA	NA	CPEB2	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB2	149246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	15356839	15357216	15357028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	112273	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	16226860	16227020	16226938	Y	FGFBP2,TAPT1	TAPT1,RPS21P4	NA	NA	NA	NA	TAPT1	13	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	16544160	16544423	16544292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	287982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	16728731	16729070	16728970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	472553	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	17938692	17938903	17938798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCORL	82596	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr4	23572553	23572557	23572555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-412P11.1	575379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	25808541	25808922	25808732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	54460	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	33937784	33937916	33937850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-79E3.3	101599	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	36183139	36183486	36183313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	1502512	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	38320550	38320897	38320770	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	342920	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	38525630	38525737	38525685	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF3	138080	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr4	38530760	38531092	38530874	Y	TLR6,TLR1,KLF3	NA	FLJ13197,KLF3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF3	132725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.402106951382118
chr4	38607589	38607693	38607690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF3	56124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.609601222466456
chr4	38671040	38671097	38671090	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	6536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	38673994	38674276	38674074	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	9490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	38674773	38675062	38674906	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	10269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr4	38697805	38697826	38697816	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	33301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr4	39038547	39038755	39038651	Y	NA	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	5904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	39641402	39641506	39641505	Y	NA	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	2642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr4	40057110	40057493	40057154	Y	RHOH,N4BP2	N4BP2	NA	NA	NA	NA	N4BP2	664	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	40208219	40208356	40208278	Y	RBM47	RHOH	NA	NA	NA	NA	RHOH	17546	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	40240312	40240963	40240621	Y	RHOH,RBM47	RHOH	NA	NA	NA	NA	RHOH	49639	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.02899789384998
chr4	40313713	40314128	40314012	Y	PDS5A,N4BP2,RHOH,RBM47	NA	N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOH	123040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOH	343098	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	40556143	40556529	40556261	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RHOH	365470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	41130759	41131325	41130803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	85406	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	253220	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	48339625	48339996	48339981	Y	NA	SLAIN2	TEC,SLAIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLAIN2	1343	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	48532180	48532355	48532269	Y	NA	SLC10A4	NA	NA	NA	NA	SLC10A4	48820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	48840387	48840419	48840403	Y	NA	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	35158	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	54172916	54173263	54173102	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	56979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	56453376	56453745	56453528	Y	NA	CLOCK,NMU	NA	NA	NA	NA	CLOCK	42071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr4	56795274	56795608	56795460	Y	EXOC1,CEP135	CEP135	SRD5A3,CEP135	IMR90	Hi-C	24141950	CEP135	17429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr4	57313900	57314193	57314047	Y	NA	PPAT,PAICS,SRP72	NA	NA	NA	NA	PAICS	13993	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	57831930	57832208	57832081	Y	NA	POLR2B,NOA1	NA	NA	NA	NA	POLR2B	9680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	812526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.68586595131651
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	57765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	71695000	71695080	71695041	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	8582	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	71768830	71769244	71769107	Y	DCK,MOBKL1A	MOB1B	NA	NA	NA	NA	MOB1B	2787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	74527283	74527866	74527619	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	NA	CXCL5,RASSF6,CXCL2,ANKRD17,IL8,PF4V1,CXCL3,CXCL6,PPBPL2,CXCL1,PF4,PPBP,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	76357	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	74569694	74570920	74570464	Y	ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	33303	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	74593361	74593798	74593698	Y	NA	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	10425	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	74961952	74962121	74962037	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL2,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	CXCL2	889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr4	75097904	75098121	75097961	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	120013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	75201412	75201689	75201551	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	27171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	75554137	75554451	75554233	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	EREG	325277	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	76750745	76750859	76750802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USO1	102968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	76963504	76963670	76963541	Y	NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11	NA	NA	NA	NA	NA	SDAD1	53389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	77868010	77868840	77868612	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	16	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr4	77869090	77869312	77869177	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr4	77974492	77974926	77974738	Y	CCNI	CCNI	NA	NA	NA	NA	CCNI	20232	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	78823537	78823752	78823560	Y	NA	MRPL1	NA	NA	NA	NA	MRPL1	41863	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	79521197	79521480	79521236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	50524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.729102635413697
chr4	79550555	79550802	79550658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	79882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.57731296724648
chr4	79578189	79578564	79578235	Y	BMP2K	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	107516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	79579251	79579554	79579361	Y	BMP2K	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	108578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	79613098	79613437	79613268	Y	BMP2K	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2K	82059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	79642197	79642457	79642428	Y	BMP2K	NA	BMP2K	K562	ChIA-PET	22265404	BMP2K	53039	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.545935822012622
chr4	79859042	79859275	79859190	Y	PAQR3	PAQR3,LINC01088	NA	NA	NA	NA	PAQR3	450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	80131303	80131759	80131432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA11	113445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.53197980635646
chr4	80997440	80997711	80997566	Y	PRDM8,ANTXR2	ANTXR2	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	46897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	81048415	81048773	81048660	Y	ANTXR2,PRDM8	ANTXR2	PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR2	3807	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.855542281773716
chr4	81056560	81056903	81056754	Y	ANTXR2	ANTXR2	PRDM8	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR2	11952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	82342695	82343029	82342890	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPD	950627	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.95205245665847
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	464630	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	85799806	85800014	85799906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	85524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	13534	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	63604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	88443267	88443740	88443428	Y	DSPP,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	101533	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	89677444	89677595	89677520	Y	FAM13A	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	60058	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	89726737	89726837	89726787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	109351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr4	90212945	90213002	90212979	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	14159	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	92985275	92985297	92985287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2141465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	93103612	93103785	93103627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2022977	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.13031843224816
chr4	93104192	93104578	93104286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2022184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264273298871067
chr4	99845137	99845196	99845164	Y	NA	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	4592	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	RP11-10L12.4	3214	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	103788773	103788886	103788830	Y	NA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	103793013	103793145	103793075	Y	MANBA,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	4878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	106112779	106113198	106113105	Y	TET2,TET2	TET2	NA	NA	NA	NA	TET2	47747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	109281025	109281423	109281353	Y	CYP2U1,LEF1,LEF1	NA	LOC641518,LEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34-AS1	258193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr4	109513186	109513523	109513472	Y	NA	RPL34-AS1,RPL34	NA	NA	NA	NA	RPL34-AS1	26093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	110497403	110497694	110497411	Y	NA	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	18042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	110623287	110623426	110623357	Y	LRIT3	CASP6,PLA2G12A	NA	NA	NA	NA	CASP6	548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	111041485	111041815	111041651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	76540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.50796651637073
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.56935216970977
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	113797634	113797869	113797752	Y	NEUROG2,ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP30	89600	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	116100188	116100506	116100348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDST4	67156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336161803813485
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM1L1	484131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr4	120962747	120963053	120963021	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NA	NA	NA	NA	RP11-679C8.2	23060	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	123719302	123719557	123719375	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	26306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	124521229	124521410	124521292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	205279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	127487763	127488061	127487932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	1054365	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.21799712268772
chr4	127560832	127561219	127561186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	981207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr4	127603303	127603442	127603412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	938984	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264273298871067
chr4	127607957	127608317	127608138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	934109	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510659935452152
chr4	127610256	127610572	127610414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	931854	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	127657029	127657204	127657094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	885222	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.30298239404586
chr4	127699482	127699754	127699681	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	842672	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.98086286296424
chr4	127826976	127827009	127826993	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	715417	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.428216718160683
chr4	127828532	127828546	127828541	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	713880	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26631791491824
chr4	127856646	127856765	127856706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	685661	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	129088221	129088417	129088319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1B	107798	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	129389693	129389923	129389761	Y	NA	NA	PHF17,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	177787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	129438976	129439122	129439055	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	227070	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	133266182	133266225	133266204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	802245	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr4	139747631	139747907	139747769	Y	NA	NA	LOC641365	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-98O2.1	54927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.04698406040904
chr4	140017684	140017800	140017744	Y	RAB33B,ELF2	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	78572	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	140110155	140110499	140110369	Y	CCRN4L,ELF2	ELF2	ELF2,NAA15,C4orf49,NDUFC1	IMR90	Hi-C	24141950	ELF2	13783	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	142347756	142348088	142347922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-362F19.1	95984	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	237725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	147190540	147190781	147190701	Y	ZNF827,LSM6	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	95703	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	147196519	147196807	147196609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	101682	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	149467274	149467593	149467420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	816060	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	151201811	151202040	151201910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	732839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	151264145	151264674	151264371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	670205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	151314417	151314500	151314459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	620379	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	151873741	151873900	151873783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	60979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	153190429	153190517	153190474	Y	NA	NA	FAM160A1,PET112,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4453	264899	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	153412522	153412921	153412842	Y	NA	MIR4453	NA	NA	NA	NA	MIR4453	42495	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	MIR4453	NA	NA	NA	NA	MIR4453	9288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	154001109	154001458	154001304	Y	KIAA0922,FHDC1	NA	FHDC1,ARFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM2	70036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	154408922	154409996	154409474	Y	NA	KIAA0922	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	23424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	162849	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	194968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	155239135	155239272	155239204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCHS2	171658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	155378623	155378919	155378786	Y	NA	DCHS2	NA	NA	NA	NA	DCHS2	32011	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.610492377014108
chr4	158125886	158126027	158125941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-364P22.1	365615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	159732931	159733171	159733059	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	44641	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	160160934	160161439	160160999	Y	FNIP2,RAPGEF2	NA	FNIP2,RAPGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	FNIP2	472644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	164414222	164414415	164414319	Y	TKTL2,C4orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	328149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr4	166397894	166398226	166397967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSMO1	151119	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	169791118	169791499	169791286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	137927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	170030173	170030283	170030178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	100747	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr4	170543360	170543629	170543529	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	11576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	170547481	170547627	170547562	Y	CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	15697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	170548136	170548389	170548218	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	16352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	173077271	173077317	173077294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT7	1010587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.04813752190857
chr4	174435467	174435730	174435599	Y	HAND2	HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2	13650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	174443232	174443552	174443433	Y	HAND2	HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2	5828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	174443845	174444302	174443959	Y	HAND2	HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2	5078	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr4	183897058	183897307	183897172	Y	NA	NA	WWC2,FAM92A3	IMR90	Hi-C	24141950	DCTD	59969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	184208528	184208558	184208557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIP	155186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	184270914	184271169	184271084	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	92575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	185260528	185261047	185260753	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	132687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	185276361	185276710	185276589	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	117024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	185307496	185307655	185307571	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	86079	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr4	185324238	185324411	185324337	Y	ACSL1,IRF2,CASP3	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	69323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr4	185573558	185573933	185573744	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	4895	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	186007389	186007737	186007420	Y	LRP2BP,CCDC110	NA	CASP3,SLC25A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A4	54658	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	186037213	186037356	186037285	Y	NA	SLC25A4	LOC100506229,ACSL1,KIAA1430,SLC25A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A4	25039	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr4	186306025	186306048	186306047	Y	NA	LRP2BP,ANKRD37,UFSP2,C4orf47	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	9005	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC110	104154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr4	187371571	187371697	187371634	Y	NA	F11-AS1	NA	NA	NA	NA	F11-AS1	48454	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	187591076	187591113	187591095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	54763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr4	187679181	187679543	187679362	Y	NA	FAT1	LOC339975,FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	33305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr4	187680620	187680766	187680713	Y	NA	FAT1	LOC339975,FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	34744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.80937704752749
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.919653259501374
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAT1	120694	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr4	187810272	187810501	187810328	Y	NA	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	164396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	9.87619288200461
chr4	190197516	190197817	190197669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA4P	194302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr4	190487491	190487755	190487631	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA4P	95372	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	190801470	190801552	190801511	Y	NA	RP11-463J17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-463J17.1	800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	190936592	190936699	190936668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	76649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	126972	127168	127053	Y	NA	NA	PLEKHG4B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC127	89162	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	777448	777883	777776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	85938	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr5	963791	964176	964051	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-43F13.3	31247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	1200004	1200495	1200211	Y	NA	SLC6A19	NA	NA	NA	NA	SLC6A19	294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	1725421	1725568	1725519	Y	NA	NA	MIR4277	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL36	73912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	1746722	1746833	1746762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL36	52647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	3304230	3304631	3304430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	1504716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	5351586	5351742	5351664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	67035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.05210007384959
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	10309087	10309259	10309181	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	CMBL	2949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0662074545205
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	10601684	10601853	10601839	Y	ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	39242	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	581914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	16577761	16577949	16577853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	113860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	18697987	18698184	18698066	Y	NA	CTD-2023M8.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	46098	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	21539943	21540207	21540075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	200001	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.98496955947423
chr5	29796154	29796219	29796166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2134P3.1	988798	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	32366924	32367006	32366965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR12	55809	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	32760271	32760413	32760371	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	230532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619212919522186
chr5	34525926	34526105	34525960	Y	NA	NA	RAI14,RAD1,BRIX1,TTC23L,DNAJC21	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	128237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.455715077506396
chr5	34587608	34588326	34587915	Y	NA	NA	RAI14	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	66016	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr5	36030784	36031024	36030904	Y	UGT3A2	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	119039	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.40331227362731
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	53296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	399651	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	39194499	39195200	39195005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	77430	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr5	39224309	39224533	39224438	Y	FYB	FYB	NA	NA	NA	NA	FYB	48097	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	22952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	40796420	40796758	40796693	Y	NA	TTC33,RPL37,CARD6	NA	NA	NA	NA	PRKAA1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr5	41826733	41826755	41826744	Y	NA	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	41866	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.839044212050877
chr5	42999523	42999876	42999700	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	16655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	44943814	44943963	44943889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	136787	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	52094372	52094720	52094546	Y	NA	PELO	NA	NA	NA	NA	PELO	12598	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	53298305	53298413	53298402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	184789	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	53309437	53310024	53309694	Y	ARL15	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	195921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	203990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	53496834	53497083	53496859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	107329	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr5	53597184	53597322	53597243	Y	SNX18,SNX18,ARL15	ARL15,LINC01033	NA	NA	NA	NA	ARL15	7090	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	53998804	53998843	53998825	Y	NA	NA	HSPB3,SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	187215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr5	54033914	54034212	54034128	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	222325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	18.386914389671
chr5	54039991	54040439	54040234	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18,GPX8,CDC20B	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	228402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	309388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	121325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr5	54731133	54731267	54731160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	129545	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr5	55811954	55812276	55812115	Y	NA	AC022431.1	MAP3K1	IMR90	Hi-C	24141950	AC022431.1	13055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	56468272	56468727	56468348	Y	MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1	GPBP1	NA	NA	NA	NA	GPBP1	497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	1760647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.20828592136291
chr5	58243768	58244167	58243981	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	1749850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	58255899	58256231	58256006	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	1737786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	58314415	58314788	58314579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	1679229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	1548498	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	59183388	59183889	59183871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	810128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	59917855	59917860	59917858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	76157	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	60239574	60239836	60239702	Y	ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8	ERCC8,NDUFAF2	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	618	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	64062726	64062917	64062822	Y	NA	SREK1IP1	NA	NA	NA	NA	CWC27	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.647156856141725
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	145831	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	78260	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	65030733	65031192	65030953	Y	SREK1,ERBB2IP,SGTB	NLN,SGTB	NA	NA	NA	NA	SGTB	13871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	65228217	65228394	65228309	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	7914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	65529315	65529329	65529322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	95516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	67716540	67716815	67716672	Y	PIK3R1,PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	206992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr5	67719111	67719318	67719238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	209563	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	71505945	71506221	71506083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	104884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	71998945	71999238	71999064	Y	NA	NA	ZNF366,TNPO1	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	110901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	72118223	72118546	72118402	Y	TNPO1	TNPO1	NA	NA	NA	NA	TNPO1	8084	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	NA	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	GFM2	102443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	74805918	74806308	74805968	Y	NA	POLK	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	76977025	76977227	76977132	Y	OTP	NA	NA	NA	NA	NA	WDR41	62589	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	77779546	77779957	77779719	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	125207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	77822722	77823939	77823093	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	168383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	77940704	77941073	77940964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	122771	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	77974245	77974379	77974312	Y	NA	NA	SCAMP1,LHFPL2,ARSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LHFPL2	89465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	78686873	78686981	78686927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-342F17.1	117276	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	78744780	78744887	78744834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-342F17.1	59370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr5	80705760	80705793	80705777	Y	ACOT12	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC9	110351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	80707651	80707683	80707665	Y	SSBP2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC9	112242	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr5	81054697	81054861	81054755	Y	NA	SSBP2	SSBP2,ATG10	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP2	9081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.79696098945322
chr5	81074673	81075064	81074862	Y	NA	SSBP2	SSBP2,ZCCHC9,ATG10	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP2	29057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20270437521007
chr5	81148608	81149026	81148707	Y	SSBP2	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	3188	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	82005927	82005935	82005931	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	365382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	82356692	82356869	82356781	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	14448	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	82636435	82636494	82636447	Y	XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	264753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	326678	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	84744146	84744237	84744174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	1167484	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	84859384	84859724	84859554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	1051997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr5	85789046	85789185	85789116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	122536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	86610420	86610785	86610768	Y	NA	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	48715	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	86617714	86617757	86617736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	56009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	86673186	86673474	86673330	Y	CCNH,CCNH	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	33362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	88030090	88030417	88030349	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	146728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	88063737	88063896	88063817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	113249	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	88101722	88102045	88101857	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	75100	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	5689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	88171456	88171902	88171752	Y	MEF2C,MEF2C	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	5243	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	88177466	88177636	88177509	Y	NA	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	321	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	88182731	88182852	88182759	Y	MEF2C,MEF2C	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	5586	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	88219671	88220042	88220001	Y	NA	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	21749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	88716854	88717050	88716925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	518932	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	89940937	89941287	89941029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD3	117536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.03564913544946
chr5	90096928	90097131	90097030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD3	273527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	90174732	90174912	90174751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD3	351331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	90236488	90236655	90236581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-90P	327889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr5	90680524	90680637	90680608	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3348	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	423389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	93304446	93304744	93304683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	140660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	94843632	94843977	94843805	Y	NA	TTC37,ARSK	NA	NA	NA	NA	TTC37	44734	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264273298871067
chr5	95053997	95054284	95054091	Y	ELL2,RHOBTB3	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB3	6771	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	95064673	95064837	95064747	Y	ELL2	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2154I11.2	1162	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	95170246	95170624	95170377	Y	GLRX,ELL2	GLRX,C5orf27	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	13537	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	96142552	96142955	96142798	Y	CAST,CAST,LNPEP	ERAP1	NA	NA	NA	NA	ERAP1	749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	87213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446994534998318
chr5	105489939	105490092	105490081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6N13.1	763268	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	109079577	109079706	109079642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	56510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	110830968	110831101	110831035	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	15187	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446994534998318
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	114749513	114749705	114749609	Y	FEM1C	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	118985	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2	NA	NA	NA	NA	AC010226.4	21927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	118605337	118605637	118605457	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	2950	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.436937260668762
chr5	118626064	118626362	118626186	Y	DMXL1,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	23677	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	118659966	118660476	118660173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	57579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	118666258	118666609	118666386	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	63871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr5	119848516	119848911	119848640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	50543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.83103155376849
chr5	121425326	121425585	121425567	Y	NA	ZNF474	SRFBP1,ZNF474,LOC100505841,LOX	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF474	37623	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	122690309	122690381	122690346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP120	66905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	123987356	123987539	123987440	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	155387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	125849839	125850027	125849933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHAX	83933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr5	126015927	126016326	126016055	Y	LMNB1,LMNB1	NA	LMNB1,MEGF10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-395C3.1	53916	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr5	126087846	126088015	126087939	Y	NA	LMNB1	MEGF10,LMNB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNB1	22300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	126199771	126199925	126199848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	89456	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf63	71695	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	126708435	126708706	126708571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC1	142595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	130718102	130718482	130718270	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	138916	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	130730635	130730890	130730763	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	151449	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.57458764285785
chr5	131633963	131634368	131634191	Y	IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	4955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	131641002	131641297	131641050	Y	NA	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	11994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr5	131830040	131830170	131830098	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	5550	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr5	132001614	132001710	132001656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	69620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr5	132404436	132404641	132404539	Y	LEAP2	ZCCHC10,HSPA4	NA	NA	NA	NA	HSPA4	18782	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr5	133266048	133266394	133266263	Y	NA	C5orf15	NA	NA	NA	NA	C5orf15	36084	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	133463152	133463566	133463254	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	14750	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.408993324049223
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	56760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463938181994979
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.563822484302603
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr5	134469772	134469821	134469797	Y	C5orf20	NA	PCBD2,LOC340073,PITX1,CATSPER3,H2AFY	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	101269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	134527149	134527274	134527245	Y	NA	NA	CATSPER3,PCBD2,H2AFY,PITX1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	158646	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr5	134791969	134792408	134792068	Y	H2AFY	NA	H2AFY	K562	ChIA-PET	22265404	H2AFY	58365	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.42847902511255
chr5	134812502	134812741	134812563	Y	NA	NA	CXCL14	IMR90	Hi-C	24141950	H2AFY	78898	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.23842583904437
chr5	135955852	135956149	135955964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	235168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	136104885	136104913	136104899	Y	NA	NA	SPOCK1	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-1I21.2	86404	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.02202775513
chr5	137785775	137785891	137785836	Y	WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	REEP2	13069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.948042773394738
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.02865182084523
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26453560582294
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	138436608	138436808	138436708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	170633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	138499803	138499980	138499892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	107461	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.565159216124082
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399827204267319
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr5	139049454	139050310	139049802	Y	MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	24570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.675100792761264
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	51490	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr5	139077054	139077268	139077188	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52170	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47269062981026
chr5	139077393	139077627	139077507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52509	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	65532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337550396380631
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr5	139652898	139653497	139653234	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	27209	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.827598345154176
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.95765447045047
chr5	140457576	140457668	140457630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF7	240662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	140714021	140714065	140714043	Y	PCDHB12,PCDHB15,PCDHGC4	TAF7,PCDHGA2,PCDHGA3,PCDHGA4,PCDHGB2,PCDHGA7	NA	NA	NA	NA	PCDHGA2	2474	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGA11	94751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	85728	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	141706626	141706892	141706857	Y	NA	AC005592.2,SPRY4	NA	NA	NA	NA	SPRY4	2606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr5	141826368	141826739	141826520	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	122348	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	142024486	142024769	142024581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	123180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	142315332	142315934	142315386	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	167383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	142965486	142966022	142965783	Y	NR3C1,NR3C1	NA	NR3C1,ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	152409	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr5	145094622	145094634	145094628	Y	GRXCR2	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	118298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	93127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr5	149045719	149046022	149045888	Y	CSNK1A1,SLC26A2	NA	ARHGEF37,PPARGC1B,PDE6A,SLC26A2,TIGD6,HMGXB3,CSF1R,PDGFRB,SLC6A7,CAMK2A	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1B	61839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.87712445962989
chr5	149111957	149112473	149112231	Y	AFAP1L1,IL17B,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	4096	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	149319494	149320025	149319793	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	18275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	149667554	149667894	149667725	Y	SYNPO,SLC6A7,CAMK2A	NA	NA	NA	NA	NA	TCOF1	67308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	149840923	149841036	149840980	Y	SYNPO,ZNF300	RPS14,NDST1,CTC-367J11.1	NDST1,SYNPO,RBM22,DCTN4	IMR90	Hi-C	24141950	RPS14	13604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	150142965	150143377	150143063	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	DCTN4,C5orf62	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	DCTN4	6294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.492327695888343
chr5	150261861	150262245	150261884	Y	IRGM	ZNF300	NA	NA	NA	NA	ZNF300	20300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	150395903	150396061	150395982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF300P1	72052	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	150401918	150402484	150402308	Y	GPX3,TNIP1	NA	NA	NA	NA	NA	TNIP1	68654	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	150455023	150455538	150455407	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	15600	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	150873344	150873758	150873456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A1	58737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	151088912	151089056	151088970	Y	SLC36A3	SPARC	NA	NA	NA	NA	SPARC	24186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	153569046	153569266	153569156	Y	NA	GALNT10	NA	NA	NA	NA	GALNT10	756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	154313326	154313392	154313358	Y	NA	GEMIN5,MRPL22	NA	NA	NA	NA	GEMIN5	2377	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.75660099475941
chr5	157257409	157257732	157257678	Y	NA	CLINT1	NA	NA	NA	NA	CLINT1	26451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	157521038	157521096	157521067	Y	NA	NA	EBF1	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	236855	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	22663	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	159688113	159688294	159688164	Y	CCNJL	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	4853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	159837617	159837836	159837727	Y	NA	C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	SLU7	8882	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	162811410	162811429	162811421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-541P9.3	50903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr5	163785967	163786426	163786136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-340A15.2	64265	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr5	163787570	163787906	163787815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-340A15.2	65868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	169729974	169730499	169730319	Y	KCNMB1,LCP2	LCP2	NA	NA	NA	NA	LCP2	6743	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	169733349	169733836	169733608	Y	NA	LCP2	LCP2,KCNIP1,C5orf58	IMR90	Hi-C	24141950	LCP2	10118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	171540284	171540310	171540295	Y	STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	73080	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr5	172216221	172216413	172216309	Y	C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	20023	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.576605083020784
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr5	172308731	172309533	172309021	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	49453	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	172451248	172451363	172451250	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	42488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	20353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	22163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	173208911	173209406	173209234	Y	CPEB4	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	37697	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	173280521	173280844	173280699	Y	NA	CPEB4	BOD1,CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	32439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555547519068352
chr5	173282717	173283022	173282777	Y	NA	CPEB4	BOD1,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	30261	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr5	173311853	173312083	173311958	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	1200	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	173312606	173312854	173312733	Y	CPEB4	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr5	176330386	176330599	176330516	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,NSD1,HK3	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	117035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	176421508	176421945	176421807	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	25689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	176422952	176423155	176423071	Y	HK3,UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	24479	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	176543923	176544044	176544003	Y	TSPAN17,PRR7,DBN1	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	NSD1	13982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	176782864	176783054	176782988	Y	NA	MXD3,LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	26	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	7330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.565159216124082
chr5	176855088	176855271	176855220	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3	GRK6,PRR7,DBN1	NA	NA	NA	NA	PRR7	16175	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DOK3,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	177505252	177505654	177505536	Y	NA	RP11-889L3.1,N4BP3	N4BP3,GMCL1P1,NHP2,HNRNPAB,AGXT2L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-889L3.1	24647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	178255974	178256130	178256077	Y	NA	ZNF354B	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	28824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.00977449973852
chr5	178800289	178800431	178800342	Y	CBY3,C5orf60	NA	ADAMTS2	IMR90	Hi-C	24141950	RUFY1	175128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	179188972	179189165	179189138	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	MAML1	31121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	179434619	179435010	179434852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	62108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	179513863	179514025	179513944	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	16745	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	CTB-129O4.1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	180285670	180285966	180285744	Y	NA	MGAT1,LINC00847,ZFP62	NA	NA	NA	NA	ZFP62	320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	180300925	180301152	180301099	Y	MGAT1,MGAT1,BTNL8	LINC00847,ZFP62	MGAT1,LOC729678,LOC100859930,BTNL9,BTNL8	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP62	14639	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	180473265	180473624	180473271	Y	BTNL9	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	143300	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr5	180527494	180527529	180527504	Y	NA	NA	MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	89395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr5	180600516	180600767	180600667	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	16157	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336161803813485
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	1003791	1004094	1003851	Y	HUS1B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	312674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	2738073	2738511	2738408	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	25137	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	2849123	2849376	2849246	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	8883	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.692935594305576
chr6	2853307	2853467	2853442	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	13067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	2874865	2875144	2874975	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB9	26370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	2921060	2921305	2921156	Y	NA	SERPINB9,SERPINB6	SERPINB9,SERPINB6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	19546	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	2980500	2980669	2980575	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6,NQO2,RP1-90J20.8,HTATSF1P2	WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NQO2	5552	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr6	2992078	2992424	2992251	Y	NA	SERPINB6,NQO2,RP1-90J20.8,HTATSF1P2	NA	NA	NA	NA	RP1-90J20.8	4944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr6	3052992	3053074	3053033	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1	MYLK4,WRNIP1,DKFZP686I15217,NQO2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RIPK1	9151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.1490962490858
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	3426515	3426916	3426721	Y	NA	SLC22A23	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	28340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	3685850	3685982	3685964	Y	NA	NA	SLC22A23,PSMG4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	161638	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	4189159	4189278	4189216	Y	C6orf201,C6orf146	RP3-400B16.2	CDYL	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-400B16.2	1809	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	4460888	4461081	4461066	Y	NA	NA	CDYL	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	243312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	4717932	4718044	4717990	Y	PPP1R3G	CDYL	NA	NA	NA	NA	CDYL	13539	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	4728304	4728573	4728482	Y	NA	CDYL	NA	NA	NA	NA	CDYL	23911	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	5280343	5280601	5280557	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	21066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	401666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	5671479	5671687	5671530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	412202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	6678540	6678781	6678655	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	427049	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.67884816907312
chr6	6712780	6713068	6712936	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	392762	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	6750084	6750462	6750414	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	355368	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr6	6885637	6886125	6885854	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	6890950	6891223	6891087	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	214607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	7041789	7041905	7041882	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	63925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.408993324049223
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr6	7166669	7166920	7166778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	60839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.20341225943577
chr6	7202193	7202713	7202370	Y	RIOK1,SSR1,RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	96363	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.582102863120743
chr6	7591248	7591486	7591394	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	2816	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	7996922	7997003	7996963	Y	BMP6,TXNDC5,TXNDC5	TXNDC5	NA	NA	NA	NA	TXNDC5	27643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	9037386	9037741	9037564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	603592	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	285174	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	10771427	10771996	10771700	Y	ELOVL2,MAK	TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	25400	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	11393241	11393536	11393390	Y	NEDD9	NA	NEDD9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM170B	142402	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	11730766	11731308	11730965	Y	TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	194828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	11921182	11921467	11921322	Y	NA	NA	ADTRP,HIVEP1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-456H18.2	84436	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr6	11975838	11976169	11975921	Y	TMEM170B,HIVEP1	RP11-456H18.2,HIVEP1	ADTRP,HIVEP1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-456H18.2	29734	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	12052115	12052407	12052202	Y	HIVEP1	RP11-456H18.2,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	45120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	13096654	13096703	13096662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	115585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	13302642	13303798	13303216	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	23017	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	13462093	13462464	13462300	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	23430	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	13709903	13710182	13710119	Y	TBC1D7,CD83,RANBP9	RANBP9	SIRT5,NOL7	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	107	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF182	288384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr6	14587491	14587822	14587657	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	656705	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	14640701	14640843	14640773	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	603684	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr6	14659204	14659944	14659341	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	584583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	14706582	14707144	14706813	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	537383	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	14711169	14711813	14711625	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	532714	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345773500869215
chr6	14735052	14735658	14735282	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	508869	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	14759070	14759272	14759192	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	485255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	14777704	14777964	14777898	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	466563	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	14975402	14975457	14975430	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	269070	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	14982265	14982427	14982346	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	262100	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	15078356	15078482	15078419	Y	NA	NA	JARID2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	JARID2	166045	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	15299924	15300312	15299931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	53059	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr6	15313668	15313748	15313709	Y	DTNBP1,JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	66803	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	15554239	15554360	15554316	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	106929	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr6	15555860	15556076	15555941	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	105213	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.748823467544654
chr6	15569583	15569742	15569685	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	91547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr6	15621958	15622209	15622147	Y	JARID2	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	39080	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	16001247	16001264	16001256	Y	NA	NA	MYLIP	K562	ChIA-PET	22265404	MYLIP	126092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	16215873	16216103	16215954	Y	MYLIP	GMPR	GMPR,JARID2,DTNBP1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GMPR	20708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	16256823	16257099	16256961	Y	NA	GMPR	NA	NA	NA	NA	GMPR	20012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	16322882	16323237	16323091	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	86071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	17712711	17712926	17712817	Y	NA	NUP153	FAM8A1,NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	8055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr6	17932767	17932988	17932837	Y	RNF144B,KDM1B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	52866	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	18150871	18151234	18151053	Y	NUP153,KDM1B	TPMT,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	2071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	18327832	18328148	18328035	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	DEK	64778	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	20069175	20069519	20069346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	141151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	20206748	20206864	20206806	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	3806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456160654780222
chr6	20444927	20445761	20445060	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	44529	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	20575670	20575691	20575681	Y	NA	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	42982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	21129910	21130117	21129994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	597222	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	21141154	21141340	21141254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	608466	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	21258987	21259049	21259040	Y	NA	NA	CDKAL1	IMR90	Hi-C	24141950	CDKAL1	726299	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr6	21997954	21998076	21998022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	1465266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	22024666	22024942	22024815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	1491978	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	22026062	22026222	22026161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	1493374	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.18628534211716
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	26029019	26029363	26029242	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3B	925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr6	26034352	26034599	26034546	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AB	2556	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.673712200194116
chr6	26143490	26143769	26143630	Y	NA	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D	NA	NA	NA	NA	HIST1H1E	10790	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	26283996	26284379	26284279	Y	NA	HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H4H	234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	26322637	26323123	26322876	Y	NA	HIST1H4H,BTN3A2	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H4H	38875	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr6	26474010	26474599	26474187	Y	NA	BTN2A1,HCG11	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	17860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336161803813485
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291274220197285
chr6	27071259	27071558	27071409	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	26983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr6	27205361	27205470	27205416	Y	NA	RP11-209A2.1,PRSS16	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	PRSS16	8010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr6	27416333	27416557	27416445	Y	NA	ZNF184	NA	NA	NA	NA	ZNF184	22340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr6	27637197	27637397	27637297	Y	OR2B6,OR2B2	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	136312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	27637652	27637706	27637685	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	136003	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	27655152	27655475	27655306	Y	FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM	NA	LOC100507173,ZNF184	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HIST1H2BL	118234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	27745629	27745723	27745700	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	27986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165	NA	NA	NA	NA	ZNF165	25723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.956763315902818
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZNF192P1	26290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr6	28180543	28180884	28180590	Y	NA	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	44127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	28188130	28188520	28188276	Y	ZNF193	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	36491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.16630220303433
chr6	28299231	28299616	28299424	Y	GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	16075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	28302002	28302386	28302196	Y	NA	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	13305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12,ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	5674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	25.6738527257124
chr6	28521433	28521958	28521683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	112154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	28565127	28565440	28565259	Y	NA	NA	SCAND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZSCAN23	155848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	192651	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	93748	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446994534998318
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	89087	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	28782096	28782213	28782183	Y	ZSCAN12,GPX6,SCAND3,OR2J3,OR14J1,OR2W1,OR2B3,TRIM27	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	22570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	28805076	28805418	28805247	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	28822567	28822754	28822660	Y	OR2J3,OR14J1,OR2B3	XXbac-BPG308K3.5,HCG14	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	17784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5,HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328829853872553
chr6	28860175	28860528	28860363	Y	NA	HCG14,TRIM27	NA	NA	NA	NA	HCG14	1779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15,ZNF311	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	28985048	28985267	28985158	Y	NA	HCG15,ZNF311	TRIM27,LOC401242	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZNF311	13955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	91718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.61115510873921
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	90532	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463492604721153
chr6	29935319	29935652	29935489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	89024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	30010922	30011054	30010960	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	13622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	37324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	TRIM39	37784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr6	30651242	30651620	30651357	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2052	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	30703511	30703691	30703651	Y	NA	PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	NA	NA	NA	NA	FLOT1	4819	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	30716024	30716359	30716084	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	5693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	30761567	30761766	30761739	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PRR3,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,PBMUCL1,HLA-C,FLOT1,IER3	HCG20	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,MDC1,DDR1,IER3,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4,MUC22,PSORS1C3,TCF19,POU5F1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	28965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	30840574	30840974	30840689	Y	ABCF1,C6orf136	DDR1,GTF2H4,VARS2	DHX16,VARS2,DPCR1,DDR1,MUC22,CCHCR1,MDC1,PPP1R18,NRM,TUBB,IER3,FLOT1,SFTA2,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	1224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	12.8457659725099
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	30923441	30923743	30923649	Y	GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1	GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	VARS2	49422	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,C6orf25,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.893543492722807
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,C6orf25,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.25746596283388
chr6	31761868	31762215	31762042	Y	LY6G5C	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48	NA	NA	NA	NA	VARS	138	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328829853872553
chr6	31789098	31789184	31789146	Y	TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	4328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.17487138052766
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8	NA	NA	NA	NA	TNXB	541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	32099404	32099781	32099616	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5	NA	NA	NA	NA	FKBPL	3336	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.801488578375611
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	TAP2,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	33396313	33396709	33396628	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	10466	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	33872168	33872571	33872419	Y	PHF1,ZBTB9,LEMD2	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	117255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.967266167506199
chr6	33872922	33873175	33873050	Y	PHF1	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	118009	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.31214851382776
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	34341997	34342182	34342078	Y	HMGA1	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	16269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	34615040	34615205	34615123	Y	NA	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	47431	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	34625381	34625487	34625387	Y	HMGA1	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	34760607	34760986	34760926	Y	UHRF1BP1	SNRPC,UHRF1BP1	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1	2750	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	34992488	34992843	34992549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	137446	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	35026753	35026994	35026778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	171711	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	35170056	35170397	35170225	Y	NA	NA	TCP11,ANKS1A,ZNF76,SCUBE3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF76	54289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	35228332	35228733	35228603	Y	PPARD,ZNF76	ZNF76,DEF6	NA	NA	NA	NA	ZNF76	3646	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.24829984305197
chr6	35336371	35336758	35336422	Y	NA	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	28036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	35561770	35562146	35562007	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	40120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	35568316	35568651	35568441	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	46666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr6	36086314	36086741	36086595	Y	SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3	NA	NA	NA	NA	NA	BRPF3	75780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	36088988	36089165	36089121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRPF3	73356	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	36318512	36318897	36318687	Y	CPNE5	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD20	89647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	PXT1	591	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.456160654780222
chr6	36997320	36997527	36997354	Y	STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,C6orf89,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2	MTCH1	NA	NA	NA	NA	MTCH1	45246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	37016531	37017062	37016596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTCH1	64457	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510214358178326
chr6	37017119	37017495	37017423	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	NA	NA	NA	NA	MTCH1	65045	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	37017809	37018367	37018074	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	NA	NA	NA	NA	MTCH1	65735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.22192776932154
chr6	37018897	37019476	37019424	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	66823	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	37019695	37020025	37019928	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	67621	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	37025964	37026081	37026014	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	73890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chr6	37030245	37030479	37030361	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,FTSJD2	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	78171	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	37051169	37051555	37051360	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2	NA	CPNE5,PIM1,C6orf89,PPIL1,FGD2,TBC1D22B,MTCH1,TMEM217	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	84424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	37077622	37078018	37077795	Y	C6orf89,TBC1D22B,PIM1	NA	PIM1,PPIL1,TMEM217,CPNE5,FGD2,C6orf89,TBC1D22B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	57961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.692044439757926
chr6	37095912	37096089	37096014	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	39890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	37150975	37151397	37151210	Y	TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1	PIM1	NA	NA	NA	NA	PIM1	14996	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.892652338175157
chr6	37155093	37155653	37155211	Y	TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1	PIM1	NA	NA	NA	NA	PIM1	19114	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.363660163159197
chr6	37159773	37160042	37159866	Y	TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1	PIM1	NA	NA	NA	NA	PIM1	23794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr6	37269905	37270172	37270040	Y	C6orf89,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	TMEM217	45974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	37397282	37397451	37397362	Y	NA	NA	RNF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC167	68247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.3735341671668
chr6	37673638	37673745	37673684	Y	NA	NA	MDGA1	K562	ChIA-PET	22265404	ZFAND3	111530	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	37745135	37745338	37745265	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	39937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	38514218	38514357	38514288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	91567	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	39195802	39196179	39195967	Y	KCNK5	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.765767114541315
chr6	39949042	39949079	39949061	Y	DAAM2,MOCS1	MOCS1,RP1-278E11.3	KIF6	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-278E11.3	24470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	40132230	40132456	40132336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRG1	168237	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.822546142328042
chr6	41286601	41286824	41286755	Y	NFYA,TFEB,TREML4,TREM1	NA	C6orf130	K562	ChIA-PET	22265404	TREML2	119669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	41546441	41546593	41546496	Y	FRS3	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	32082	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr6	41907242	41907431	41907365	Y	TAF8,TFEB,CCND3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20316	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491882118614517
chr6	41994407	41994555	41994505	Y	TFEB	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	21540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	41996341	41996754	41996467	Y	NA	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	19341	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0662074545205
chr6	42013318	42013860	42013560	Y	TFEB,TRERF1,CCND3	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	2235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr6	42283170	42283354	42283262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	99567	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR2	154267	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR2	108733	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	43635973	43636240	43636108	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	17288	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.454772062213074
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.727765903592221
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.1	145664	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr6	43979820	43980209	43980006	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.1	60180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	30636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555547519068352
chr6	44010067	44010199	44010133	Y	C6orf223	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	30190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	44011469	44011879	44011690	Y	NA	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	28510	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	27904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	44026121	44027353	44026480	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	13036	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.948488350668565
chr6	44031882	44032664	44032378	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	7725	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	44039522	44039890	44039644	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.1	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	3939	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.792322458593706
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	44169709	44170051	44169929	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	15191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	44443307	44443732	44443616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	90045	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr6	44924205	44924374	44924290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	419316	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	44953084	44953474	44953278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	390216	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	45294493	45294953	45294580	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	45298832	45299186	45298935	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	44504	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	41388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	45319946	45320392	45320176	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	23298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	45404651	45404813	45404715	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	60961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	45633739	45634017	45633866	Y	NA	NA	RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	290049	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF21	172933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	47550559	47550935	47550672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	107034	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	49613970	49614320	49614269	Y	CENPQ,RHAG	RHAG	RHAG,CRISP3	K562	ChIA-PET	22265404	RHAG	11418	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	52376478	52376751	52376615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62962	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	52439625	52439825	52439764	Y	TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr6	52463140	52463494	52463299	Y	NA	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	23427	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	53165916	53166137	53165996	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	45810	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	53174339	53174666	53174484	Y	FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	37281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.03692678607949
chr6	53225493	53225821	53225675	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	13546	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	57354557	57355032	57354719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	176954	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	57389697	57390070	57389732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	212094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	64386722	64387357	64386973	Y	PHF3	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	42997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	69390302	69390390	69390344	Y	NA	BAI3	NA	NA	NA	NA	BAI3	47043	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	69431654	69431887	69431658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	88395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	69471294	69471734	69471424	Y	BAI3	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	128035	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.31353710639491
chr6	69594665	69594883	69594694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	251406	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	70479579	70479974	70479889	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	25029	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	72683550	72683736	72683643	Y	RIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	KRT19P1	391126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	73330314	73330844	73330342	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	73378236	73378609	73378395	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	48716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	75997264	75997445	75997280	Y	NA	COX7A2,TMEM30A	NA	NA	NA	NA	TMEM30A	4580	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	76494746	76495208	76494920	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	37837	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	80246020	80246303	80246162	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	845	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.719490938357967
chr6	83546132	83546541	83546207	Y	NA	NA	UBE3D,IBTK	IMR90	Hi-C	24141950	DOPEY1	228844	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	83756669	83757034	83756938	Y	PGM3,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	18351	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	84761974	84762047	84762024	Y	NA	MRAP2	NA	NA	NA	NA	MRAP2	20499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr6	84762376	84762517	84762446	Y	NA	MRAP2	NA	NA	NA	NA	MRAP2	20901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	84917634	84917758	84917696	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	17595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	85484432	85484730	85484624	Y	TBX18	TBX18	TBX18	IMR90	Hi-C	24141950	TBX18	12195	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	86377022	86377042	86377037	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	9409	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	87257432	87257676	87257554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P27	462580	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	87897430	87897787	87897609	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	36879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	88414970	88415193	88415174	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	5043	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	88441576	88441861	88441705	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2,AKIRIN2-AS1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	31649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	89095880	89096050	89095968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	111172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	90793727	90794010	90793801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	210617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	91004830	91005121	91005041	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	91134952	91135221	91135020	Y	NA	NA	BACH2	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	130325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	91168030	91168508	91168309	Y	NA	NA	BACH2,MDN1,CASP8AP2,GJA10	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K7	126256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr6	91320632	91321099	91320814	Y	MAP3K7,MAP3K7	MAP3K7	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	25868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	95887569	95887862	95887716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	135557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	100676865	100677032	100676949	Y	NA	NA	SIM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	299120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	105401566	105401766	105401705	Y	LIN28B	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	1157	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.67669983153461
chr6	105402548	105402641	105402597	Y	NA	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	282	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr6	105403500	105403904	105403556	Y	NA	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.190996201361503
chr6	105477997	105478373	105478087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIN28B	75074	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	105743987	105744339	105744163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREP	104620	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	106258484	106259193	106259052	Y	NA	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	409525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.810654698157515
chr6	106340722	106341083	106341004	Y	PRDM1	NA	PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	ATG5	430583	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	ATG5	330995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr6	106574001	106574334	106574104	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG5	197332	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	107773333	107773402	107773368	Y	SOBP	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	5366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	107774853	107775271	107775085	Y	BEND3	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	3497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	108435932	108436209	108436071	Y	NA	OSTM1	LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1,SEC63	IMR90,H1ESC,GM12878,HELA,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	OSTM1	48849	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	108490902	108491184	108491048	Y	NA	OSTM1	NA	NA	NA	NA	OSTM1	5844	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	109558807	109559007	109558956	Y	SMPD2,MICAL1,CD164	NA	CD164,CCDC162P	K562	ChIA-PET	22265404	CD164	142755	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	109625470	109626069	109625736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD164	75693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	110502951	110503352	110503102	Y	FIG4,CDC40	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	CDC40	3607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	111727743	111727975	111727836	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	74739	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	112116190	112116657	112116390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	75998	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	113772353	113772409	113772395	Y	NA	NA	MARCKS,FLJ34503	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	404132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	114167209	114167452	114167327	Y	MARCKS	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	9089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	117914764	117915043	117914904	Y	NA	GOPC	NA	NA	NA	NA	GOPC	6648	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	119029991	119030657	119030634	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	CEP85L	NA	NA	NA	NA	CEP85L	753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	119468463	119468799	119468540	Y	FAM184A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM184A	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	119634187	119634405	119634308	Y	MCM9,MAN1A1	MAN1A1	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	34521	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	119668375	119668773	119668762	Y	NA	MAN1A1	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	153	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr6	125278816	125279129	125278841	Y	NA	RNF217,RP11-510H23.1	NA	NA	NA	NA	RNF217	2562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	125347013	125347309	125347174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-510H23.1	64828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	125420389	125420754	125420652	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	17441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291274220197285
chr6	126267356	126267782	126267584	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	8145	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	126271537	126271736	126271680	Y	NA	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	4191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr6	130008447	130008678	130008538	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	20692	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	130030425	130030727	130030721	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	1055	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr6	132474362	132474724	132474477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTGF	203849	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	134636367	134636606	134636545	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	644	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	135344059	135344242	135344151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	77952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.58239707537982
chr6	135636764	135637196	135637190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYB	136311	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	135647254	135647460	135647355	Y	MYB,AHI1	NA	NA	NA	NA	NA	MYB	146801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	135804002	135804049	135804028	Y	NA	LINC00271,AHI1	NA	NA	NA	NA	LINC00271	12440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281662523141555
chr6	136702762	136702864	136702842	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	93773	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	136912004	136912367	136912204	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	42047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	137242009	137242335	137242164	Y	IL20RA,SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	100292	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	137538142	137538256	137538167	Y	NA	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr6	138184436	138184726	138184672	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	1625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr6	138231733	138231922	138231805	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	45382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	139697079	139697371	139697327	Y	NA	CITED2	NA	NA	NA	NA	CITED2	3322	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	139763356	139763495	139763425	Y	C6orf115	NA	LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	69599	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	139854911	139854985	139854931	Y	HECA,CITED2,CITED2,CITED2	NA	LOC100132735,CITED2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	161154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	140085604	140086085	140085978	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	391847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	140860203	140860346	140860259	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1166446	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	140929042	140929323	140929183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1235285	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr6	142508557	142508921	142508635	Y	NA	VTA1	NA	NA	NA	NA	VTA1	42190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	143476820	143477010	143476926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	97187	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382437979996831
chr6	143608872	143608912	143608892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAT2	160898	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	144064569	144064840	144064663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-468K18.5	61389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	144279957	144280354	144280096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	103381	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	144302032	144302409	144302359	Y	PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	81326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	144384858	144385125	144384924	Y	NA	PLAGL1,SF3B5	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	1123	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	TPT1P4	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPT1P4	17211	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	145147432	145147802	145147573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	542595	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	146870033	146870230	146870118	Y	NA	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	7204	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	147200853	147201003	147200933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	322558	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.53842060174973
chr6	147202417	147202548	147202496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	321013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	147205032	147205241	147205173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	318320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.9623720379399
chr6	147208204	147208605	147208477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	314956	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.33642411076535
chr6	147217441	147217852	147217780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	305709	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	147219291	147219548	147219426	Y	STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	304013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chr6	147447991	147448237	147448156	Y	STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	75324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	147480962	147481272	147481115	Y	NA	STXBP5	NA	NA	NA	NA	STXBP5	42289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	147985018	147985058	147985038	Y	NA	RP11-307P5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-307P5.1	5179	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	148524085	148524387	148524236	Y	NA	NA	SASH1,SAMD5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-307P5.1	544246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	149449654	149449877	149449771	Y	ZC3H12D,TAB2	NA	ZC3H12D,TAB2,PPIL4	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	87900	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr6	149693406	149693750	149693583	Y	NA	NA	ZC3H12D	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	155629	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	150075680	150075936	150075837	Y	SUMO4	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	6879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	150200694	150201094	150200866	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	16495	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	150482510	150482848	150482609	Y	NA	PPP1R14C	NA	NA	NA	NA	PPP1R14C	20298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	150588952	150589102	150589017	Y	RAET1G,PPP1R14C	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-7P	56797	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	150590987	150591352	150591048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-7P	54547	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	151366767	151366942	151366858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	51723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	153132437	153132820	153132584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO5	169894	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	154830409	154830718	154830573	Y	CNKSR3	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	616	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.657214130471279
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.957208893176642
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.16514874153481
chr6	157639062	157639495	157639253	Y	C6orf35	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	103138	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	157936149	157936334	157936215	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC14	135984	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.537215279504544
chr6	157942604	157942859	157942786	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC14	142439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	158034114	158034488	158034146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	207808	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr6	158439513	158439767	158439649	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	38625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	158829552	158829958	158829805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	233813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	158895983	158896180	158896053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	167591	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	158982051	158982465	158982168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	75680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.500602661122596
chr6	159284894	159285253	159285074	Y	NA	EZR,C6orf99	OSTCP1	K562	ChIA-PET	22265404	C6orf99	3718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	159359890	159360005	159359951	Y	EZR	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	59214	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	159540030	159540244	159540218	Y	TAGAP	NA	NA	NA	NA	NA	RSPH3	120811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	159862041	159862452	159862257	Y	NA	NA	FNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	WTAP	282165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr6	161549553	161550030	161549828	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	138794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	161620136	161620467	161620302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	72626	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	161647412	161647643	161647524	Y	MAP3K4,AGPAT4	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	45450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr6	163833338	163833600	163833428	Y	QKI	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr6	163950759	163951099	163950781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	117727	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	164758879	164759308	164759212	Y	NA	NA	PARK2,DKFZp451B082,PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	925847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	11.8039378364183
chr6	166795008	166795404	166795174	Y	NA	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	40929	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-514O12.4	251994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.773544641756071
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	KIF25-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF25-AS1	38625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr6	168813720	168814071	168813897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACT2	95286	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.25223048968579
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	590494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr6	169361499	169361602	169361564	Y	NA	NA	PHF10,WDR27,C6orf70,TCTE3,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	643065	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr6	170838453	170838652	170838543	Y	NA	PSMB1,TBP	NA	NA	NA	NA	PSMB1	21777	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	AC147651.4	NA	NA	NA	NA	AC147651.4	11820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	850307	850449	850380	Y	SUN1,SUN1	SUN1	NA	NA	NA	NA	SUN1	3079	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	1066965	1067028	1066969	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	15184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	1329910	1330257	1330187	Y	NA	NA	UNCX	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND2A	131515	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	1500451	1500958	1500750	Y	NA	MICALL2,AC102953.4,INTS1	NA	NA	NA	NA	AC102953.4	2878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.92492063795667
chr7	1501148	1501314	1501260	Y	NA	MICALL2,AC102953.4,INTS1	NA	NA	NA	NA	AC102953.4	3575	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	1574153	1574602	1574313	Y	NA	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5803	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	1659138	1659514	1659188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMG3	50497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.737823177921776
chr7	1883097	1883273	1883258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	103170	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	1894449	1894968	1894908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	114522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	11.5818315261977
chr7	1945683	1945719	1945693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	165756	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	1978042	1978502	1978293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	198115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	2058424	2058871	2058630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	212007	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr7	2058997	2060327	2059312	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	210551	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26636977566391
chr7	2101889	2102279	2102085	Y	ELFN1	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	168599	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	2143904	2144149	2144041	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	126729	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr7	2145561	2145831	2145692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	125047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	2178123	2178459	2178160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	92419	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	2339596	2339897	2339719	Y	LFNG,SNX8	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3B	51824	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	2797465	2798227	2798113	Y	SNX8,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	75028	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	2960647	2961036	2960906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	78689	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	2996430	2996653	2996492	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	84926	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr7	4660172	4660397	4660258	Y	NA	FOXK1	SDK1,FOXK1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXK1	20991	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555547519068352
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chr7	5231323	5231672	5231498	Y	WIPI2	WIPI2	NA	NA	NA	NA	WIPI2	3504	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr7	5571967	5572766	5572739	Y	RBAK,RBAK	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	20538	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364551317706849
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.656768553197455
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	5638553	5639025	5638653	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	8114	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr7	5718052	5718263	5718155	Y	USP42	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	87613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	5740810	5741077	5740967	Y	WIPI2,ACTB,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	78293	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	6096315	6096609	6096412	Y	EIF2AK1	PMS2,AIMP2,EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	EIF2AK1	252	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.88513711791227
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr7	7911710	7911812	7911761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	94613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	8016516	8016759	8016566	Y	GLCCI1	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	10091	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr7	8165403	8166093	8165752	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	133770	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	8295276	8295343	8295310	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	4520	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	8300349	8300667	8300508	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	32	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	250156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	12582030	12582229	12582042	Y	NA	SCIN	SCIN	IMR90	Hi-C	24141950	SCIN	25974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	12624573	12625024	12624751	Y	NA	SCIN	NA	NA	NA	NA	SCIN	16370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.47431633226715
chr7	12758831	12759023	12758905	Y	ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34350	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.427771140886857
chr7	12759260	12759464	12759402	Y	NA	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr7	14042792	14042945	14042854	Y	NA	ETV1	NA	NA	NA	NA	ETV1	13742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19652588676866
chr7	16095120	16095542	16095311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	363405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	16302411	16302620	16302516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	156327	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.391604099778736
chr7	16304887	16305058	16304973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	153889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.93615132922421
chr7	17701568	17701856	17701681	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	276268	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	20217388	20217681	20217578	Y	TWISTNB,MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	37346	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr7	20228342	20228547	20228441	Y	TWISTNB,ITGB8	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	26480	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	15637	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	20242848	20242947	20242898	Y	NA	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	12080	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	20254261	20255002	20254926	Y	MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	25	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	20278131	20278917	20278549	Y	NA	MACC1,AC005083.1	MACC1	K562	ChIA-PET	22265404	AC005083.1	22931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8,RPL23P8,LINC01162	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	20993749	20993911	20993806	Y	SP8	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01162	120699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	21120779	21120894	21120878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01162	247729	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	21395079	21395235	21395151	Y	SP4	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	70417	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	21502446	21502711	21502550	Y	SP4	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	36794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	22122992	22123068	22123014	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	139290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	22162881	22162961	22162899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	179179	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	47340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	22626962	22627257	22627168	Y	NA	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	43287	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	38439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	22711367	22711465	22711416	Y	NA	STEAP1B	LOC100506178,FAM126A,SNORD93,IL6,TOMM7	IMR90	Hi-C	24141950	STEAP1B	40823	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	22737910	22738207	22738060	Y	IL6	IL6	FAM126A,IL6,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	25296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	22740240	22740629	22740473	Y	IL6	IL6	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	22874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr7	22742818	22742960	22742910	Y	NA	IL6	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr7	22742975	22743282	22743130	Y	NA	IL6	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.536769702230717
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	23346374	23346675	23346525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	126928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.19039925907293
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.26299564824104
chr7	24824166	24824267	24824230	Y	DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	194986	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	157922	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	24947142	24947425	24947387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	71828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr7	25010250	25010501	25010375	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	8752	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602714849799349
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.48410459139976
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.674157777467942
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382437979996831
chr7	25992296	25992472	25992423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	197388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	26344916	26345429	26345290	Y	SNX10,SNX10,CBX3,SNX10	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	15375	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	AC004540.4,AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	24337	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	27642128	27642466	27642297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIBADH	58148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	29951912	29952143	29952027	Y	ZNRF2,C7orf41	NA	NA	NA	NA	NA	WIPF3	107810	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	30203047	30203422	30203138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	118501	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	30954838	30955088	30954912	Y	AQP1	NA	NA	NA	NA	NA	AQP1	63828	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	31033316	31033696	31033508	Y	CRHR2,FAM188B	NA	NA	NA	NA	NA	AQP1	142306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	32715865	32716012	32715940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2P1	50169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.893543492722807
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	365233	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	37394321	37394728	37394476	Y	GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	537757	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	38376350	38376385	38376368	Y	NA	AC006033.22,TRGV5	LOC100506776	K562	ChIA-PET	22265404	TRGV5	11238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr7	39660879	39661112	39661042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALA	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	NA	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	PSMA2	147408	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	43612098	43612408	43612297	Y	DBNL	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	7949	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	43644873	43645023	43645002	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	24516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	43732901	43733056	43732913	Y	DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	63223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	43912365	43912715	43912516	Y	NA	MRPS24	NA	NA	NA	NA	MRPS24	4873	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004453.8	68409	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	44654798	44655022	44654925	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	10627	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	44907031	44907191	44907086	Y	NA	H2AFV,PURB	NA	NA	NA	NA	PURB	15769	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	45040907	45041213	45041027	Y	DDX56,OGDH,MYO1G,CCM2	MYO1G,SNHG15,CCM2	NA	NA	NA	NA	CCM2	3833	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	45178203	45178225	45178213	Y	NA	TBRG4	SNHG15	K562	ChIA-PET	22265404	TBRG4	28557	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	45518614	45518951	45518783	Y	CCM2	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT7P2	287666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	47258454	47258947	47258703	Y	NA	NA	IGFBP1,IGFBP3,TNS3,C7orf69,PKD1L1	IMR90	Hi-C	24141950	HUS1	758231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.299994762705363
chr7	47482953	47483112	47483033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	534066	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr7	50237139	50237380	50237343	Y	NA	NA	COBL	IMR90	Hi-C	24141950	IKZF1	104340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	50346623	50346926	50346749	Y	IKZF1	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	4903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr7	50350065	50350197	50350095	Y	IKZF1	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	8345	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr7	50356764	50357277	50357031	Y	IKZF1	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	15044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	50423546	50423751	50423603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF1	81826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr7	50426559	50426564	50426562	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF1	84839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	86477	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	50859334	50859716	50859525	Y	NA	GRB10	NA	NA	NA	NA	GRB10	175	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	53791556	53791934	53791745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-14P	359805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	56029737	56030120	56029923	Y	CCT6A,MRPS17,GBAS	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	MRPS17	12225	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	56173322	56173423	56173410	Y	NA	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1467054	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.85856181842141
chr7	57706434	57706786	57706770	Y	ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1534165	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	57710851	57711018	57710972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1538582	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.5531164069388
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	64295695	64295915	64295830	Y	ZNF680	ZNF138,ZNF273	NA	NA	NA	NA	ZNF273	32635	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	64733908	64734317	64734037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF92	102395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr7	65360437	65360759	65360712	Y	NA	VKORC1L1	NA	NA	NA	NA	VKORC1L1	24183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	65613460	65613645	65613556	Y	ASL,ASL	CRCP	NA	NA	NA	NA	CRCP	35869	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	65746929	65747210	65746989	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	78743	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	66015251	66015629	66015440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-124K5.4	58558	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	66783772	66783944	66783858	Y	NA	STAG3L4,PMS2P4	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	17878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	66897123	66897210	66897167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	131229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	70358448	70358664	70358566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-111G14.1	1046580	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	72929530	72929887	72929777	Y	NA	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	4721	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.59310315274362
chr7	75253450	75253956	75253637	Y	POR	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P3	97972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	75291375	75291448	75291402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	74832	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	CCL24,RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	75595933	75596261	75596039	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	25716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	75599122	75599360	75599199	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	22617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.23591569028491
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	75940045	75940212	75940167	Y	NA	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	10184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.27069413882588
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.548215569127418
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr7	77042340	77042746	77042618	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	121846	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2	157760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	84119513	84119698	84119606	Y	NA	SEMA3A	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	342	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	84165433	84165798	84165584	Y	NA	SEMA3A	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	45393	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	84227562	84227721	84227642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	107522	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264273298871067
chr7	84267436	84267624	84267532	Y	NA	NA	SEMA3A	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3A	147396	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	84613691	84613734	84613712	Y	NA	AC074183.4	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	46130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	86563227	86563622	86563425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	123393	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	87482976	87483203	87483077	Y	NA	DBF4,SLC25A40	NA	NA	NA	NA	DBF4	20328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	92264263	92264527	92264407	Y	SAMD9	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	46555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	92340516	92340848	92340839	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	122808	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	92382003	92382200	92382102	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	81597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	92383173	92383232	92383216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	80565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	92437286	92437617	92437517	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	26180	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	92459714	92460134	92460069	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	3663	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	92847144	92847362	92847311	Y	HEPACAM2	HEPACAM2,CCDC132	NA	NA	NA	NA	HEPACAM2	6475	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.611880969581253
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC132	371622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	93930998	93931300	93931121	Y	NA	NA	COL1A2,GNG11	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	90573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	95238124	95238400	95238252	Y	PON1,PON3	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I1	161466	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	95835254	95835261	95835258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	114198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr7	95867967	95868008	95867988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	81451	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr7	96748066	96748124	96748095	Y	NA	ACN9	NA	NA	NA	NA	ACN9	4164	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr7	98383358	98383761	98383522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRAP	89795	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.337995973654457
chr7	98990795	98991133	98991082	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	13131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	99094567	99094648	99094634	Y	NA	PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5	NA	NA	NA	NA	ZNF394	1299	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	99678619	99678725	99678657	Y	NA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	ZNF3	448	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	99942530	99942666	99942614	Y	OR2AE1,ZCWPW1,MEPCE,PILRA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	4999	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	100042030	100042585	100042239	Y	COPS6,EPHB4	MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4	NA	NA	NA	NA	PPP1R35	9842	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	100144720	100144853	100144769	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9886	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	100342957	100343164	100343095	Y	NA	POP7	NA	NA	NA	NA	POP7	41281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr7	101377148	101377442	101377338	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	79517	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr7	101566593	101566799	101566736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	109634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	101585210	101585567	101585389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	128251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr7	101678350	101678537	101678444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	221391	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr7	102452256	102452586	102452421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	64838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	102512857	102513072	102512991	Y	NA	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	NFE4	98897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	102514621	102514825	102514690	Y	NA	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	NFE4	97144	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	NFE4	95350	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr7	102773056	102773346	102773244	Y	NA	RPL19P12,NAPEPLD	ARMC10	IMR90	Hi-C	24141950	RPL19P12	7040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	102941984	102942200	102942104	Y	NA	DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	6115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	102959356	102959407	102959404	Y	PMPCB,DNAJC2	DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PSMC2	23294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	103181471	103181723	103181644	Y	NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A5	96847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	104626890	104627731	104627241	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	23760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	104684659	104684988	104684665	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	33168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	104842983	104843396	104843385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	191492	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr7	105922869	105923204	105923197	Y	NA	NAMPT	NA	NA	NA	NA	NAMPT	1568	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	106089773	106090176	106089868	Y	NAMPT,PIK3CG	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	165001	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.364105740433023
chr7	106209189	106209713	106209400	Y	NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC004917.1	89629	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr7	106209872	106210238	106210055	Y	NA	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC004917.1	89104	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	106304808	106304915	106304862	Y	NA	AC004917.1,CCDC71L	NA	NA	NA	NA	CCDC71L	5366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	106720036	106720145	106720112	Y	NA	PRKAR2B	NA	NA	NA	NA	PRKAR2B	36942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	107476895	107477090	107476948	Y	NA	NA	CBLL1	K562	ChIA-PET	22265404	DLD	52325	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	107554407	107554624	107554481	Y	DLD	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	24992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	110808410	110808626	110808556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	391947	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr7	110849154	110849473	110849333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	351100	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	325972	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	111671285	111671420	111671354	Y	IFRD1,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	173046	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	112414156	112414445	112414299	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	14202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	477184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	1299669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	116699859	116700243	116700052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	107471	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	116793573	116793925	116793605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	201185	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	119269873	119270211	119270042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	275218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	261423	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr7	119300626	119300913	119300840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	244516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	119342265	119342557	119342442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	202872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	119435371	119435694	119435534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	109735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602714849799349
chr7	120644740	120645140	120644839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	55937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254661601815337
chr7	120660854	120661051	120660925	Y	ING3	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	72051	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	120666718	120667076	120666787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	77915	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr7	120724784	120725242	120725000	Y	C7orf58	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	135981	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr7	120841632	120841687	120841660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	192731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.491436541340692
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	121951485	121951902	121951877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P31	367442	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465772351835952
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.36620221722586
chr7	127663304	127663714	127663503	Y	IMPDH1,GCC1,LRRC4	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	318248	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	5.19414663538479
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.937985499065183
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.5437398409507
chr7	128472556	128472915	128472760	Y	NA	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236329362251529
chr7	128473236	128473666	128473355	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	128500948	128501348	128501123	Y	NA	FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	68	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.14024429700143
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	129057225	129057410	129057318	Y	NA	RP11-305M3.2	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	9014	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	129078824	129079119	129078920	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	30613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr7	129084265	129084564	129084426	Y	AHCYL2,FAM40B	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	36054	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.63440616273075
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	130799789	130800044	130799917	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	6854	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	131010342	131010498	131010376	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1-AS	NA	NA	NA	NA	MKLN1-AS	483	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	411440	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	133093379	133093621	133093500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	95212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	133148039	133148314	133148177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	149872	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	135738489	135738866	135738610	Y	NA	AC009784.3	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	36807	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	135748931	135749147	135748963	Y	NA	AC009784.3	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	26526	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	AC009784.3	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	3879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr7	135865911	135866070	135865991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	90238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	137661285	137661695	137661644	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	23118	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr7	137663180	137663556	137663478	Y	CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	21257	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.76307369545989
chr7	139588015	139588387	139588262	Y	JHDM1D,TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	112438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	139589065	139589242	139589174	Y	JHDM1D,TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	113488	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	139615919	139616013	139615969	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	140342	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	140188165	140188433	140188299	Y	NA	MKRN1	NA	NA	NA	NA	MKRN1	10796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr7	140577074	140577378	140577094	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	45186	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	141492164	141492415	141492290	Y	TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	56043	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	142502471	142502881	142502664	Y	TAS2R39,OR9A2,CASP2,EPHB6	PRSS1,TRBJ2-1,TRBJ2-3,TRBJ2-4,TRBJ2-5,TRBJ2-7,TRBV30,EPHB6	NA	NA	NA	NA	TRBV30	6203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.581657285846918
chr7	142554592	142555033	142554706	Y	EPHB6	TRBV30,EPHB6	NA	NA	NA	NA	EPHB6	3800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	142656584	142656908	142656782	Y	NA	KEL	NA	NA	NA	NA	KEL	860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	145492630	145492774	145492702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	961142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr7	148269293	148269443	148269383	Y	NA	AC005229.5	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	6050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392049677052561
chr7	148553939	148554320	148554152	Y	CUL1,EZH2,EZH2	EZH2	NA	NA	NA	NA	EZH2	25093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr7	148637842	148638122	148637883	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.63922796391221
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501493815670248
chr7	148685182	148685277	148685231	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	38456	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	149191913	149192296	149192075	Y	SSPO,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	149193399	149193541	149193458	Y	ZNF467,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.527603582448813
chr7	150651749	150651874	150651812	Y	NA	KCNH2	NA	NA	NA	NA	KCNH2	21529	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.23091061878148
chr7	150691752	150691942	150691795	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542	KCNH2,ATG9B,ABCB8	NA	NA	NA	NA	KCNH2	18349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr7	150705271	150705459	150705364	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542,KCNH2	KCNH2,ATG9B,ABCB8,SLC4A2,CDK5	NA	NA	NA	NA	ATG9B	14127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.27024856155206
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	151806252	151806472	151806362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	85493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720879530925113
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19424613965387
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.20359552975773
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	153105018	153105427	153105361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3B	650184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.47913142520354
chr7	154742897	154743129	154742996	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49665	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	157034052	157034373	157034213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	50990	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	157112606	157112849	157112710	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	13226	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	270529	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	158301130	158301237	158301184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	194283	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	158301829	158302021	158301840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	193499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	158410794	158411171	158410984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	84349	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr7	158603982	158604371	158604316	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	16573	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr7	158988480	158988780	158988594	Y	ESYT2	NA	VIPR2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR60	341211	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr7	158990200	158990517	158990421	Y	ESYT2	NA	VIPR2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR60	342931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373271860214927
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1-AS1,ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1-AS1	47062	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	1736486	1736690	1736554	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	25818	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	2530387	2530737	2530464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-57L11.1	52121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	2583747	2584096	2583960	Y	NA	GS1-57L11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr8	2588091	2588111	2588101	Y	NA	GS1-57L11.1,RP11-134O21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	4100	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	2591169	2591450	2591225	Y	NA	GS1-57L11.1,RP11-134O21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	7178	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.73030795765889
chr8	2704498	2704682	2704590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	120507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	3001693	3001780	3001737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	417702	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	3252665	3252838	3252782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	668674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	6431105	6431496	6431367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	132234	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	6575644	6576065	6575803	Y	MCPH1,AGPAT5	CTD-2541M15.1,AGPAT5	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	11766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	6605896	6606328	6606048	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	42018	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	8648502	8648712	8648579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN23	91054	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	8706541	8706605	8706573	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	42550	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	8939736	8940088	8939838	Y	CLDN23,ERI1,PPP1R3B	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	66996	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	121535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	10589802	10590079	10589941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	105315	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	10634302	10634482	10634369	Y	SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	60912	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	10681939	10682203	10682138	Y	RP1L1	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	13191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	10692830	10693156	10692993	Y	NA	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	2238	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	11286873	11287154	11286982	Y	FAM167A	NA	NA	NA	NA	NA	AF131216.5	83862	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AF131216.5	109876	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	11690057	11690160	11690110	Y	NA	SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB	NA	NA	NA	NA	RP11-297N6.4	31980	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	12608373	12608831	12608472	Y	NA	LONRF1	NA	NA	NA	NA	LONRF1	2751	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	12975583	12975645	12975608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	364001	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	15546823	15547116	15546970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	274099	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	18244410	18244774	18244528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT1	218424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	20055803	20056436	20056187	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	2925	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	20059971	20060332	20060110	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	7093	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	20294602	20294707	20294648	Y	NA	NA	ATP6V1B2	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	135128	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	DOK2,XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	DOK2,XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	21817623	21817860	21817686	Y	NA	DOK2,XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	42443	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.728211480866046
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	22522684	22522941	22522886	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	1720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.655379960630307
chr8	23341447	23341855	23341667	Y	SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37	IMR90	Hi-C	24141950	ENTPD4	28239	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	23366357	23366637	23366467	Y	NA	SLC25A37	SLC25A37,NKX3-1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC25A37	17681	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.718599783810316
chr8	23376409	23376775	23376581	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	7543	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	23385278	23385670	23385399	Y	SLC25A37	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	960	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	23401814	23402175	23401976	Y	TNFRSF10B	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	17496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	25284653	25284746	25284700	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	KCTD9	29246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	25348135	25348483	25348309	Y	CDCA2	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	33622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPYSL2	62455	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr8	27208490	27208766	27208628	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	41491	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	27219305	27219672	27219420	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52306	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.463492604721153
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr8	27221120	27221544	27221428	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	54121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr8	27251047	27251329	27251099	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	84048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	28634516	28634595	28634556	Y	KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	77535	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	28785346	28785716	28785529	Y	NA	INTS9,HMBOX1	NA	NA	NA	NA	HMBOX1	39435	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	28884105	28884486	28884217	Y	HMBOX1,HMBOX1	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	26966	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	28893958	28894419	28894304	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	17033	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	28934607	28934767	28934687	Y	NA	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	23155	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	30580467	30580796	30580574	Y	GSR	GSR,UBXN8	NA	NA	NA	NA	GSR	2647	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.794602205708505
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr8	30907025	30907279	30907152	Y	LOC100507341,TEX15,PURG	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	17708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr8	31115048	31115061	31115052	Y	NA	NA	NRG1	IMR90	Hi-C	24141950	WRN	225731	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	33051592	33051837	33051715	Y	NA	NA	NRG1	IMR90	Hi-C	24141950	FUT10	277103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	33287156	33287526	33287341	Y	NA	FUT10	NA	NA	NA	NA	FUT10	41414	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	33579772	33580017	33579844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	135724	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.73737760064795
chr8	33718252	33718557	33718395	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	2511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.82280844927991
chr8	37643587	37643772	37643645	Y	NA	PROSC,GPR124	NA	NA	NA	NA	GPR124	3878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	37754518	37754975	37754800	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	10	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	37755287	37755548	37755453	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	37757888	37758317	37758017	Y	WHSC1L1,RAB11FIP1	RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	2903	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	37939512	37939733	37939625	Y	NA	ASH2L	ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASH2L	21027	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.89336022240085
chr8	37949268	37949491	37949380	Y	ASH2L,ASH2L	ASH2L	LETM2,WHSC1L1,ASH2L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASH2L	11269	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.408993324049223
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L,STAR	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	38009325	38009705	38009661	Y	NA	ASH2L,STAR,BAG4,LSM1	NA	NA	NA	NA	STAR	2542	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.78569839287847
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	STAR,BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	38217250	38217535	38217393	Y	NA	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	20255	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	38226082	38226528	38226264	Y	TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	WHSC1L1	11262	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	38242599	38242872	38242674	Y	TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	874	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	41448133	41448452	41448288	Y	GOLGA7,GOLGA7,MYST3,AGPAT6	AGPAT6,RP11-360L9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	14246	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	41680611	41680957	41680800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK1	71323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	42748560	42748749	42748647	Y	THAP1,HOOK3	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	669	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	48265920	48266584	48265994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	191427	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	48434780	48435210	48435108	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	67961	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	48853752	48854057	48853918	Y	NA	PRKDC,MCM4	NA	NA	NA	NA	PRKDC	16686	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	49455096	49455307	49455209	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	159946	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	55088607	55088824	55088716	Y	NA	MRPL15	NA	NA	NA	NA	MRPL15	42837	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	33131	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	56764357	56764533	56764371	Y	NA	LYN	LYN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LYN	25839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr8	56831577	56831790	56831640	Y	NA	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	41205	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	56885324	56886256	56885536	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	LYN	94952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	56887750	56888682	56888353	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	95778	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chr8	56919441	56919801	56919730	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	64659	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	57122742	57122884	57122813	Y	NA	PLAG1,CHCHD7	NA	NA	NA	NA	CHCHD7	497	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	59499727	59499886	59499762	Y	UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	36244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.520271632507882
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446103380450666
chr8	61917184	61917283	61917226	Y	CLVS1	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	327847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	62644264	62644344	62644304	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	18917	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4470	54289	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	62937802	62937913	62937858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	312455	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	63051600	63051694	63051612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	426253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	63074544	63074897	63074721	Y	NKAIN3	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4470	449197	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr8	64908546	64908816	64908686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	800502	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	67565254	67565409	67565332	Y	NA	VCPIP1,C8orf44	NA	NA	NA	NA	VCPIP1	12043	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	68499569	68499804	68499684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	245657	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	72757668	72757969	72757918	Y	MSC	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	227883	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	232607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	100789	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-594N15.2	205840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	80216218	80216356	80216290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY1	461742	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546381399286447
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	87104650	87104818	87104755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	248149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	91064955	91065319	91065136	Y	NA	CALB1	NA	NA	NA	NA	CALB1	40384	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	91266668	91266938	91266670	Y	NA	LINC00534	NA	NA	NA	NA	LINC00534	34952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.666825827527011
chr8	91270857	91271013	91270875	Y	NA	LINC00534	NA	NA	NA	NA	LINC00534	39141	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.737823177921776
chr8	91334435	91334635	91334535	Y	CALB1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00534	102719	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr8	92128196	92128480	92128215	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	47772	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	LINC00535	17696	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	95896385	95896691	95896542	Y	NA	CCNE2	NA	NA	NA	NA	CCNE2	10215	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	96102684	96103088	96102778	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	40944	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr8	96197025	96197314	96197170	Y	NA	NA	PLEKHF2,C8orf69	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHF2	52993	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	97171094	97171453	97171221	Y	GDF6	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRB	74409	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	97319675	97319761	97319753	Y	NA	MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	47732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	98032764	98033078	98032931	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	529185	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	98841899	98841938	98841919	Y	POP1	RPS23P1	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	33344	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr8	99952429	99952792	99952702	Y	NA	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	263	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	100461450	100461455	100461453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13B	437956	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	101385316	101385524	101385421	Y	NA	RNF19A	MIR4471	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	38870	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	101512336	101512720	101512423	Y	SPAG1,SPAG1	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD46	57292	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	101773934	101774280	101774106	Y	NA	PABPC1	SNX31,PABPC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	40897	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	43224	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.545935822012622
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	102149452	102149813	102149564	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	66608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	102161878	102162231	102162054	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	54190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382437979996831
chr8	102167003	102167377	102167334	Y	NA	ZNF706	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	49044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	102191448	102191797	102191796	Y	NA	ZNF706	NA	NA	NA	NA	ZNF706	24624	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	103118991	103119275	103119142	Y	UBR5,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	130071	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	103580180	103580591	103580344	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF10	85539	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	103741796	103742226	103742065	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	73519	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	103743323	103743460	103743418	Y	NA	NA	KLF10	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1732A1.1	72285	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1732A1.1,KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	104197283	104197454	104197448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	165992	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	CTHRC1,DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	105523001	105523289	105523222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	75963	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	105598029	105598284	105598149	Y	TM7SF4,LRP12	LRP12	NA	NA	NA	NA	LRP12	968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	105630140	105630377	105630280	Y	TM7SF4,LRP12	LRP12	LRP12	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP12	30888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr8	105655226	105655568	105655399	Y	TM7SF4,LRP12	NA	LRP12	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	55974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	106411260	106411358	106411309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	82340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chr8	106511726	106511821	106511774	Y	ZFPM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	182806	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	106582164	106582354	106582260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	253244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	106764019	106764032	106764026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152P17.2	306720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	107054607	107054687	107054647	Y	OXR1	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	16065	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	108317294	108317670	108317585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	609053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	108322581	108322730	108322655	Y	ANGPT1	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	614340	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	110324960	110325029	110324995	Y	NA	ENY2,NUDCD1	NA	NA	NA	NA	ENY2	19524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	111947421	111947490	111947466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-946L20.2	90172	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	117664503	117664654	117664532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112088	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	117744101	117744355	117744228	Y	NA	UTP23,EIF3H	NA	NA	NA	NA	UTP23	32387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	120656261	120656532	120656398	Y	NA	NA	ENPP2	IMR90	Hi-C	24141950	TAF2	186571	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	121798029	121798317	121798256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	342387	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	19539	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr8	124179869	124179997	124179932	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	9203	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347607670710187
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.409438901323049
chr8	124337288	124337362	124337325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX1	51507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	124642629	124642836	124642770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO32	91183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	124934433	124934622	124934528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	155737	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	125210059	125210285	125210207	Y	FAM91A1,TMEM65,RNF139	ARF1P3,FER1L6-AS2	TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FER1L6-AS2	28296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	80121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	125304968	125305098	125305033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	77835	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	125357334	125357543	125357438	Y	NA	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	25390	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	125641743	125642346	125642067	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	92044	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	125642565	125642695	125642641	Y	NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	92866	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	125800819	125800856	125800837	Y	NSMCE2,KIAA0196	RP11-1082L8.4	MTSS1,ZNF572	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1082L8.4	25068	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr8	126346161	126346547	126346354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	94016	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	126541064	126541373	126541286	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	100501	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	126650987	126651167	126651050	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	210424	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	126834397	126834705	126834582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	393834	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	126959086	126959931	126959629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	518523	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	126960349	126960744	126960558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	519786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr8	126961175	126961554	126961350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	520612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.319218156816823
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.446548957724492
chr8	128203137	128203490	128203390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	542190	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.572491166065013
chr8	128948050	128948240	128948055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	72617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	128961875	128962320	128962073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	58537	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	128973364	128973763	128973565	Y	MYC	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	47094	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.720433953651289
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	29.9492891168891
chr8	129062971	129063389	129063062	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	42114	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	129942288	129942645	129942469	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	747840	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	130249950	130250353	130250013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	440132	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	130279904	130280064	130280038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	410421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr8	130281342	130281797	130281625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	408688	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr8	130284402	130285105	130284786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	405380	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.436937260668762
chr8	130289872	130290097	130289985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	400388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	130315048	130315337	130315217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	375148	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr8	130354241	130354379	130354310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	336106	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	130397226	130397477	130397352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	293008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr8	130430686	130431090	130430988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	259395	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr8	130461810	130462206	130462131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	228279	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr8	130490796	130491097	130490948	Y	FAM49B	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	199388	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	130491194	130491466	130491330	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	199019	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	130527947	130528435	130528154	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	162050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	130548053	130548359	130548185	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	142126	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	130549847	130550267	130550199	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	140218	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	130550763	130551187	130550985	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	139298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	130551362	130551920	130551554	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	138565	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	130555161	130555312	130555221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	135173	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	130557757	130558027	130557844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	132458	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr8	130558328	130558659	130558367	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	131826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr8	130559153	130559435	130559226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	131050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	130560066	130560288	130560191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	130197	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr8	130564282	130564581	130564416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	125904	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chr8	130566236	130566665	130566321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	123820	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr8	130573431	130573829	130573545	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	116656	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chr8	130577240	130577439	130577294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	113046	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.274330573200623
chr8	130579946	130580358	130579974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	110127	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr8	130584178	130584343	130584235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	106142	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.737823177921776
chr8	130594185	130594451	130594334	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	96034	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr8	130594464	130594915	130594680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	95570	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.57387975863216
chr8	130595168	130595596	130595537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	94889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465772351835952
chr8	130595828	130596191	130596024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	94294	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	130596435	130596809	130596519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC26	93676	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	130697904	130698138	130698105	Y	NA	CCDC26	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	7419	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	130702467	130702491	130702479	Y	NA	CCDC26	PVT1,MYC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC26	11982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	130703284	130703457	130703434	Y	NA	CCDC26	PVT1,MYC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC26	12799	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.04023580556331
chr8	130704918	130705264	130705078	Y	NA	CCDC26	PVT1,MYC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC26	14433	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.564713638850256
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	CCDC26	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC26	29856	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.482270421558787
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	131012344	131012436	131012358	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	14939	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	131089372	131089764	131089568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	61997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	131114299	131114376	131114317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	86924	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	131364558	131364729	131364627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	89177	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	131549189	131549211	131549200	Y	NA	NA	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	95283	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	133846055	133846325	133846220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	60437	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	134315401	134315895	134315622	Y	ST3GAL1	NDRG1,CTC-458A3.1	TG,NDRG1,ST3GAL1	IMR90	Hi-C	24141950	NDRG1	3136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	134387761	134388081	134387916	Y	NA	ST13P6	TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	30168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	MIR30D	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	27302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	140830815	140831120	140830968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK9	117516	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	141358966	141359028	141358983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	107650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.236774939525355
chr8	142031986	142032097	142032042	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	21671	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	142247795	142248221	142248078	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	68183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr8	142411426	142411896	142411690	Y	DENND3,SLC45A4,PTP4A3	PTP4A3	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	11333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.19450844660574
chr8	142412543	142413026	142412776	Y	DENND3,SLC45A4	PTP4A3	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	12450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.4747552012959
chr8	142413850	142414371	142414167	Y	DENND3,SLC45A4	PTP4A3	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	13757	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	142424633	142425265	142424919	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	24540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.76532153726749
chr8	142425618	142425919	142425790	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.382883557270657
chr8	142426003	142426250	142426062	Y	PTP4A3	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25910	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.16559431880863
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	144032047	144032423	144032233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6E	64976	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.22308123082106
chr8	144629463	144629732	144629564	Y	SPATC1,GRINA	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,TIGD5,EEF1D	NA	NA	NA	NA	GSDMD	3645	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.702547291361305
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	144950990	144951185	144951055	Y	C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.291274220197285
chr8	145129247	145129547	145129402	Y	GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH	PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN	DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOSC4	1982	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr8	145995593	145996127	145996081	Y	COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34	ZNF251,ZNF34,RPL8	NA	NA	NA	NA	ZNF34	14603	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	226208	226591	226300	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	13354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	272218	272419	272366	Y	DOCK8,C9orf66,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	59364	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	274563	274801	274706	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	61709	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr9	278768	279182	278781	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	65914	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	442373	442547	442460	Y	NA	KANK1	NA	NA	NA	NA	KANK1	25744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	642151	642448	642253	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	173860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	969561	969923	969742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	501270	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	4340074	4340431	4340362	Y	NA	NA	GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	PPAPDC2	319867	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	4544914	4545090	4545003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	115208	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr9	5965964	5966267	5966115	Y	NA	KIAA2026,RANBP6	NA	NA	NA	NA	KIAA2026	39634	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	6384866	6385180	6385056	Y	NA	UHRF2	NA	NA	NA	NA	UHRF2	25971	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465326774562126
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1976149	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	9.28680520026567
chr9	13034069	13034552	13034397	Y	NA	NA	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	243037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	13268477	13268830	13268663	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	8759	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-408A13.2	207130	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.401661374108291
chr9	14533478	14534091	14533689	Y	NFIB	RP11-408A13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-408A13.2	3438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	16662784	16663109	16662968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P12	1137103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.336161803813485
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313922	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313456	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	21696721	21697113	21696912	Y	IFNA8	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	313041	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	27437731	27437950	27437841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	89829	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	27512798	27513102	27512950	Y	NA	MOB3B	NA	NA	NA	NA	MOB3B	14677	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chr9	33375284	33375639	33375462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQP3	69970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	34179799	34180083	34180009	Y	UBE2R2,UBAP1	UBAP1,AL353662.2,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	2796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1,SIT1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	35914292	35914707	35914657	Y	NA	NDUFA5P4	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P4	41101	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.18324585003099
chr9	35924357	35924707	35924422	Y	NA	YBX1P10	NA	NA	NA	NA	YBX1P10	45608	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328384276598727
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr9	37859471	37859543	37859507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	60037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	128887	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	44878013	44878153	44878083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1B1	6487352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1997612	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	68299584	68299663	68299624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	153712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	68377347	68377469	68377407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	75906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	68436364	68436652	68436508	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	16723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	6.01946523342417
chr9	71393578	71393897	71393631	Y	FAM122A	FAM122A	NA	NA	NA	NA	FAM122A	614	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	71634884	71635015	71634950	Y	PIP5K1B	FXN	NA	NA	NA	NA	FXN	13160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.48410459139976
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	71790550	71790929	71790586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	56341	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	71795556	71796114	71795819	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	61347	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	72344996	72345326	72345161	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	27549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	72801648	72801771	72801710	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	70166	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.73991965471462
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.709879241302237
chr9	73100288	73100509	73100429	Y	KLF9	NA	SMC5,KLF9,TRPM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF9	72748	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr9	80559906	80560072	80560021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	84302	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	86044941	86045010	86044976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	275499	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	86238855	86239256	86239056	Y	UBQLN1,GKAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	81253	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	88286391	88286647	88286519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	68297	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	88294983	88295025	88294997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	59919	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	90133886	90134005	90133888	Y	NA	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	4212	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	90279667	90279982	90279701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	141450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	90407699	90408115	90407854	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179553	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr9	90425634	90425952	90425875	Y	CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	161716	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.281662523141555
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.14820509453814
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	94662459	94662552	94662493	Y	ROR2	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	47892	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.730491227980845
chr9	94668024	94668724	94668369	Y	ROR2	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	41720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.611880969581253
chr9	95029374	95029660	95029516	Y	NA	IARS	NA	NA	NA	NA	IARS	24378	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	95845794	95846166	95845981	Y	NINJ1,C9orf89	SUSD3,C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	10334	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	95878204	95878686	95878424	Y	IPPK,PHF2,FAM120A,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	15884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	96919415	96919512	96919464	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	19604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.19469171692769
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	7.28895405000485
chr9	97631649	97631973	97631839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	144666	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.02087429363048
chr9	98642406	98642593	98642483	Y	PTCH1,PTCH1,C9orf102	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	6147	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	99171138	99171308	99171256	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	3572	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.484550168673584
chr9	100265790	100266140	100265924	Y	HEMGN,ANP32B,TMOD1,TMOD1	TMOD1	NA	NA	NA	NA	TMOD1	4328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chr9	100454693	100454853	100454773	Y	TSTD2,XPA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	100696898	100697242	100697085	Y	NA	C9orf156,HEMGN,ANP32B	NA	NA	NA	NA	HEMGN	7896	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chr9	100705742	100706039	100705791	Y	NA	C9orf156,HEMGN,ANP32B	NA	NA	NA	NA	HEMGN	604	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.583937032961716
chr9	100743401	100743685	100743451	Y	NA	HEMGN	NA	NA	NA	NA	ANP32B	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	HEMGN,ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347162093436361
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	101013285	101013628	101013443	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	2287	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	101081243	101081884	101081560	Y	GABBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	65328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.310052037034919
chr9	101088730	101088899	101088782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	72815	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.510214358178326
chr9	101136906	101136938	101136922	Y	ANKS6	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	120991	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr9	101554135	101554384	101554323	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	2863	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	101572840	101572995	101572898	Y	GALNT12	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	GALNT12	4859	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	101630117	101630425	101630271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT12	62136	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chr9	101836611	101836660	101836639	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	27660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	8.39088296835966
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	101883874	101884261	101884068	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	19554	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	102121085	102121193	102121133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC61B	138739	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	102195698	102196356	102196027	Y	TGFBR1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NA	SEC61B	213352	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	105248809	105248820	105248818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF20	954676	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.948488350668565
chr9	106761923	106761996	106761959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	92545	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	107640582	107640899	107640765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-217B7.3	111163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	RP11-217B7.3	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-217B7.3	3350	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	108284643	108284789	108284719	Y	NA	FKTN	NA	NA	NA	NA	FKTN	33622	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	111872786	111872983	111872905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	98977	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	111880224	111880422	111880303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	106415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	114678571	114678728	114678577	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	21525	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chr9	114825806	114826033	114825918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	109655	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	114835497	114835862	114835756	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	99826	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr9	114857747	114857987	114857843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	77701	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	115258728	115258879	115258816	Y	SNX30,SUSD1,ROD1	KIAA1958,C9orf147	NA	NA	NA	NA	C9orf147	11244	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	115606684	115606763	115606738	Y	ZFP37	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	95566	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	115982258	115982474	115982402	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	FKBP15,SLC31A1	NA	NA	NA	NA	SLC31A1	450	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	116450183	116450673	116450525	Y	BSPRY,ZNF618	NA	WDR31,BSPRY,ZNF618	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF618	185889	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	117135053	117135760	117135486	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	129970	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	118496415	118496674	118496563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	950907	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	119228607	119228748	119228704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	218833	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	119722130	119722198	119722164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	274549	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	123283577	123283819	123283724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	56629	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	123635278	123635355	123635317	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2251	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.5962216814597
chr9	123877856	123878087	123877972	Y	NA	CNTRL	NA	NA	NA	NA	CNTRL	42715	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	124034360	124034626	124034492	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	51068	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	124035384	124035709	124035520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	52092	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	125956223	125956395	125956307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72460	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	126003896	126004111	126004004	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	24744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.283496692982527
chr9	126102323	126102736	126102675	Y	NA	CRB2	RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CRB2	13713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chr9	126169211	126169592	126169399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRB2	52762	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	126419320	126419718	126419519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	270713	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	126630393	126630526	126630439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	59905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	127001580	127001742	127001674	Y	DENND1A,NEK6,NEK6	NEK6	NEK6,DENND1A	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	16143	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	127267013	127267383	127267321	Y	NR5A1	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB7	91290	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr9	127468042	127468336	127468195	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	49296	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	127861290	127861583	127861437	Y	NA	SCAI	NA	NA	NA	NA	SCAI	42202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	127943373	127943395	127943384	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	6823	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.947151618847087
chr9	128408655	128409172	128408692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	58341	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	129525777	129525955	129525866	Y	FAM125B	ZBTB43	LMX1B,FAM125B	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB43	39330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	MIR3911,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	MIR3911	10531	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.501048238396422
chr9	130590782	130591142	130590862	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	CDK9,FPGS,AK1	NA	NA	NA	NA	FPGS	35906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.465772351835952
chr9	130624524	130625072	130624605	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,SLC25A25,CDK9	AK1,ST6GALNAC6	NA	NA	NA	NA	AK1	12950	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	130834970	130835273	130835056	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	6485	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	130844598	130844860	130844677	Y	NA	SLC25A25,NAIF1,PTGES2	NA	NA	NA	NA	NAIF1	16113	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr9	131007254	131007504	131007363	Y	URM1,CERCAM,FPGS,FPGS,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	SWI5	28154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr9	131645612	131645749	131645679	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1	NA	NA	NA	NA	CCBL1	2839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	131900982	131901116	131901071	Y	ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	CRAT	29514	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.92881937928328
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	3.04429064132762
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.0213198709043
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.26864952277871
chr9	132757819	132758165	132758070	Y	TOR1B,FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	45308	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	132949592	132949704	132949653	Y	C9orf78	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	16735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr9	133711348	133711666	133711497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	101007	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	91219	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chr9	133733743	133734142	133733821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	78531	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	134144427	134144727	134144559	Y	NUP214,FAM78A	FAM78A,PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	FAM78A	5207	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	134150177	134150420	134150245	Y	RAPGEF1,RAPGEF1,QRFP,FAM78A	FAM78A,PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	FAM78A	243	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	134157961	134158264	134158112	Y	NA	FAM78A,PPAPDC3	NUP214,FAM78A,PPAPDC3,PRRC2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAPDC3	4817	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	134206310	134206319	134206315	Y	NA	PPAPDC3	NUP214,PRRC2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAPDC3	43229	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.50403586973691
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr9	134608249	134608835	134608704	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	4626	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	134773213	134773507	134773412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	159752	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	134774819	134775116	134774968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	161358	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	135859677	135859806	135859740	Y	GBGT1,GFI1B	TSC1,GFI1B,EEF1A1P5,GTF3C5	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P5	33010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chr9	135874626	135874957	135874785	Y	TSC1,GFI1B	EEF1A1P5,GTF3C5	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P5	17859	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr9	135878294	135878662	135878488	Y	NA	EEF1A1P5,GTF3C5	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P5	14154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.437382837942587
chr9	135879554	135879828	135879691	Y	GFI1B	EEF1A1P5,GTF3C5	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P5	12988	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	135991045	135991361	135991245	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	45940	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	135999727	136000118	136000091	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	37183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	136012982	136013095	136013034	Y	RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	24206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.264718876144893
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	136075454	136075720	136075558	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	GBGT1	38122	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	136282042	136282102	136282072	Y	NA	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	878	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	138778583	138778765	138778659	Y	KCNT1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	18309	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	138847769	138847991	138847872	Y	UBAC1	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	3235	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	138851660	138852030	138851974	Y	UBAC1	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	434	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	4.55754449159211
chr9	138852334	138852387	138852361	Y	CARD9	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	1108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	138967800	138968094	138967985	Y	NOTCH1,CARD9,NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	17037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chr9	139123667	139124081	139124003	Y	SEC16A,NOTCH1,CARD9	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	11606	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ,CARD9	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chr9	139406218	139406717	139406552	Y	TRAF2,FAM69B,EGFL7,EGFL7	SEC16A,NOTCH1,RP11-611D20.2	SEC16A,C9orf163	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	NOTCH1	31597	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.347162093436361
chr9	139434156	139434495	139434364	Y	FUT7,NACC2,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	3819	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.219831292528693
chr9	139539341	139539721	139539606	Y	CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,EGFL7,EGFL7	EGFL7,MIR126,AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EGFL7	11587	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	139540454	139540544	139540487	Y	FAM69B,EGFL7,EGFL7	EGFL7,MIR126,AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EGFL7	10764	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chr9	139540778	139541198	139541031	Y	NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7	EGFL7,MIR126,AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EGFL7	10110	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.37657365925296
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,C8G	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chr9	139858882	139858961	139858922	Y	NA	FBXW5,C8G,C9orf142,CLIC3	NA	NA	NA	NA	C8G	21184	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	139919787	139920355	139920165	Y	NA	C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1,ENTPD2,UAP1L1	NA	NA	NA	NA	ABCA2	1012	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	22.9266335385647
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	RNF208	3555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.893543492722807
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.328829853872553
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chr9	140341522	140341675	140341601	Y	EHMT1,ANAPC2,NELF	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NOXA1	25720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL41	54881	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619658496796012
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.300440339979189
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chrX	1600679	1600951	1600851	Y	CSF2RA,CSF2RA,IL3RA,SLC25A6,ASMTL,ASMTL,ASMT,AKAP17A,P2RY8	ASMTL	NA	NA	NA	NA	ASMTL	30024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	1624162	1624284	1624173	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,IL3RA,SLC25A6,ASMTL,ASMTL,ASMT,AKAP17A,P2RY8	NA	NA	NA	NA	NA	ASMTL	53507	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chrX	3591324	3591658	3591618	Y	NA	PRKX	NA	NA	NA	NA	PRKX	37991	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	3618234	3618487	3618337	Y	NA	PRKX	NA	NA	NA	NA	PRKX	11162	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.62819576898213
chrX	9320763	9320959	9320875	Y	TBL1X,TBL1X	NA	TBL1X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1X	108376	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chrX	10133570	10133893	10133819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	151968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chrX	10143530	10143844	10143687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	161928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	11061735	11061767	11061751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120D5.1	65494	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	11158305	11158560	11158458	Y	ARHGAP6	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	30884	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chrX	11359316	11359697	11359568	Y	MSL3,MSL3,HCCS	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	231895	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chrX	11360130	11360328	11360210	Y	MSL3	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	232709	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	11368234	11368298	11368266	Y	ARHGAP6	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	240813	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	11430955	11431077	11431016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	250744	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chrX	11441273	11441771	11441607	Y	ARHGAP6	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	240050	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.254661601815337
chrX	11444012	11444192	11444085	Y	ARHGAP6	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	237629	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	11444311	11444864	11444622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	236957	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.16349784201579
chrX	11455735	11455931	11455831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP6	225890	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555101941794526
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	12969360	12969905	12969572	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	21322	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chrX	12974854	12975280	12975169	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	15947	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chrX	12980169	12980547	12980403	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	10680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.86559955610327
chrX	13318186	13318365	13318276	Y	NA	GS1-600G8.5	NA	NA	NA	NA	GS1-600G8.5	1206	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.529437752289786
chrX	15713039	15713439	15713221	Y	NA	CA5BP1,CA5B	NA	NA	NA	NA	CA5B	8086	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	15874387	15874556	15874498	Y	ZRSR2,AP1S2	AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	3333	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	16492580	16492905	16492740	Y	NA	NA	CTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	CTPS2	236154	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	16680488	16680840	16680664	Y	NA	CTPS2	NA	NA	NA	NA	CTPS2	48219	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	16769633	16769754	16769694	Y	NA	CTPS2,SYAP1,TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	32796	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255107179089163
chrX	16900871	16900973	16900947	Y	TXLNG	RBBP7,RNU4-6P	RBBP7,TXLNG	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU4-6P	9481	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	20281516	20281702	20281609	Y	SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3	RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	1821	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	21097014	21097354	21097128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBTPS2	758400	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	21947998	21948242	21948120	Y	NA	SMS	MBTPS2,SMS	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	8449	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	23971140	23971524	23971479	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	47083	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.9863062912957
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX,ZFX-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFX-AS1	21934	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	POLA1	954415	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEB2	553338	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	30674217	30674586	30674241	Y	NA	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	GK	4741	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	35643916	35644051	35643969	Y	MAGEB16	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15AP40	747247	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.399827204267319
chrX	38729564	38730030	38729639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	70879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	39676098	39676409	39676231	Y	NA	GAPDHP1	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	30708	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	39714493	39714779	39714604	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	69103	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	39729530	39729742	39729629	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	84140	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.764875959993662
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.84865590910661
chrX	39949495	39949781	39949700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84801	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.619212919522186
chrX	39961698	39961932	39961714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	72650	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.318772579542997
chrX	39963356	39963613	39963579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70969	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.345327923595389
chrX	39964938	39965503	39965246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69079	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.9436984547943
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.546381399286447
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.602714849799349
chrX	40011614	40011816	40011787	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	22766	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.182275658853425
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.503327985511221
chrX	40026864	40027458	40027209	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7124	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.227163242469625
chrX	40031344	40032243	40032130	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	2339	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.53014563651548
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.2244698233882
chrX	40132742	40132979	40132844	Y	ATP6AP2	NA	BCOR	K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	98160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chrX	40691770	40692090	40691930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	73147	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	40692126	40692324	40692241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	72913	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	40693990	40694519	40694253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	70718	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	40869399	40869667	40869505	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	73221	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.273884995926797
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.518437462666909
chrX	41301456	41301878	41301579	Y	NA	NA	DDX3X	K562	ChIA-PET	22265404	DDX3X	110805	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC2	311830	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.373717437488753
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	32007	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	44173548	44173763	44173665	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	27155	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	DUSP21,KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chrX	45241202	45241396	45241250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	362298	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	110636	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	46125056	46125409	46125233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	172740	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	149964	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	46338861	46339028	46338937	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	40712	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	47423323	47423681	47423373	Y	CDK16,CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	4807	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	WAS,SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	48646841	48647202	48647168	Y	GATA1	GATA1,HDAC6	NA	NA	NA	NA	GATA1	3879	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.309606459761093
chrX	48648070	48648274	48648122	Y	SSX3,SLC38A5,MAGIX,GATA1,HDAC6	GATA1,HDAC6	NA	NA	NA	NA	GATA1	5108	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.241151163433
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chrX	48794332	48794681	48794452	Y	PORCN,TBC1D25,WAS,PQBP1,TFE3,PPP1R3F,FOXP3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1	NA	NA	NA	NA	OTUD5	18967	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chrX	48794892	48795256	48795094	Y	TBC1D25,WAS,PQBP1,WDR45,TFE3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1	NA	NA	NA	NA	OTUD5	18392	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	48938465	48938570	48938518	Y	NA	TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW	NA	NA	NA	NA	PRAF2	8735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.736932023374125
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.846821739265636
chrX	49108550	49108714	49108667	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	15592	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.81982081793942
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	53172968	53173150	53172985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01155	51641	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	SMC1A	18996	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chrX	64815346	64815780	64815481	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	9089	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.418605021104953
chrX	65207808	65208088	65207980	Y	MSN	RP6-159A1.3,MIR223	NA	NA	NA	NA	RP6-159A1.3	9505	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chrX	65217824	65218221	65218055	Y	MSN	RP6-159A1.3,MIR223	MSN	K562	ChIA-PET	22265404	RP6-159A1.3	231	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.14865067181197
chrX	65225187	65225542	65225503	Y	NA	RP6-159A1.3,MIR223	NA	NA	NA	NA	RP6-159A1.3	7594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.983764237229034
chrX	65266695	65267020	65266908	Y	NA	RP6-159A1.3,MIR223	VSIG4	K562	ChIA-PET	22265404	MIR223	29983	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	67728770	67728923	67728861	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	12605	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	67905691	67905742	67905716	Y	STARD8	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40183	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40441	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.993375934284763
chrX	67916240	67916349	67916315	Y	STARD8	NA	NA	NA	NA	NA	STARD8	50732	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.51938047796023
chrX	69386644	69386665	69386655	Y	NA	IGBP1	NA	NA	NA	NA	IGBP1	35345	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.392495254326388
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.172663961797695
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.12070673519243
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	71785357	71785413	71785385	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	5540	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	73228588	73229157	73228689	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	66429	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245495482033433
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPRT	468902	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	79828855	79829064	79828956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	234123	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	1.2929251197163
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chrX	100634638	100634773	100634713	Y	NA	TIMM8A,BTK,RPL36A,GLA,HNRNPH2	NA	NA	NA	NA	BTK	4410	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chrX	100640143	100640167	100640158	Y	NA	TIMM8A,BTK,RPL36A,GLA,HNRNPH2	NA	NA	NA	NA	BTK	960	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	BTK,RPL36A,GLA,HNRNPH2	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.555993096342178
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	106917022	106917635	106917444	Y	NA	PRPS1	TSC22D3,PRPS1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	47285	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.92245762051992
chrX	106928255	106928525	106928381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	58518	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.245941059307259
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	106985108	106985412	106985307	Y	TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	33160	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	109315579	109315956	109315731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	71720	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chrX	109382352	109382583	109382468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	138493	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	109652365	109652712	109652527	Y	NA	AMMECR1	TMEM164	MCF7	ChIA-PET	22265404	AMMECR1	28749	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.118164681125764
chrX	115004721	115004876	115004807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	69590	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	115239457	115239782	115239623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	304326	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	117374682	117375070	117374690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR44	102966	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	117487110	117487426	117487273	Y	DOCK11,WDR44	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	9074	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127776378181494
chrX	117499894	117500112	117500003	Y	NA	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	21858	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	118149361	118149839	118149621	Y	LONRF3	LONRF3	NA	NA	NA	NA	LONRF3	42780	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chrX	118819274	118819809	118819515	Y	UBE2A,UBE2A,SEPT6	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	5524	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	118824830	118825236	118824917	Y	UBE2A,UBE2A,SEPT6	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	97	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chrX	119619289	119619732	119619620	Y	ZBTB33,ZBTB33	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18069	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	119619980	119620335	119620161	Y	NA	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18760	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.51485288903784
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.181830081579598
chrX	120720651	120720690	120720671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	958646	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.758435164600383
chrX	123606177	123606254	123606218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	514115	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.255552756362989
chrX	123796301	123796431	123796368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	704239	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	124193844	124193851	124193848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	1101782	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	2.84323716563656
chrX	127434305	127434453	127434370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	1221024	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.136942497963399
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.127330800907668
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chrX	129216343	129216741	129216485	Y	SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	25950	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	129218658	129218852	129218759	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	23839	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	129226171	129226435	129226352	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	16256	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1	NA	NA	NA	NA	AIFM1	9468	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	130013053	130013179	130013116	Y	NA	ENOX2	NA	NA	NA	NA	ENOX2	22029	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	130706744	130706880	130706830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	175067	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	131159301	131159695	131159439	Y	RAP2C,MBNL3,MST4,MST4	MST4	NA	NA	NA	NA	MST4	4008	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chrX	132323332	132323559	132323446	Y	HS6ST2,USP26,GPC4	RNU1-115P	NA	NA	NA	NA	RNU1-115P	47285	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	135917972	135918329	135918167	Y	NA	RBMX	NA	NA	NA	NA	RBMX	42594	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	138002307	138002505	138002406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	300434	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.191441778635329
chrX	138215503	138215737	138215513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	87202	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	138295647	138295844	138295757	Y	NA	FGF13	FGF13	MCF7	ChIA-PET	22265404	FGF13	7095	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.201053475691059
chrX	139521736	139522104	139521978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	496301	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	139589403	139589691	139589600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	563968	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	149737740	149738101	149737940	Y	MTMR1,MTM1	MTM1	NA	NA	NA	NA	MTM1	2671	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.210219595472963
chrX	150347417	150347568	150347539	Y	GPR50	GPR50	NA	NA	NA	NA	GPR50	4292	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNMA3	95010	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	152419706	152420032	152419849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEA1	64083	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	152812807	152812922	152812865	Y	SLC6A8	NA	NA	NA	NA	NA	FAM58A	50578	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.10899856134386
chrX	153389356	153389701	153389458	Y	ARHGAP4,RENBP,IKBKG,IKBKG,IKBKG,MECP2	MECP2	TKTL1,MECP2,NAA10,RENBP,HCFC1,FLNA,RPL10,DNASE1L1	IMR90,MCF7,HELA,K562,GM12878	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	MECP2	28144	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.200607898417233
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.290828642923459
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.146554195019129
chrX	153946199	153946375	153946299	Y	TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3	GAB3,DKC1	NA	NA	NA	NA	GAB3	31483	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	153947503	153948058	153947921	Y	TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3	GAB3,DKC1	NA	NA	NA	NA	GAB3	29800	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	153966358	153966689	153966450	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3	GAB3,DKC1	CTAG2	IMR90	Hi-C	24141950	GAB3	11169	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	154023434	154023601	154023487	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1	GAB3,DKC1,MPP1	NA	NA	NA	NA	MPP1	23681	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.05449928067193
chrX	154029933	154030114	154030065	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1	DKC1,MPP1	NA	NA	NA	NA	MPP1	17168	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643
chrX	154030534	154030629	154030574	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1	DKC1,MPP1	NA	NA	NA	NA	MPP1	16653	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0636654004538343
chrX	155157070	155157446	155157240	Y	NA	VAMP7	NA	NA	NA	NA	VAMP7	48114	CAGE	K562 ENCODE	hg19	FANTOM5	0.0732770975095643